3倍提升效率:醫療病理資訊抽取與關係圖譜展示系統解析

思通数科發表於2024-11-22

一、專案背景

醫療行業內的病理報告包含大量的文字資料,通常包含對不同人體部位的詳細描述(如頭顱、內臟等),每個部位可能涉及多個檢查專案及結果。這些資訊目前大多以非結構化的文字形式存在,不便於資料分析、統計和快速檢索。為了提升病理資訊的利用效率,客戶希望能夠將病理報告進行結構化處理,並透過關係圖譜的形式展示,便於醫生及研究人員更直觀地獲取關鍵資訊。

二、專案目標

  1. 資訊抽取:使用NLP技術從病理報告中抽取出對應的人體部位資訊及其描述項,例如:

患者:性別 -男 ,年齡 - 58

頭顱:毛髮分佈 - 分佈均勻,外形 - 無畸形

肝臟:大小 -正常,質地 -堅實,無硬結

鼻子:鼻腔 -通暢 ,鼻中隔 -居中

  1. 資料結構化:將從文字中抽取出的資訊進行結構化儲存,形成標準化的資料格式(如JSON、資料庫)。

  2. 關係圖譜展示:利用Echarts等視覺化工具,將結構化資訊以關係圖譜的形式展示。不同的人體部位以節點表示,各節點之間的檢查專案和描述以邊進行連線,形成清晰的病理資訊關係圖譜。

  3. 多條件檢索:支援使用者根據多個條件(如檢查部位、結果描述等)進行檢索,快速定位到特定的病理資訊。

  4. 圖表互動功能:支援使用者點選圖譜中的節點或邊,檢視詳細的病理描述,進行深度分析。

三、技術棧

  1. 程式語言:Python(用於NLP演算法)、JavaScript(用於前端展示)、Java(查詢相關業務邏輯處理)

  2. NLP框架:Python Transformers(HuggingFace)

  3. 資料庫:MySQL / MongoDB

  4. 前端框架:Vue.js、Echarts

  5. 資料介面:Flask / FastAPI(用於提供資料介面)

四、技術方案

  1. NLP資訊抽取

採用基於深度學習的NLP資訊抽取技術,對醫療文字進行命名實體識別(NER)、關係抽取、情感分析等操作。

訓練專用的醫療病理領域模型,提取特定人體部位及其相關屬性資訊。

可使用現有的開源NLP框架(如Spacy、BERT、RoBERTa)進行微調以適應醫療文字。

  1. 資料儲存

使用關係型資料庫(如MySQL)或NoSQL資料庫(如MongoDB)儲存抽取後的結構化資料,確保資料檢索的效率和靈活性。

資料結構設計以人體部位為基礎,每個部位包含多個屬性欄位(如檢查專案、結果描述等)。

  1. 關係圖譜視覺化

利用Echarts庫進行資料視覺化,將結構化資料以圖譜的形式呈現。

圖譜節點表示不同的人體部位,邊表示檢查專案及描述資訊。

關係圖譜支援互動式操作,使用者可以縮放、拖動、點選節點檢視詳細資訊。

  1. 多條件檢索:

設計多條件檢索介面,允許使用者透過選擇人體部位、檢查專案、結果描述等進行過濾。

檢索結果以高亮的方式在關係圖譜中顯示,方便使用者定位。

五、專案工期

從需求分析到專案上線預計在3-4周的時間,最快2-3周,中定製化開發至少2周時間。

六、預期成果

  1. 資料結構化:病理報告中的關鍵資訊能自動抽取並以結構化的形式儲存,方便後續分析和展示。


  1. 關係圖譜視覺化:透過直觀的圖譜展示,幫助使用者更輕鬆地理解病理資訊的分佈及關聯。

  1. 快速檢索功能:使用者能夠快速根據需求查詢到目標資訊,提高資訊獲取效率。

  1. 資料統計分析:透過結構化資料,便於生成統計報告及進一步的病理資料分析。

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