用scikit-learn和pandas學習線性迴歸

劉建平Pinard發表於2016-10-31

      對於想深入瞭解線性迴歸的童鞋,這裡給出一個完整的例子,詳細學完這個例子,對用scikit-learn來執行線性迴歸,評估模型不會有什麼問題了。

1. 獲取資料,定義問題

    沒有資料,當然沒法研究機器學習啦。:) 這裡我們用UCI大學公開的機器學習資料來跑線性迴歸。

    資料的介紹在這: http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Combined+Cycle+Power+Plant

    資料的下載地址在這: http://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/00294/

    裡面是一個迴圈發電場的資料,共有9568個樣本資料,每個資料有5列,分別是:AT(溫度), V(壓力), AP(溼度), RH(壓強), PE(輸出電力)。我們不用糾結於每項具體的意思。

    我們的問題是得到一個線性的關係,對應PE是樣本輸出,而AT/V/AP/RH這4個是樣本特徵, 機器學習的目的就是得到一個線性迴歸模型,即:

    \(PE = \theta_0 + \theta_1*AT + \theta_2*V + \theta_3*AP + \theta_4*RH\)

    而需要學習的,就是\(\theta_0, \theta_1, \theta_2, \theta_3, \theta_4\)這5個引數。

2. 整理資料

    下載後的資料可以發現是一個壓縮檔案,解壓後可以看到裡面有一個xlsx檔案,我們先用excel把它開啟,接著“另存為“”csv格式,儲存下來,後面我們就用這個csv來執行線性迴歸。

    開啟這個csv可以發現資料已經整理好,沒有非法資料,因此不需要做預處理。但是這些資料並沒有歸一化,也就是轉化為均值0,方差1的格式。也不用我們搞,後面scikit-learn線上性迴歸時會先幫我們把歸一化搞定。

    好了,有了這個csv格式的資料,我們就可以大幹一場了。

3. 用pandas來讀取資料

    我們先開啟ipython notebook,新建一個notebook。當然也可以直接在python的互動式命令列裡面輸入,不過還是推薦用notebook。下面的例子和輸出我都是在notebook裡面跑的。

    先把要匯入的庫宣告瞭:

import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn import datasets, linear_model

    接著我們就可以用pandas讀取資料了:

# read_csv裡面的引數是csv在你電腦上的路徑,此處csv檔案放在notebook執行目錄下面的CCPP目錄裡
data = pd.read_csv('.\CCPP\ccpp.csv')

    測試下讀取資料是否成功:

#讀取前五行資料,如果是最後五行,用data.tail()
data.head()

    執行結果應該如下,看到下面的資料,說明pandas讀取資料成功:

 ATVAPRHPE
0 8.34 40.77 1010.84 90.01 480.48
1 23.64 58.49 1011.40 74.20 445.75
2 29.74 56.90 1007.15 41.91 438.76
3 19.07 49.69 1007.22 76.79 453.09
4 11.80 40.66 1017.13 97.20 464.43

    

4. 準備執行演算法的資料

    我們看看資料的維度:

data.shape

    結果是(9568, 5)。說明我們有9568個樣本,每個樣本有5列。

    現在我們開始準備樣本特徵X,我們用AT, V,AP和RH這4個列作為樣本特徵。

X = data[['AT', 'V', 'AP', 'RH']]
X.head()

    可以看到X的前五條輸出如下:

 ATVAPRH
0 8.34 40.77 1010.84 90.01
1 23.64 58.49 1011.40 74.20
2 29.74 56.90 1007.15 41.91
3 19.07 49.69 1007.22 76.79
4 11.80 40.66 1017.13 97.20

 

    接著我們準備樣本輸出y, 我們用PE作為樣本輸出。

y = data[['PE']]
y.head()

    可以看到y的前五條輸出如下:

 PE
0 480.48
1 445.75
2 438.76
3 453.09
4 464.43

5. 劃分訓練集和測試集

    我們把X和y的樣本組合劃分成兩部分,一部分是訓練集,一部分是測試集,程式碼如下:

from sklearn.cross_validation import train_test_split
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, random_state=1)

    檢視下訓練集和測試集的維度:

print X_train.shape
print y_train.shape
print X_test.shape
print y_test.shape

    結果如下:

(7176, 4)
(7176, 1)
(2392, 4)
(2392, 1)    

   可以看到75%的樣本資料被作為訓練集,25%的樣本被作為測試集。
 
 

6. 執行scikit-learn的線性模型

    終於到了臨門一腳了,我們可以用scikit-learn的線性模型來擬合我們的問題了。scikit-learn的線性迴歸演算法使用的是最小二乘法來實現的。程式碼如下:
from sklearn.linear_model import LinearRegression
linreg = LinearRegression()
linreg.fit(X_train, y_train)

    擬合完畢後,我們看看我們的需要的模型係數結果:

print linreg.intercept_
print linreg.coef_

    輸出如下:

[ 447.06297099]
[[-1.97376045 -0.23229086  0.0693515  -0.15806957]]

    這樣我們就得到了在步驟1裡面需要求得的5個值。也就是說PE和其他4個變數的關係如下:

    \(PE = 447.06297099 - 1.97376045*AT - 0.23229086*V + 0.0693515*AP -0.15806957*RH\)    

7. 模型評價

    我們需要評估我們的模型的好壞程度,對於線性迴歸來說,我們一般用均方差(Mean Squared Error, MSE)或者均方根差(Root Mean Squared Error, RMSE)在測試集上的表現來評價模型的好壞。

    我們看看我們的模型的MSE和RMSE,程式碼如下:

#模型擬合測試集
y_pred = linreg.predict(X_test)
from sklearn import metrics
# 用scikit-learn計算MSE
print "MSE:",metrics.mean_squared_error(y_test, y_pred)
# 用scikit-learn計算RMSE
print "RMSE:",np.sqrt(metrics.mean_squared_error(y_test, y_pred))

    輸出如下:

MSE: 20.0804012021
RMSE: 4.48111606657

    得到了MSE或者RMSE,如果我們用其他方法得到了不同的係數,需要選擇模型時,就用MSE小的時候對應的引數。

    比如這次我們用AT, V,AP這3個列作為樣本特徵。不要RH, 輸出仍然是PE。程式碼如下:

X = data[['AT', 'V', 'AP']]
y = data[['PE']]
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, random_state=1)
from sklearn.linear_model import LinearRegression
linreg = LinearRegression()
linreg.fit(X_train, y_train)
#模型擬合測試集
y_pred = linreg.predict(X_test)
from sklearn import metrics
# 用scikit-learn計算MSE
print "MSE:",metrics.mean_squared_error(y_test, y_pred)
# 用scikit-learn計算RMSE
print "RMSE:",np.sqrt(metrics.mean_squared_error(y_test, y_pred))

     輸出如下:

MSE: 23.2089074701
RMSE: 4.81756239919
    可以看出,去掉RH後,模型擬合的沒有加上RH的好,MSE變大了。

8. 交叉驗證

    我們可以通過交叉驗證來持續優化模型,程式碼如下,我們採用10折交叉驗證,即cross_val_predict中的cv引數為10:
X = data[['AT', 'V', 'AP', 'RH']]
y = data[['PE']]
from sklearn.model_selection import cross_val_predict
predicted = cross_val_predict(linreg, X, y, cv=10)
# 用scikit-learn計算MSE
print "MSE:",metrics.mean_squared_error(y, predicted)
# 用scikit-learn計算RMSE
print "RMSE:",np.sqrt(metrics.mean_squared_error(y, predicted))

     輸出如下:

MSE: 20.7955974619
RMSE: 4.56021901469

    可以看出,採用交叉驗證模型的MSE比第6節的大,主要原因是我們這裡是對所有折的樣本做測試集對應的預測值的MSE,而第6節僅僅對25%的測試集做了MSE。兩者的先決條件並不同。

 

9. 畫圖觀察結果

    這裡畫圖真實值和預測值的變化關係,離中間的直線y=x直接越近的點代表預測損失越低。程式碼如下:

fig, ax = plt.subplots()
ax.scatter(y, predicted)
ax.plot([y.min(), y.max()], [y.min(), y.max()], 'k--', lw=4)
ax.set_xlabel('Measured')
ax.set_ylabel('Predicted')
plt.show()

    輸出的影象如下:

    完整的jupyter-notebook程式碼參看我的Github
    以上就是用scikit-learn和pandas學習線性迴歸的過程,希望可以對初學者有所幫助。  

(歡迎轉載,轉載請註明出處。歡迎溝通交流: liujianping-ok@163.com) 
  
  

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