AlphaFold加速藥物發現的案例 - Kaplan

banq發表於2022-01-25

親眼目睹了 AlphaFold 對加速藥物發現的影響：
一位朋友經營著一家設計抗癌藥物的生物技術初創公司。在之前的工作中，他們發現腫瘤細胞會製造一種蛋白質，與體內的兩種受體結合。只與其中一個結合會抑制腫瘤的生長，但與兩個結合會使腫瘤更快地生長。
 如果他們能設計出一種只與一種受體結合而不與另一種受體結合的新蛋白質，這種突變的蛋白質可能是一種有效的癌症藥物。
在AlphaFold之前，找到這樣的蛋白質需要花費1個月的時間：訂購大量突變的DNA序列，將其插入細胞，過濾那些與一種受體結合但不與另一種受體結合的細胞，並對這些細胞的DNA進行排序。
AlphaFold解開了一個不同的方法：它發現了現有蛋白質和受體的三維結構，這是未知的。透過這個結構和另一個ML模型，他們看到了不同的突變會使結合親和力發生怎樣的變化。這使得他們在8小時內找到了理想的候選藥物。
使用這種新蛋白質的動物試驗很快就會開始。離批准的藥物還有很長的路要走，但看到藥物發現在谷歌的Colab notebook中的神經網路下進行得更快，這令人激動。

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