如何輕鬆做資料治理?開源技術棧告訴你答案

nebulagraph發表於2022-12-27

data-lineage

搭建一套資料治理體系耗時耗力,但或許我們沒有必要從頭開始搞自己的資料血緣專案。本文分享如何用開源、現代的 DataOps、ETL、Dashboard、後設資料、資料血緣管理系統構建大資料治理基礎設施。

後設資料治理系統

後設資料治理系統是一個提供了所有資料在哪、格式化方式、生成、轉換、依賴、呈現和所屬的一站式檢視

後設資料治理系統是所有資料倉儲、資料庫、表、儀表板、ETL 作業等的目錄介面(catalog),有了它,我們就不用在群裡喊“大家好,我可以更改這個表的 schema 嗎?”、 “請問誰知道我如何找到 table-view-foo-bar 的原始資料?”…一個成熟的資料治理方案中的後設資料治理系統,對資料團隊來說非常必要。

資料血緣則是後設資料治理系統眾多需要管理的後設資料之一,例如,某些 Dashboard 是某一個 Table View 的下游,而這個 Table View 又是從另外兩個上游表 JOIN 而來。顯然,應該清晰地掌握、管理這些資訊,去構建一個可信、可控的系統和資料質量控制體系。

資料治理的可行方案

資料治理方案設計

後設資料和資料血緣本質上非常適合採用圖資料建模、圖資料庫。因為資料治理涉及的典型查詢便是面向圖關係的查詢,像“查詢指定元件(即表)的所有 n 度(深度)的資料血緣”就是圖查詢語句 FIND ALL PATH 跑起來的事。從日常大家在論壇、微信群裡討論的查詢和圖建模來看,NebulaGraph 社群很多人在從零開始搭建資料血緣系統,而這些工作看起來大多是在重複造輪子,而且還是不容易造的輪子。

既然如此,前人種樹後人乘涼,這裡我決定搭建一個完備、端到端(不只有後設資料管理)的資料系統,供大家參考解決資料血緣、資料治理問題。這個套資料系統會採用市面上優秀的開源專案,而圖資料庫這塊還是採用大家的老朋友——NebulaGraph。希望對大家能有所啟發,在此基礎之上擁有一個相對完善的圖模型,以及設計精巧、開箱即用的後設資料治理系統。

下面,來看看後設資料治理系統的輪子都需要哪些功能元件:

  • 後設資料抽取
    • 這部分需要從不同的資料棧拉/推資料,像是從資料庫、數倉、Dashboard,甚至是 ETL Pipeline 和應用、服務中搞資料。
  • 後設資料儲存
    • 可以存在資料庫、圖資料庫裡,甚至存成超大的 JSON manifest 檔案都行
  • 後設資料目錄介面系統 Catalog
    • 提供 API / GUI 來讀寫後設資料和資料血緣系統

下圖是整個方案的簡單示意圖:

其中,上面的虛線框是後設資料的來源與匯入、下面的虛線框是後設資料的儲存與展示、發現。

diagram-of-ref-project

開源技術棧

下面,介紹下資料治理系統的每個部分。

資料庫和數倉

為了處理和使用原始和中間資料,這裡一定涉及至少一個資料庫或者數倉。它可以是 Hive、Apache Delta、TiDB、Cassandra、MySQL 或 Postgres。

在這個參考專案中,我們選一個簡單、流行的 Postgres。

✓ 資料倉儲:Postgres

資料運維 DataOps

我們應該有某種 DataOps 的方案,讓 Pipeline 和環境具有可重複性、可測試性和版本控制性。

在這裡,我們使用了 GitLab 建立的 Meltano

Meltano 是一個 just-work 的 DataOps 平臺,它可以用巧妙且優雅的方式將 Singer 作為 EL 和 dbt 作為 T 連線起來。此外,它還連線到其他一些 dataInfra 實用程式,例如 Apache Superset 和 Apache Airflow 等。

至此,我們又納入了一個成員:

✓ GitOps:Meltano https://gitlab.com/meltano/meltano

ETL 工具

上面我們提到過組合 Singer 與 Meltano 將來自許多不同資料來源的資料 E(提取)和 L(載入)資料目標,並使用 dbt 作為 Transform 的平臺。於是我們得到:

✓ EL:Singer
✓ T: dbt

資料視覺化

在資料之上建立 Dashboard、圖表和表格得到資料的洞察是很符合直覺的,類似大資料之上的 Excel 圖示功能。

Apache Superset 是我很喜歡的開源資料視覺化專案,我準備用它來作為被治理管理的目標之一。同時,還會利用它實現視覺化功能來完成後設資料洞察。於是,

✓ Dashboard:Apache Superset

任務編排(DAG Job Orchestration)

在大多數情況下,我們的 DataOps 作業、任務會演變成需要編排系統的規模,我們可以用 Apache Airflow 來負責這一塊。

✓ DAG:Apache Airflow https://airflow.apache.org/

後設資料治理

隨著越來越多的元件和資料被引入資料基礎設施,在資料庫、表、資料建模(schema)、Dashboard、DAG(編排系統中的有向無環圖)、應用與服務的各個生命週期階段中都將存著海量的後設資料,需要對它們的管理員和團隊進行協同管理、連線和發現。

Linux Foundation Amundsen 是解決該問題的最佳專案之一。 Amundsen 用圖資料庫為事實源(single source of truth)以加速多跳查詢,Elasticsearch 為全文搜尋引擎。它在順滑地處理所有後設資料及其血緣之餘,還提供了優雅的 UI 和 API。 Amundsen 支援多種圖資料庫為後端,這裡我們們用 NebulaGraph

現在的技術棧:

✓ 資料發現:Linux Foundation Amundsen
✓ 全文搜尋:Elasticsearch
✓ 圖資料庫:NebulaGraph

好的,所有元件都齊正了,開始組裝它們吧。

環境搭建與各元件初識

本次實踐的專案方案已開源,你可以訪問 https://github.com/wey-gu/data-lineage-ref-solution 來獲得對應的程式碼。

整個實踐過程,我遵循了儘量乾淨、鼓勵共建的原則。專案預設在一個 unix-like 系統上執行,且聯網和裝有 Docker-Compose。

這裡,我將在 Ubuntu 20.04 LTS X86_64 上執行它,當然在其他發行版或 Linux 版本上應該也沒有問題。

執行一個數倉、資料庫

首先,安裝 Postgres 作為我們的數倉。

這個單行命令會建立一個使用 Docker 在後臺執行的 Postgres,程式關閉之後容器不會殘留而是被清理掉(因為引數--rm)。

docker run --rm --name postgres \
    -e POSTGRES_PASSWORD=lineage_ref \
    -e POSTGRES_USER=lineage_ref \
    -e POSTGRES_DB=warehouse -d \
    -p 5432:5432 postgres

我們可以用 Postgres CLI 或 GUI 客戶端來驗證命令是否執行成功。

DataOps 工具鏈部署

接下來,安裝有機結合了 Singer 和 dbt 的 Meltano。

Meltano 幫助我們管理 ETL 工具(作為外掛)及其所有配置和 pipeline。這些元資訊位於 Meltano 配置及其系統資料庫中,其中配置是基於檔案的(可以使用 GitOps 管理),它的預設系統資料庫是 SQLite。

安裝 Meltano

使用 Meltano 的工作流是啟動一個“meltano 專案”並開始將 E、L 和 T 新增到配置檔案中。Meltano 專案的啟動只需要一個 CLI 命令 meltano init yourprojectname。不過,在那之前,先用 Python 的包管理器 pip 或者 Docker 映象安裝 Meltano,像我示範的這樣:

在 Python 虛擬環境中使用 pip 安裝 Meltano:

mkdir .venv
# example in a debian flavor Linux distro
sudo apt-get install python3-dev python3-pip python3-venv python3-wheel -y
python3 -m venv .venv/meltano
source .venv/meltano/bin/activate
python3 -m pip install wheel
python3 -m pip install meltano

# init a project
mkdir meltano_projects && cd meltano_projects
# replace <yourprojectname> with your own one
touch .env
meltano init <yourprojectname>

或者,用 Docker 容器安裝 Meltano:

docker pull meltano/meltano:latest
docker run --rm meltano/meltano --version

# init a project
mkdir meltano_projects && cd meltano_projects

# replace <yourprojectname> with your own one
touch .env
docker run --rm -v "$(pwd)":/projects \
             -w /projects --env-file .env \
             meltano/meltano init <yourprojectname>

除了知曉 meltano init 之外,最好掌握 Meltano 部分命令,例如 meltano etl 表示 ETL 的執行,meltano invoke <plugin> 來呼叫外掛命令。詳細可以參考它的速查表 https://docs.meltano.com/reference/command-line-interface

Meltano GUI 介面

Meltano 自帶一個基於 Web 的 UI,執行 ui 子命令就能啟動它:

meltano ui

它預設會跑在 http://localhost:5000 上。

針對 Docker 的執行環境,在暴露 5000 埠的情況下執行容器即可。由於容器的預設命令已經是 meltano ui,所以 run 的命令只需:

docker run -v "$(pwd)":/project \
             -w /project \
             -p 5000:5000 \
             meltano/meltano

Meltano 專案示例

GitHub 使用者 Pat Nadolny 在開源專案 singer_dbt_jaffle 中做了很好的示例。他採用 dbt 的 Meltano 示例資料集,利用 Airflow 編排 ETL 任務

不只這樣,他還有利用 Superset 的例子,見 jaffle_superset

前人種樹我們來吃果,按照 Pat Nadolny 的實踐,我們可以這樣地執行資料管道(pipeline):

  • tap-CSV(Singer)從 CSV 檔案中提取資料
  • target-postgres(Singer) 將資料載入到 Postgres
  • dbt 將資料轉換為聚合表或檢視

注意,上面我們已經啟動了 Postgres,可以跳過容器啟動 Postgres 這步。

操作過程是:

git clone https://github.com/pnadolny13/meltano_example_implementations.git
cd meltano_example_implementations/meltano_projects/singer_dbt_jaffle/

meltano install
touch .env
echo PG_PASSWORD="lineage_ref" >> .env
echo PG_USERNAME="lineage_ref" >> .env

# Extract and Load(with Singer)
meltano run tap-csv target-postgres

# Trasnform(with dbt)
meltano run dbt:run

# Generate dbt docs
meltano invoke dbt docs generate

# Serve generated dbt docs
meltano invoke dbt docs to serve

# Then visit http://localhost:8080

現在,我們可以連線到 Postgres 來檢視載入和轉換後的資料預覽。如下所示,截圖來自 VS Code 的 SQLTool。

payments 表裡長這樣子:

搭一個 BI Dashboard 系統

現在,我們的資料倉儲有資料了。接下來,可以試著用下這些資料。

像儀表盤 Dashbaord 這樣的 BI 工具能幫我們從資料中獲得有用的洞察。使用視覺化工具 Apache Superset 可以很容易地建立和管理這些基於資料來源的 Dashboard 和各式各樣的圖表。

本章的重點不在於 Apache Superset 本身,所以,我們們還是複用 Pat Nadolny 的 jaffle_superset 例子。

Bootstrap Meltano 和 Superset

建立一個安裝了 Meltano 的 Python VENV:

mkdir .venv
python3 -m venv .venv/meltano
source .venv/meltano/bin/activate
python3 -m pip install wheel
python3 -m pip install meltano

參考 Pat 的小抄,做一些細微的調整:

克隆 repo,進入 jaffle_superset 專案:

git clone https://github.com/pnadolny13/meltano_example_implementations.git
cd meltano_example_implementations/meltano_projects/jaffle_superset/

修改 meltano 配置檔案,讓 Superset 連線到我們建立的 Postgres:

vim meltano_projects/jaffle_superset/meltano.yml

這裡,我將主機名更改為“10.1.1.111”,這是我當前主機的 IP。如果你是 Windows 或者 macOS 上的 Docker Desktop,這裡不要修改主機名,否則就要和我一樣手動改成實際地址:

--- a/meltano_projects/jaffle_superset/meltano.yml
+++ b/meltano_projects/jaffle_superset/meltano.yml
@@ -71,7 +71,7 @@ plugins:
               A list of database driver dependencies can be found here https://superset.apache.org/docs/databases/installing-database-drivers
     config:
       database_name: my_postgres
-      sqlalchemy_uri: postgresql+psycopg2://${PG_USERNAME}:${PG_PASSWORD}@host.docker.internal:${PG_PORT}/${PG_DATABASE}
+      sqlalchemy_uri: postgresql+psycopg2://${PG_USERNAME}:${PG_PASSWORD}@10.1.1.168:${PG_PORT}/${PG_DATABASE}
       tables:
       - model.my_meltano_project.customers
       - model.my_meltano_project.orders

新增 Postgres 登入的資訊到 .env 檔案:

echo PG_USERNAME=lineage_ref >> .env
echo PG_PASSWORD=lineage_ref >> .env

安裝 Meltano 專案,執行 ETL 任務:

meltano install
meltano run tap-csv target-postgres dbt:run

呼叫、啟動 Superset,這裡注意 ui 不是 meltano 的內部命令,而是一個配置進去的自定義行為(user-defined action):

meltano invoke superset:ui

在另一個命令列終端執行自定義的命令 load_datasources

meltano invoke superset:load_datasources

透過瀏覽器訪問 http://localhost:8088/ 就是 Superset 的圖形介面了:

建立一個 Dashboard

現在,我們站在 Meltano、Postgres 的肩膀上,用 ETL 資料建一個 Dashboard 吧:

點選 + DASHBOARD,填寫儀表盤名稱,再先後點選 SAVE+ CREATE A NEW CHART

在新圖表(Create a new chart)檢視中,選擇圖表型別和資料集。在這裡,我選擇了 orders 表作為資料來源和 Pie Chart 圖表型別:

點選 CREATE NEW CHART 後,在圖表定義檢視中選擇 “status” 的 “Query” 為 “DIMENSIONS”,“COUNT(amount)” 為 “METRIC”。至此,我們們就可以看到每個訂單狀態分佈的餅圖了。

點選 SAVE,系統會詢問應該將此圖表新增到哪個 Dashboard。選擇後,單擊 SAVE & GO TO DASHBOARD

在 Dashboard 中,我們可以看到所有的圖表。這不,你可以看到我額外新增的、用來顯示客戶訂單數量分佈的圖表:

··· 能看到重新整理率設定、下載渲染圖等其他的功能。

現在,我們有一個簡單但典型的 HomeLAB 資料技術棧了,並且所有東西都是開源的!

想象一下,我們在 CSV 中有 100 個資料集,在資料倉儲中有 200 個表,並且有幾個資料工程師在執行不同的專案,這些專案使用、生成不同的應用與服務、Dashbaord 和資料庫。當有人想要查詢、發現或者修改其中的一些表、資料集、Dashbaord 和管道,在溝通和工程方面可能都是非常不好管理的。

上面我們提到,這個示例專案的主要功能是後設資料發現系統

後設資料發現系統

現在,需要我們部署一個帶有 NebulaGraph 和 Elasticsearch 的 Amundsen。有了 Amundsen,我們可以在一個地方發現和管理整個資料棧中的所有後設資料。

Amundsen 主要有兩個部分組成:

它的工作原理是:利用 Databuilder 提取不同資料來源的後設資料,並將後設資料持久化到 Metadata ServiceSearch Service 中,使用者從 Frontend ServiceMetadata Service 的 API 獲取資料。

部署 Amundsen

後設資料服務 Metadata Service

我們用 docker-compose 部署一個 Amundsen 叢集。由於 Amundsen 對 NebulaGraph 後端的支援 pr#1817 尚未合併,還不能用官方的程式碼。這裡,先用我的 fork 版本。

先克隆包含所有子模組的 repo:

git clone -b amundsen_nebula_graph --recursive git@github.com:wey-gu/amundsen.git
cd amundsen

啟動所有目錄服務 catalog services 及其後端儲存:

docker-compose -f docker-amundsen-nebula.yml up

由於這個 docker-compose 檔案是供開發人員試玩、除錯 Amundsen 用的,而不是給生產部署準備的,它在啟動的時候會從程式碼庫構建映象,第一次跑的時候啟動會慢一些。

部署好了之後,我們使用 Databuilder 將一些示例、虛構的資料載入儲存裡。

抓取後設資料 Databuilder

Amundsen Databuilder 就像 Meltano 系統一樣,只不過是用在後設資料的上的 ETL ,它把後設資料載入到 Metadata ServiceSearch Service 的後端儲存:NebulaGraph 和 Elasticsearch 裡。這裡的 Databuilder 只是一個 Python 模組,所有的後設資料 ETL 作業可以作為指令碼執行,也可以用 Apache Airflow 等 DAG 平臺進行編排。

安裝 Amundsen Databuilder

cd databuilder
python3 -m venv .venv
source .venv/bin/activate
python3 -m pip install wheel
python3 -m pip install -r requirements.txt
python3 setup.py install

呼叫這個示例資料構建器 ETL 指令碼來把示例的虛擬資料導進去。

python3 example/scripts/sample_data_loader_nebula.py
驗證一下 Amundsen

在訪問 Amundsen 之前,我們需要建立一個測試使用者:

# run a container with curl attached to amundsenfrontend
docker run -it --rm --net container:amundsenfrontend nicolaka/netshoot

# Create a user with id test_user_id
curl -X PUT -v http://amundsenmetadata:5002/user \
    -H "Content-Type: application/json" \
    --data \
    '{"user_id":"test_user_id","first_name":"test","last_name":"user", "email":"test_user_id@mail.com"}'

exit

然後我們可以在 http://localhost:5000 檢視 UI 並嘗試搜尋 test,它應該會返回一些結果。

然後,可以單擊並瀏覽在 sample_data_loader_nebula.py 期間載入到 Amundsen 的那些示例後設資料。

此外,我們還可以透過 NebulaGraph Studio 的地址 http://localhost:7001 訪問 NebulaGraph 裡的這些資料。

下圖顯示了有關 Amundsen 元件的更多詳細資訊:

       ┌────────────────────────┐ ┌────────────────────────────────────────┐
       │ Frontend:5000          │ │ Metadata Sources                       │
       ├────────────────────────┤ │ ┌────────┐ ┌─────────┐ ┌─────────────┐ │
       │ Metaservice:5001       │ │ │        │ │         │ │             │ │
       │ ┌──────────────┐       │ │ │ Foo DB │ │ Bar App │ │ X Dashboard │ │
  ┌────┼─┤ Nebula Proxy │       │ │ │        │ │         │ │             │ │
  │    │ └──────────────┘       │ │ │        │ │         │ │             │ │
  │    ├────────────────────────┤ │ └────────┘ └─────┬───┘ └─────────────┘ │
┌─┼────┤ Search searvice:5002   │ │                  │                     │
│ │    └────────────────────────┘ └──────────────────┼─────────────────────┘
│ │    ┌─────────────────────────────────────────────┼───────────────────────┐
│ │    │                                             │                       │
│ │    │ Databuilder     ┌───────────────────────────┘                       │
│ │    │                 │                                                   │
│ │    │ ┌───────────────▼────────────────┐ ┌──────────────────────────────┐ │
│ │ ┌──┼─► Extractor of Sources           ├─► nebula_search_data_extractor │ │
│ │ │  │ └───────────────┬────────────────┘ └──────────────┬───────────────┘ │
│ │ │  │ ┌───────────────▼────────────────┐ ┌──────────────▼───────────────┐ │
│ │ │  │ │ Loader filesystem_csv_nebula   │ │ Loader Elastic FS loader     │ │
│ │ │  │ └───────────────┬────────────────┘ └──────────────┬───────────────┘ │
│ │ │  │ ┌───────────────▼────────────────┐ ┌──────────────▼───────────────┐ │
│ │ │  │ │ Publisher nebula_csv_publisher │ │ Publisher Elasticsearch      │ │
│ │ │  │ └───────────────┬────────────────┘ └──────────────┬───────────────┘ │
│ │ │  └─────────────────┼─────────────────────────────────┼─────────────────┘
│ │ └────────────────┐   │                                 │
│ │    ┌─────────────┼───►─────────────────────────┐ ┌─────▼─────┐
│ │    │ NebulaGraph │   │                         │ │           │
│ └────┼─────┬───────┴───┼───────────┐     ┌─────┐ │ │           │
│      │     │           │           │     │MetaD│ │ │           │
│      │ ┌───▼──┐    ┌───▼──┐    ┌───▼──┐  └─────┘ │ │           │
│ ┌────┼─►GraphD│    │GraphD│    │GraphD│          │ │           │
│ │    │ └──────┘    └──────┘    └──────┘  ┌─────┐ │ │           │
│ │    │ :9669                             │MetaD│ │ │  Elastic  │
│ │    │ ┌────────┐ ┌────────┐ ┌────────┐  └─────┘ │ │  Search   │
│ │    │ │        │ │        │ │        │          │ │  Cluster  │
│ │    │ │StorageD│ │StorageD│ │StorageD│  ┌─────┐ │ │  :9200    │
│ │    │ │        │ │        │ │        │  │MetaD│ │ │           │
│ │    │ └────────┘ └────────┘ └────────┘  └─────┘ │ │           │
│ │    ├───────────────────────────────────────────┤ │           │
│ └────┤ Nebula Studio:7001                        │ │           │
│      └───────────────────────────────────────────┘ └─────▲─────┘
└──────────────────────────────────────────────────────────┘

穿針引線:後設資料發現

設定好基本環境後,讓我們把所有東西穿起來。還記得我們有 ELT 一些資料到 PostgreSQL 嗎?

那麼,我們如何讓 Amundsen 發現這些資料和 ETL 的後設資料呢?

提取 Postgres 後設資料

我們從資料來源開始:首先是 Postgres。

我們為 Python3 安裝 Postgres 客戶端:

sudo apt-get install libpq-dev
pip3 install Psycopg2

執行 Postgres 後設資料 ETL

執行一個指令碼來解析 Postgres 後設資料:

export CREDENTIALS_POSTGRES_USER=lineage_ref
export CREDENTIALS_POSTGRES_PASSWORD=lineage_ref
export CREDENTIALS_POSTGRES_DATABASE=warehouse

python3 example/scripts/sample_postgres_loader_nebula.py

我們看看把 Postgres 後設資料載入到 NebulaGraph 的示例指令碼的程式碼,非常簡單直接:

# part 1: PostgresMetadata --> CSV --> NebulaGraph
job = DefaultJob(
      conf=job_config,
      task=DefaultTask(
          extractor=PostgresMetadataExtractor(),
          loader=FsNebulaCSVLoader()),
      publisher=NebulaCsvPublisher())

...
# part 2: Metadata stored in NebulaGraph --> Elasticsearch
extractor = NebulaSearchDataExtractor()
task = SearchMetadatatoElasticasearchTask(extractor=extractor)

job = DefaultJob(conf=job_config, task=task)

第一個工作路徑是:PostgresMetadata --> CSV --> NebulaGraph

第二個工作路徑是:Metadata stored in NebulaGraph --> Elasticsearch

  • NebulaSearchDataExtractor 用於獲取儲存在 NebulaGraph 中的後設資料
  • SearchMetadatatoElasticasearchTask 用於使 Elasticsearch 對後設資料進行索引。

請注意,在生產環境中,我們可以在指令碼中或使用 Apache Airflow 等編排平臺觸發這些作業。

驗證 Postgres 中後設資料的獲取

搜尋 payments 或者直接訪問 http://localhost:5000/table_detail/warehouse/postgres/public/payments,你可以看到我們 Postgres 的後設資料,比如:

像上面的螢幕截圖一樣,我們可以輕鬆完成後設資料管理操作,如:新增標籤、所有者和描述。

提取 dbt 後設資料

其實,我們也可以從 dbt 本身提取後設資料。

Amundsen DbtExtractor 會解析 catalog.jsonmanifest.json 檔案並將後設資料載入到 Amundsen 儲存,這裡當然指的是 NebulaGraph 和 Elasticsearch。

在上面的 Meltano 章節中,我們已經使用 meltano invoke dbt docs generate 生成了這個檔案:

14:23:15  Done.
14:23:15  Building catalog
14:23:15  Catalog written to /home/ubuntu/ref-data-lineage/meltano_example_implementations/meltano_projects/singer_dbt_jaffle/.meltano/transformers/dbt/target/catalog.json

dbt 後設資料 ETL 的執行

我們試著解析示例 dbt 檔案中的後設資料吧:

$ ls -l example/sample_data/dbt/
total 184
-rw-rw-r-- 1 w w   5320 May 15 07:17 catalog.json
-rw-rw-r-- 1 w w 177163 May 15 07:17 manifest.json

我寫的這個示例的載入例子如下:

python3 example/scripts/sample_dbt_loader_nebula.py

其中主要的程式碼如下:

# part 1: dbt manifest --> CSV --> NebulaGraph
job = DefaultJob(
      conf=job_config,
      task=DefaultTask(
          extractor=DbtExtractor(),
          loader=FsNebulaCSVLoader()),
      publisher=NebulaCsvPublisher())

...
# part 2: Metadata stored in NebulaGraph --> Elasticsearch
extractor = NebulaSearchDataExtractor()
task = SearchMetadatatoElasticasearchTask(extractor=extractor)

job = DefaultJob(conf=job_config, task=task)

它和 Postgres 後設資料 ETL 的唯一區別是 extractor=DbtExtractor(),它帶有以下配置以獲取有關 dbt 專案的以下資訊:

  • 資料庫名稱
  • 目錄_json
  • manifest_json
job_config = ConfigFactory.from_dict({
  'extractor.dbt.database_name': database_name,
  'extractor.dbt.catalog_json': catalog_file_loc,  # File
  'extractor.dbt.manifest_json': json.dumps(manifest_data),  # JSON Dumped objecy
  'extractor.dbt.source_url': source_url})

驗證 dbt 抓取結果

搜尋 dbt_demo 或者直接訪問 http://localhost:5000/table_detail/dbt_demo/snowflake/public/raw_inventory_value,可以看到

這裡給一個小提示,其實,我們可以選擇啟用 DEBUG log 級別去看已傳送到 Elasticsearch 和 NebulaGraph 的內容。

- logging.basicConfig(level=logging.INFO)
+ logging.basicConfig(level=logging.DEBUG)

或者,在 NebulaGraph Studio 中探索匯入的資料:

先點選 Start with Vertices,並填寫頂點 vid:snowflake://dbt_demo.public/fact_warehouse_inventory

我們可以看到頂點顯示為粉紅色的點。再讓我們修改下 Expand / ”擴充“選項:

  • 方向:雙向
  • 步數:單向、三步

並雙擊頂點(點),它將雙向擴充 3 步:

像截圖展示的那般,在視覺化之後的圖資料庫中,這些後設資料可以很容易被檢視、分析,並從中獲得洞察。

而且,我們在 NebulaGraph Studio 中看到的同 Amundsen 後設資料服務的資料模型相呼應:

最後,請記住我們曾利用 dbt 來轉換 Meltano 中的一些資料,並且清單檔案路徑是 .meltano/transformers/dbt/target/catalog.json,你可以嘗試建立一個資料構建器作業來匯入它。

提取 Superset 中的後設資料

Amundsen 的 Superset Extractor 可以獲取

來,現在試試提取之前建立的 Superset Dashboard 的後設資料。

Superset 後設資料 ETL 的執行

下邊執行的示例 Superset 提取指令碼可以獲取資料並將後設資料載入到 NebulaGraph 和 Elasticsearch 中。

python3 sample_superset_data_loader_nebula.py

如果我們將日誌記錄級別設定為 DEBUG,我們實際上可以看到這些中間的過程日誌:

# fetching metadata from superset
DEBUG:urllib3.connectionpool:http://localhost:8088 "POST /api/v1/security/login HTTP/1.1" 200 280
INFO:databuilder.task.task:Running a task
DEBUG:urllib3.connectionpool:Starting new HTTP connection (1): localhost:8088
DEBUG:urllib3.connectionpool:http://localhost:8088 "GET /api/v1/dashboard?q=(page_size:20,page:0,order_direction:desc) HTTP/1.1" 308 374
DEBUG:urllib3.connectionpool:http://localhost:8088 "GET /api/v1/dashboard/?q=(page_size:20,page:0,order_direction:desc) HTTP/1.1" 200 1058
...

# insert Dashboard

DEBUG:databuilder.publisher.nebula_csv_publisher:Query: INSERT VERTEX `Dashboard` (`dashboard_url`, `name`, published_tag, publisher_last_updated_epoch_ms) VALUES  "superset_dashboard://my_cluster.1/3":("http://localhost:8088/superset/dashboard/3/","my_dashboard","unique_tag",timestamp());
...

# insert a DASHBOARD_WITH_TABLE relationship/edge

INFO:databuilder.publisher.nebula_csv_publisher:Importing data in edge files: ['/tmp/amundsen/dashboard/relationships/Dashboard_Table_DASHBOARD_WITH_TABLE.csv']
DEBUG:databuilder.publisher.nebula_csv_publisher:Query:
INSERT edge `DASHBOARD_WITH_TABLE` (`END_LABEL`, `START_LABEL`, published_tag, publisher_last_updated_epoch_ms) VALUES "superset_dashboard://my_cluster.1/3"->"postgresql+psycopg2://my_cluster.warehouse/orders":("Table","Dashboard","unique_tag", timestamp()), "superset_dashboard://my_cluster.1/3"->"postgresql+psycopg2://my_cluster.warehouse/customers":("Table","Dashboard","unique_tag", timestamp());

驗證 Superset Dashboard 後設資料

透過在 Amundsen 中搜尋它,我們現在可以獲得 Dashboard 資訊。

我們也可以從 NebulaGraph Studio 進行驗證。

注:可以參閱 Dashboard 抓取指南中的 Amundsen Dashboard 圖建模:

用 Superset 預覽資料

Superset 可以用來預覽表格資料,文件可以參考 https://www.amundsen.io/amundsen/frontend/docs/configuration/#preview-client,其中 /superset/sql_json/ 的 API 被 Amundsen Frontend Service 呼叫,取得預覽資訊。

開啟資料血緣資訊

預設情況下,資料血緣是關閉的,我們可以透過以下方式啟用它:

第一步,cd 到 Amundsen 程式碼倉庫下,這也是我們執行 docker-compose -f docker-amundsen-nebula.yml up 命令的地方:

cd amundsen

第二步,修改 frontend 下的 TypeScript 配置

--- a/frontend/amundsen_application/static/js/config/config-default.ts
+++ b/frontend/amundsen_application/static/js/config/config-default.ts
   tableLineage: {
-    inAppListEnabled: false,
-    inAppPageEnabled: false,
+    inAppListEnabled: true,
+    inAppPageEnabled: true,
     externalEnabled: false,
     iconPath: 'PATH_TO_ICON',
     isBeta: false,

第三步,重新構建 Docker 映象,其中將重建前端影像。

docker-compose -f docker-amundsen-nebula.yml build

第四步,重新執行 up -d 以確保前端用新的配置:

docker-compose -f docker-amundsen-nebula.yml up -d

結果大概長這樣子:

$ docker-compose -f docker-amundsen-nebula.yml up -d
...
Recreating amundsenfrontend           ... done

之後,我們可以訪問 http://localhost:5000/lineage/table/gold/hive/test_schema/test_table1 看到 Lineage (beta) 血緣按鈕已經顯示出來了:

我們可以點選 Downstream 檢視該表的下游資源:

或者點選血緣按鈕檢視血緣的圖表式:

也有用於血緣查詢的 API。

下面這個例子中,我們用 cURL 呼叫下這個 API:

docker run -it --rm --net container:amundsenfrontend nicolaka/netshoot

curl "http://amundsenmetadata:5002/table/snowflake://dbt_demo.public/raw_inventory_value/lineage?depth=3&direction=both"

上面的 API 呼叫是查詢上游和下游方向的 linage,表 snowflake://dbt_demo.public/raw_inventory_value 的深度為 3。

結果應該是這樣的:

{
    "depth": 3,
    "downstream_entities": [
        {
            "level": 2,
            "usage": 0,
            "key": "snowflake://dbt_demo.public/fact_daily_expenses",
            "parent": "snowflake://dbt_demo.public/fact_warehouse_inventory",
            "badges": [],
            "source": "snowflake"
        },
        {
            "level": 1,
            "usage": 0,
            "key": "snowflake://dbt_demo.public/fact_warehouse_inventory",
            "parent": "snowflake://dbt_demo.public/raw_inventory_value",
            "badges": [],
            "source": "snowflake"
        }
    ],
    "key": "snowflake://dbt_demo.public/raw_inventory_value",
    "direction": "both",
    "upstream_entities": []
}

實際上,這個血緣資料就是在我們的 dbtExtractor 執行期間提取和載入的,其中 extractor .dbt.{DbtExtractor.EXTRACT_LINEAGE} 預設為 true,因此,建立了血緣後設資料並將其載入到了 Amundsen。

在 NebulaGraph 中洞察血緣

使用圖資料庫作為後設資料儲存的兩個優點是:

圖查詢本身是一個靈活的 DSL for lineage API,例如,這個查詢幫助我們執行 Amundsen 後設資料 API 的等價的查詢:

MATCH p=(t:`Table`) -[:`HAS_UPSTREAM`|:`HAS_DOWNSTREAM` *1..3]->(x)
WHERE id(t) == "snowflake://dbt_demo.public/raw_inventory_value" RETURN p

來,在 NebulaGraph Studio 或者 Explorer 的控制檯中查詢下:

​渲染下這個結果:

提取資料血緣

這些血緣資訊是需要我們明確指定、獲取的,獲取的方式可以是自己寫 Extractor,也可以是用已有的方式。比如:dbt 的 Extractor 和 Open Lineage 專案的 Amundsen Extractor。

透過 dbt

這個在剛才已經展示過了,dbt 的 Extractor 會從表級別獲取血緣同其他 dbt 中產生的後設資料資訊一起被拿到。

透過 Open Lineage

Amundsen 中的另一個開箱即用的血緣 Extractor 是 OpenLineageTableLineageExtractor

Open Lineage 是一個開放的框架,可以將不同來源的血統資料收集到一個地方,它可以將血統資訊輸出為 JSON 檔案,參見文件 https://www.amundsen.io/amundsen/databuilder/#openlineagetablelineageextractor

下邊是它的 Amundsen Databuilder 例子:

dict_config = {
    # ...
    f'extractor.openlineage_tablelineage.{OpenLineageTableLineageExtractor.CLUSTER_NAME}': 'datalab',
    f'extractor.openlineage_tablelineage.{OpenLineageTableLineageExtractor.OL_DATASET_NAMESPACE_OVERRIDE}': 'hive_table',
    f'extractor.openlineage_tablelineage.{OpenLineageTableLineageExtractor.TABLE_LINEAGE_FILE_LOCATION}': 'input_dir/openlineage_nd.json',
}
...

task = DefaultTask(
    extractor=OpenLineageTableLineageExtractor(),
    loader=FsNebulaCSVLoader())

回顧

整套後設資料治理/發現的方案思路如下:

  • 將整個資料技術棧中的元件作為後設資料源(從任何資料庫、數倉,到 dbt、Airflow、Openlineage、Superset 等各級專案)
  • 使用 Databuilder(作為指令碼或 DAG)執行後設資料 ETL,以使用 NebulaGraph 和 Elasticsearch 儲存和索引
  • 從前端 UI(使用 Superset 預覽)或 API 去使用、消費、管理和發現後設資料
  • 透過查詢和 UI 對 NebulaGraph,我們可以獲得更多的可能性、靈活性和資料、血緣的洞察

涉及到的開源

此參考專案中使用的所有專案都按字典順序在下面列出。

  • Amundsen
  • Apache Airflow
  • Apache Superset
  • dbt
  • Elasticsearch
  • meltano
  • NebulaGraph
  • Open Lineage
  • Singer

謝謝你讀完本文 (///▽///)

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