IBM、微軟聯合白宮部署超級計算機,對抗冠狀病毒

大資料文摘發表於2020-03-23

IBM、微軟聯合白宮部署超級計算機,對抗冠狀病毒

大資料文摘出品

來源:venturebeat、cnbc、ibm

編譯:牛婉楊


在中國疫情爆發時期,我國同眾多科技公司一起抗擊病毒,效果顯著。現在,輪到美國了。


3月22日,川普政府表示,IBM正在與白宮合作,提供大量的超級計算能力,以幫助研究人員制止冠狀病毒的蔓延。


根據IBM研究主管Dario Gil的一份宣告,IBM已與白宮科學技術政策辦公室以及美國能源部合作啟動了COVID-19高效能運算(HPC)聯盟。為研究COVID-19的科學家提供超過330千萬億次(330 petaflops)的計算能力。


超級計算能力將可幫助研究人員開發預測模型,以分析疾病的發展過程並在開發可能的疫苗過程中模擬潛在的治療方法


這些高效能運算系統允許研究人員在流行病學、生物資訊學和分子建模中進行大量的計算。如果手工操作,這些實驗需要數年才能完成,如果在速度較慢的傳統計算平臺上完成,則需要數月時間。


IBM研究總監Dario Gil在宣告中寫道,“我們一直在與美國和世界各國政府密切合作,尋找一切可能的辦法,把我們的技術和專業知識運用到工作中,幫助各組織有能力應對和適應冠狀病毒疫情帶來的影響。”


IBM、微軟聯合白宮部署超級計算機,對抗冠狀病毒


超級計算能力將提供給最有可能產生直接影響的專案 

COVID-19高效能運算(HPC)聯盟將審查來自世界各地的研究計劃,並將超級計算能力提供給最有可能產生直接影響的專案,為研究人員提供技術援助。獲得超級計算能力的團隊可以使用16個系統,這些系統結合了77.5萬個處理器核心和3.4萬個GPU,它們每秒可執行約330千萬億次浮點運算(330 petaflops)。


微軟人工智慧健康專案全球負責人John Kahan表示:“我們要確保致力於對抗COVID-19的研究人員能夠使用他們所需的工具。”“通過人工智慧健康專案,我們已經親眼目睹了利用強大的技術為才華橫溢的研究人員賦能後的影響。我們希望通過擴大對Azure雲和高效能運算功能的訪問,創造與更多資料科學家合作的機會,來幫助加快這項重要工作。”


亞馬遜表示,它將為使用亞馬遜網路服務(AWS)專案的研究機構和公司提供技術支援,以推進COVID-19在診斷、治療和疫苗研究方面的研究。AWS全球公共部門副總裁Teresa Carlson說:“我們很自豪能夠支援這項關鍵的工作,並隨時準備利用AWS的計算能力幫助加速研發工作。”“政府、企業和學術領袖可以共同努力,利用雲的力量來推動科學發現和創新的步伐,並幫助抗擊COVID-19病毒。”


倫斯勒理工學院將把其人工智慧多處理優化系統(AiMOS)計算機部署在倫斯勒計算創新中心(Rensselaer Center For Computational Innovations),與全球第24強超級計算機展開對抗。Rensselaer中心表示,正在接觸研究機構,包括政府機構、大學和業界,為AiMOS提供支援,以支援與COVID-19有關的研究。


谷歌雲全球公共部門副總裁Mike Daniels在一份宣告中說,“我們知道,高效能運算可以減少處理大量資料集和執行復雜模擬所需的時間,從幾天到幾個小時。我們期待著與技術、學術界和公共部門的領導者一起參與這個專案,為COVID-19的研究人員提供更多的資源,並將谷歌雲端計算能力應用於潛在的治療和疫苗的開發。”


目前COVID-19高效能運算(HPC)聯盟包括:白宮科技政策辦公室,美國能源部,麻省理工學院,倫斯勒理工學院,勞倫斯利弗莫爾國家實驗室,阿貢國家實驗室,橡樹嶺國家實驗室,桑迪亞國家實驗室,洛斯阿拉莫斯國家實驗室,美國國家航空航天局(NASA)和美國國家科學基金會,IBM,微軟,谷歌,惠普和亞馬遜。


如果有團隊也想加入,可以通過網站申請,前提是他們必須說明國家實驗室或其他機構的工作人員的支援對他們的專案而言是否是必不可少的,有幫助的還是不必要的,以及是否可能存在任何限制,如專有資料集或HIPAA限制。


IBM、微軟聯合白宮部署超級計算機,對抗冠狀病毒


COVID-19 HPC聯盟:

https://www.xsede.org/covid19-hpc-consortium?mod=article_inline


被寄與厚望的超級計算機,它能夠縮短新藥上市時間嗎?


最近,全球最大的眾包超級計算程式之一Folding@home啟動了一項行動,旨在揭開COVID-19的spike蛋白背後的祕密,這種病毒利用蛋白來感染細胞。據該專案的組織者、華盛頓大學醫學院生物化學和分子生物物理學副教授Greg Bowman介紹,自2月底宣佈將把重點放在冠狀病毒上以來,約有40萬名新志願者加入了這項工作。


長期以來,超級計算機一直被用於識別和測試複雜和慢性疾病的潛在治療方法。研究人員利用德州高階計算中心的Lonestar5叢集來模擬1400多種fda批准的藥物,看看它們是否可以用來治療癌症。去年6月,歐盟挑選了8個超級計算中心來承載個性化醫療和藥物設計方面的應用。製藥公司TwoXAR最近與史丹佛大學亞洲肝臟中心合作,篩選25,000種可能用於治療成人肝癌的藥物。


人們希望超級計算機能夠縮短新藥上市所需的時間。因為藥物從發現到上市至少需要10年的時間,何況在所有進入臨床試驗的藥物中,最終只有不到12%能夠進入藥店。根據美國製藥研究與製造商協會(Pharmaceutical Research and Manufacturers of America)的資料,單是臨床試驗就平均需要六到七年的時間,研發成本因此增加到約26億美元。


美國技術長Michael Kratsios在昨天的新聞中說:“美國正團結起來與COVID-19作戰,這意味著我們要釋放我們的世界級超級計算機的全部能力,以迅速推進治療和疫苗的科學研究。我們感謝私營部門和學術領袖加入聯邦政府,作為美國應對措施的一部分。”


相關報導:

https://venturebeat.com/2020/03/22/ibm-coronavirus-covid-19-supercomputing-consortium/
https://www.cnbc.com/2020/03/22/ibm-and-white-house-to-deploy-supercomputers-to-fight-coronavirus.html
https://newsroom.ibm.com/IBM-helps-bring-supercomputers-into-the-global-fight-against-COVID-19



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