日前，德國默克（Merck KGaA）宣佈，該公司與Cyclica公司達成授權合作協議，將使用該公司名為Ligand Express的雲端蛋白質組（proteome）篩選平臺加快藥物研發。Ligand Express是一種用人工智慧（AI）輔助的基於分子結構的蛋白質組篩選平臺，用於發現與小分子化合物結合的新靶點。這項合作將幫助德國默克高效率地揭示該公司一系列在研小分子化合物的作用機制，並且評估它們的安全性以及在其它方面的應用。
Cyclica公司是一家致力於利用計算生物物理學和AI技術來加快藥物發現過程的生物技術公司。該公司的雲端Ligand Express平臺以小分子藥物為中心，篩選能夠與這些小分子藥物相結合的所有蛋白靶點。同時利用AI來評估這些小分子藥物對蛋白靶點的影響，並且使用生物資訊學和系統生物學技術將藥物與蛋白的互動關係呈現為影象。這一平臺能夠對小分子化合物進行獨特的全面評估，發現很多預期或意外的藥物-蛋白相互作用。這些資訊可能幫助改善藥物效力，或者預防藥物的副作用。
▲Ligand Express平臺示意圖（圖片來源：Cyclica公司官網）
「我們研發策略的關鍵是以最快速度高效推動具備潛力的化合物的研發過程，」德國默克計算化學和生物學主任 Friedrich Rippmann 先生說：「像 Ligand Express 這樣的 AI 平臺將提高我們對靶點發現的理解，輔助表型篩選和對脫靶效應的評估。」
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「目前的蛋白篩選手段可能需要一年才能完成篩選過程，使用現有手段對多種化合物進行篩選耗時耗力。我們認為使用雲端 AI 輔助技術能夠提高藥物開發過程的效率，」Cyclica 公司總裁兼執行長 Naheed Kurji 先生說：「我們非常高興德國默克能夠利用 Ligand Express 平臺來推動它們發現創新靶點的過程。」
參考資料：
[1] Merck KGaA, Darmstadt, Germany, in Agreement with Cyclica for AI-augmented Screening Platform to Expand Research Capabilities. Retrieved December 11, 2018, from https://www.prnewswire.com/news-releases/merck-kgaa-darmstadt-germany-in-agreement-with-cyclica-for-ai-augmented-screening-platform-to-expand-research-capabilities-801736521.html
[2] Cyclica. Retrieved December 11, 2018, from https://cyclicarx.com/