前面我們講到頻繁項集挖掘的關聯演算法Apriori和FP Tree。這兩個演算法都是挖掘頻繁項集的。而今天我們要介紹的PrefixSpan演算法也是關聯演算法,但是它是挖掘頻繁序列模式的,因此要解決的問題目標稍有不同。
1. 項集資料和序列資料
首先我們看看項集資料和序列資料有什麼不同,如下圖所示。
左邊的資料集就是項集資料,在Apriori和FP Tree演算法中我們也已經看到過了,每個項集資料由若干項組成,這些項沒有時間上的先後關係。而右邊的序列資料則不一樣,它是由若干資料項集組成的序列。比如第一個序列<a(abc)(ac)d(cf)>,它由a,abc,ac,d,cf共5個項集資料組成,並且這些項有時間上的先後關係。對於多於一個項的項集我們要加上括號,以便和其他的項集分開。同時由於項集內部是不區分先後順序的,為了方便資料處理,我們一般將序列資料內所有的項集內部按字母順序排序。
2. 子序列與頻繁序列
瞭解了序列資料的概念,我們再來看看上面是子序列。子序列和我們數學上的子集的概念很類似,也就是說,如果某個序列A所有的項集在序列B中的項集都可以找到,則A就是B的子序列。當然,如果用嚴格的數學描述,子序列是這樣的:
對於序列A={$a_1,a_2,...a_n$}和序列B={$b_1,b_2,...b_m$},$n \leq m$,如果存在數字序列$1 \leq j_1 \leq j_2 \leq ... \leq j_n \leq m$, 滿足$a_1 \subseteq b_{j_1}, a_2 \subseteq b_{j_2}...a_n \subseteq b_{j_n} $,則稱A是B的子序列。當然反過來說, B就是A的超序列。
而頻繁序列則和我們的頻繁項集很類似,也就是頻繁出現的子序列。比如對於下圖,支援度閾值定義為50%,也就是需要出現兩次的子序列才是頻繁序列。而子序列<(ab)c>是頻繁序列,因為它是圖中的第一條資料和第三條序列資料的子序列,對應的位置用藍色標示。
3. PrefixSpan演算法的一些概念
PrefixSpan演算法的全稱是Prefix-Projected Pattern Growth,即字首投影的模式挖掘。裡面有字首和投影兩個詞。那麼我們首先看看什麼是PrefixSpan演算法中的字首prefix。
在PrefixSpan演算法中的字首prefix通俗意義講就是序列資料前面部分的子序列。比如對於序列資料B=<a(abc)(ac)d(cf)>,而A=<a(abc)a>,則A是B的字首。當然B的字首不止一個,比如<a>, <aa>, <a(ab)> 也都是B的字首。
看了字首,我們再來看字首投影,其實字首投影這兒就是我們的字尾,有字首就有字尾嘛。字首加上字尾就可以構成一個我們的序列。下面給出字首和字尾的例子。對於某一個字首,序列裡字首後面剩下的子序列即為我們的字尾。如果字首最後的項是項集的一部分,則用一個“_”來佔位表示。
下面這個例子展示了序列<a(abc)(ac)d(cf)>的一些字首和字尾,還是比較直觀的。要注意的是,如果字首的末尾不是一個完全的項集,則需要加一個佔位符。
在PrefixSpan演算法中,相同字首對應的所有字尾的結合我們稱為字首對應的投影資料庫。
4. PrefixSpan演算法思想
現在我們來看看PrefixSpan演算法的思想,PrefixSpan演算法的目標是挖掘出滿足最小支援度的頻繁序列。那麼怎麼去挖掘出所有滿足要求的頻繁序列呢。回憶Aprior演算法,它是從頻繁1項集出發,一步步的挖掘2項集,直到最大的K項集。PrefixSpan演算法也類似,它從長度為1的字首開始挖掘序列模式,搜尋對應的投影資料庫得到長度為1的字首對應的頻繁序列,然後遞迴的挖掘長度為2的字首所對應的頻繁序列,。。。以此類推,一直遞迴到不能挖掘到更長的字首挖掘為止。
比如對應於我們第二節的例子,支援度閾值為50%。裡面長度為1的字首包括<a>, <b>, <c>, <d>, <e>, <f>,<g>我們需要對這6個字首分別遞迴搜尋找各個字首對應的頻繁序列。如下圖所示,每個字首對應的字尾也標出來了。由於g只在序列4出現,支援度計數只有1,因此無法繼續挖掘。我們的長度為1的頻繁序列為<a>, <b>, <c>, <d>, <e>,<f>。去除所有序列中的g,即第4條記錄變成<e(af)cbc>
現在我們開始挖掘頻繁序列,分別從長度為1的字首開始。這裡我們以d為例子來遞迴挖掘,其他的節點遞迴挖掘方法和D一樣。方法如下圖,首先我們對d的字尾進行計數,得到{a:1, b:2, c:3, d:0, e:1, f:1,_f:1}。注意f和_f是不一樣的,因為前者是在和字首d不同的項集,而後者是和字首d同項集。由於此時a,d,e,f,_f都達不到支援度閾值,因此我們遞迴得到的字首為d的2項頻繁序列為<db>和<dc>。接著我們分別遞迴db和dc為字首所對應的投影序列。首先看db字首,此時對應的投影后綴只有<_c(ae)>,此時_c,a,e支援度均達不到閾值,因此無法找到以db為字首的頻繁序列。現在我們來遞迴另外一個字首dc。以dc為字首的投影序列為<_f>, <(bc)(ae)>, <b>,此時我們進行支援度計數,結果為{b:2, a:1, c:1, e:1, _f:1},只有b滿足支援度閾值,因此我們得到字首為dc的三項頻繁序列為<dcb>。我們繼續遞迴以<dcb>為字首的頻繁序列。由於字首<dcb>對應的投影序列<(_c)ae>支援度全部不達標,因此不能產生4項頻繁序列。至此以d為字首的頻繁序列挖掘結束,產生的頻繁序列為<d><db><dc><dcb>。
同樣的方法可以得到其他以<a>, <b>, <c>, <e>, <f>為字首的頻繁序列。
5. PrefixSpan演算法流程
下面我們對PrefixSpan演算法的流程做一個歸納總結。
輸入:序列資料集S和支援度閾值$\alpha$
輸出:所有滿足支援度要求的頻繁序列集
1)找出所有長度為1的字首和對應的投影資料庫
2)對長度為1的字首進行計數,將支援度低於閾值$\alpha$的字首對應的項從資料集S刪除,同時得到所有的頻繁1項序列,i=1.
3)對於每個長度為i滿足支援度要求的字首進行遞迴挖掘:
a) 找出字首所對應的投影資料庫。如果投影資料庫為空,則遞迴返回。
b) 統計對應投影資料庫中各項的支援度計數。如果所有項的支援度計數都低於閾值$\alpha$,則遞迴返回。
c) 將滿足支援度計數的各個單項和當前的字首進行合併,得到若干新的字首。
d) 令i=i+1,字首為合併單項後的各個字首,分別遞迴執行第3步。
6. PrefixSpan演算法小結
PrefixSpan演算法由於不用產生候選序列,且投影資料庫縮小的很快,記憶體消耗比較穩定,作頻繁序列模式挖掘的時候效果很高。比起其他的序列挖掘演算法比如GSP,FreeSpan有較大優勢,因此是在生產環境常用的演算法。
PrefixSpan執行時最大的消耗在遞迴的構造投影資料庫。如果序列資料集較大,項數種類較多時,演算法執行速度會有明顯下降。因此有一些PrefixSpan的改進版演算法都是在優化構造投影資料庫這一塊。比如使用偽投影計數。
當然使用大資料平臺的分散式計算能力也是加快PrefixSpan執行速度一個好辦法。比如Spark的MLlib就內建了PrefixSpan演算法。
不過scikit-learn始終不太重視關聯演算法,一直都不包括這一塊的演算法整合,這就有點落伍了。
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