概念
先說一說基本的概念，這包括什麼是Unicode，什麼是UTF-8，什麼是UTF-16。
Unicode，UTF-8，UTF-16完整的說明請參考Wiki（Unicode，UTF-8，UTF-16）。用比較簡單的話來說就是，Unicode定義了所有可以用來表示字元的數值集合（稱之為Code Point）。UTF-8和UTF-16等UTF標準定義了這些數值和字元的對映關係。
UTF-8
優勢
UTF-8最大的優勢是，沒有位元組序的概念。所以特別適合用於字串的網路資料傳輸，不用考慮大小端問題。對於非英文網頁（對於我們而言，簡單說東亞文字網頁），能夠避免各種亂碼問題。
劣勢
本地字串處理過程中，如果使用UTF-8，對於英文字元的處理沒有太大的問題。一個char變數表示一個英文字元。但是對於中文等遠東字符集來說，就比較坑爹了。char str[]; str[0]並不能完整表示一個漢字。UTF-8編碼格式下，一個漢字需要至少3個char才能表示。這對於透過下標來操作字串的操作來說是非常痛苦的一件事情。
另外，一個漢字需要至少3個char來表示，也讓漢字在網路傳輸上存在劣勢，佔用太多流量（但是如果啟用了壓縮，實際上差別並不大。並且現在很多中文網站都預設將編碼從GBK改成了UTF-8）。
UTF-16
優勢
UTF-16 LE是windows上預設的Unicode編碼方式，使用wchar_t表示。所有wchar_t *型別的字串(包括硬編碼在.h/.cpp裡的字串字面值)，VC都自動採用UTF-16的編碼(字串字面值，literal string，存在很多坑。特別是char *型別的字面值，最終記憶體使用何種編碼方式完全取決於當前檔案的編碼方式。也就是說當前檔案如果是GBK編碼的，那麼檔案裡char * str = "中午"，str指向的記憶體字串二進位制是使用GBK編碼的。如果檔案編碼是UTF-8，那麼記憶體是使用UTF-8編碼。所以為什麼一直要強調字串應該放在資原始檔裡，而不是硬編碼在.h/.cpp檔案裡！)。
UTF-16另外一個優勢就是常用字元都可以使用兩個個位元組表示，也就是一個wchar_t(這裡指Windows平臺)。所以，在Windows平臺上，特別適合使用wchar_t來作為字串的儲存基型別。一個wchar_t表示一個字元。操作使用非常方便。
劣勢
沒有統一的表示UTF-16編碼的字元型別。C++98/03裡對wchar_t的定義是非常寬泛的。這導致在Windows平臺上，wchar_t是2位元組的；在Unix-like系統上是4位元組的。程式碼移植上，可能會遇到挑戰(我沒移植過，所以不確定會有什麼難度，以及難度有多大)。
即使最新的C++11裡已經定義除了char16_t表示UTF-16，MS的VS2013還不支援char16_t。所以目前使用char16_t還不具移植性。
據我瞭解，UTF-16編碼和GBK編碼相比，還存在一個排序的劣勢。也就是說，如果要按照漢語拼音的字母順序對漢字進行排序，GBK會得到正確的結果，而UTF-16就不行(暫時我還沒這種需求，所以我沒驗證過，不過好像我馬上就要與到這種需求了，到時候我再驗證下)。
UTF-16編碼字串的網路傳輸，要考慮大小端的問題。另外網路傳輸中如果一個位元組資訊丟失，剩下的字串都無法正確解析。統統亂碼。
另外，UTF-16並不是定長型別。所以還是存在生僻字使用4個位元組編碼而不是2個位元組（但是Windows有例外。在Windows（NT核心）平臺，從MSDN的各種表述來看，似乎一個wchar_t就是一個字元。更多關於Windows平臺字元編碼的問題參考知乎回答和相關評論）。
UTF-32
優勢
這個優勢就明顯了，所有字元都是4位元組，fix-length。一個wchar_t(Unix-like系統上)表示一個字元。
劣勢
對於以英文為主的字串來說，空間消耗大。
面臨和上面UTF-16一樣的問題。一致性，排序，網路傳輸，資料丟失後無法恢復。char32_t VS2013還不支援（甚至VS 14 CPT也沒打算支援）。
總結
UTF-8最適合用來作為字串網路傳輸的編碼格式。UTF-16最適合當作本地字串編碼格式。如果定義好了網路傳輸協議，那麼UTF-16也非常合適當作網路字串傳輸的編碼格式，特別是中文等遠東地區字符集。比起UTF-8來說，節省一點點流量。UTF-32沒什麼特殊癖好或者需求的話，暫時還用不上。
我個人覺得最佳實踐應該是：
Linux上使用char，採用UTF-8編碼。
網路傳輸使用UTF-8編碼。
Windows上使用wchar_t / char16_t，採用UTF-16編碼。將收到的網路資料統一從UTF-8轉碼到UTF-16。在Windows上應該銘記沒有char / std::string這種型別的字元/字串，只有wchar_t / char16_t / std::wstring / std::u16string。