開源地址
https://github.com/miso-lims/miso-lims
github加速可使用：https://kfqbvpat.fast-github.tk/-----https://github.com/miso-lims/miso-lims
專案簡介
適用於NGS基因測序醫院檢驗實驗室，當前大量的新冠核酸檢測機構，倒是可以試一試。
開源協議是GPL3.0。
MISO是Managing Information for Sequencing Operations的縮寫，是適用於基因測試實驗室的LIMS。
由 Earlham Institute 和 Ontario Institute for Cancer Research釋出。
Earlham Institute 2010年開發，然後開源，然後OICR選擇其作為自己的LIMS，並參與到開發團隊中，系統提供的DEMO等也是基於OICR LIMS專案。
技術架構
後端服務使用Java，Groovy（使用JVM虛擬機器的動態語言，專案中用於公式指令碼的編寫等配置性功能的實現）。
使用spring，並沒有使用springboot，部署war包可使用Tomcat 8等中介軟體部署。（Tomcat8以上版本的相容性需要測試驗證調整）
前端使用js\css，未使用vue、react等現代前端技術。
資料庫使用mysql 5.7及以上。(5.7以上版本的相容性需要測試驗證調整）
安裝部署
可以使用docker部署，或使用傳統的Tomcat中介軟體部署。
docker映象下載地址：https://hub.docker.com/u/misolims
war包下載地址：https://kfqbvpat.fast-github.tk/-----https://github.com/miso-lims/miso-lims/releases
嚐鮮可先下載官方docker映象跑個容器看看，深入學習還是要下載war包並部署，最終如果部署自己的環境，可打war包或做docker映象。
安裝、編譯嚮導：https://miso-lims.readthedocs.io/projects/docs/en/latest/admin/installation-guide/
系統概述
兩個功能模式：Plain sample mode （簡單樣品模式） 和Detailed sample mode（詳細樣品模式），detailed模式包含了plain模式。
預設賬號資訊：admin\admin。
簡單樣品模式使用者手冊：https://miso-lims.github.io/walkthroughs/index-plain
詳細樣品模式使用者手冊：https://miso-lims.github.io/walkthroughs/
demo演示、學習（按習慣稱作miso學院\味噌學院）：https://github.com/miso-lims/walkthroughs
https://oicr.on.ca/該癌症研究機構為學習案例，培訓資料（training workshop）連結地址：
https://kfqbvpat.fast-github.tk/-----https://github.com/miso-lims/miso-training-external。
開發或使用者可加入討論組（當然得英文討論），https://gitter.im/miso-lims/community
關鍵元件
儀器資料採集（儀器報告檔案資料採集）
https://github.com/miso-lims/runscanner
https://kfqbvpat.fast-github.tk/-----https://github.com/miso-lims/runscanner
同多數lims系統解決方案一致，部分儀器（例如Illumina、PACBIO、OXFORDNANOPORE）的資料採集方式是通過採集儀器輸出的資料包告檔案，然後解析其中的內容，間接達到採集儀器資料的目的。
使用JDK11和Tomcat8、9，jsoncpp和c++。
該儀器資料採集服務做得很完善，不同於其他lims元件或一個Windows服務、簡單應用程式，其實現為一個web系統，做資料檔案的採集、解析，以及過程的監控。
監控使用 Prometheus，現在伺服器、資料庫等的監控使用 Prometheus很不錯。
賽默飛VisionMate讀碼器TCP/IP介面訪問
https://kfqbvpat.fast-github.tk/-----https://github.com/miso-lims/visionmate-client
賽默飛的VisionMate高速讀碼器的TCP/IP客戶端，Java實現。
