這款解謎遊戲的開發者是"自然規律"
幾天前,Nature上登出了一篇生物學論文,內容主要是關於De novo蛋白質的結構。在文章的作者一欄,除了來自各個國家科研團隊的科學家之外,還有一個引人注目的名字——“Foldit的玩家們”。
這篇論文的標題是“由公民科學家設計的De novo蛋白質”,論文的成果來自於一款十幾年前被開發出來的多人線上遊戲“Foldit”。
“Foldit的玩家們”是這篇論文的第十五作者
Foldit是華盛頓大學計算機系和生物學系在2008年聯合開發出的“實驗性科學遊戲”,目的是藉助大量玩家們的力量,找到可能存在的未知蛋白質結構——這是一項沒什麼捷徑、但也並不困難的純計算工作。
生物學家們已經通過大量實驗解明瞭蛋白質結構的基本原理,只有符合這些原理的蛋白質才能正常存活,進而構成生物;但是蛋白質極為複雜,從基本原理倒推出所有可能存在的蛋白質結構需要大量的計算——預測蛋白質的結構是生物化學領域追求的最重要目標之一,在醫學和生物學上都有著極其重要的意義。
蛋白質預測的流程圖
Foldit從本質上來說是一款解謎類遊戲,玩家們在遊戲中要解開的謎題就是“所有正確的蛋白質結構組合”。遊戲教程會說明怎樣的蛋白質才是正確的,而玩家們要發揮創意和想象力把蛋白質的各個部分拼起來,拼得越接近正確蛋白質,玩家獲得的分數就越多。Foldit的玩法簡單易懂,幾乎不需要生物學知識,趣味性也不差——畢竟,Foldit可能是迄今為止開發陣容最豪華、謎題最多的解謎遊戲,它的開發者與其說是科學家們,不如說是自然規律本身。
Foldit的玩家們幾乎永遠不可能通關這款解謎遊戲,但這並沒有妨礙到他們的熱情。2010年,開發者公佈說,有大約57000名玩家提供的結構組合要優於預測軟體的模擬;一年後,一群玩家用了10天時間協助解讀了一種病毒蛋白酶的晶體結構,這是艾滋病毒在細胞中複製、繁殖的關鍵——由於算力不足,這個問題已經懸置了15年。
十幾年來,Foldit已經形成了自己的玩家社群。在遊戲的玩家論壇中,有新手入門,有心得分享,有Bug反饋。人們在這裡討論著“用繫帶將蛋白質限制在球體中”或者“解析黃麴黴素的另一種可能方法”這樣的話題,就像其他遊戲的玩家在論壇裡談論副本攻略、遊戲技巧和配裝心得一樣。
如果把那些難懂的化學名詞想象成其他遊戲中的黑話,這裡就和一個普通的遊戲論壇沒有任何區別。
Foldit論壇的帖子列表(機翻)
Foldit的意義不僅在於遊戲本身,它還啟發了更多的生物學研究者,讓他們也開始利用玩家群體輔助研究。其中最出名的類似研究,就是《星戰前夜(EVE online)》的“探索計劃”——玩家可以在EVE裡玩一個內建小遊戲,鑑定、分類1300萬個人體細胞蛋白質染色圖,獲得遊戲內貨幣的獎勵;上線僅兩年,就有30萬玩家參與其中,完成了3300萬個影象分類,這些成果都被上傳到了公開的人類蛋白圖譜資料庫之中,可供全世界的科學家使用。
EVE的內建小遊戲
“為了科學研究而遊戲”現在已經不是一個多麼新潮的概念了。我們曾經介紹過多款用於幫助科研或公益目的的遊戲,有看上去還不錯的,也有很多不怎麼樣的——它們大多是某些科學家一時興起的嘗試,很快就被放棄,也沒法得出太多有價值的科學成果,Foldit則完全不同。
Foldit運營了十幾年,還在不斷更新——改進介面、簡化操作、增加更多玩法,上一次更新就在幾周之前。在Nature上搜尋Foldit,能得出55篇文章,絕大部分都是引用Foldit成果的生物學論文。
在可預見的未來,Foldit還會給生物學家提供源源不斷的研究資料。你可以點選文末“閱讀原文”,在Foldit的官網下載這款遊戲,遊戲支援Windows、OSX和Linux系統——也許有一天,你也可以聲稱“我玩遊戲玩成了Nature論文的作者”。
作者:跳跳
來源:遊戲研究社
原地址:https://mp.weixin.qq.com/s/FRdt5r6ezYb-NfyZ6Mi8xw
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