TOP 3大開源Python資料分析工具!

趙鈺瑩發表於2018-08-07

在大資料庫領域,Python是最常被使用的程式語言,因此瞭解與其相關的資料分析工具是很有必要的。如果你正在使用virtualenv、pyenv或其他變體在自己的環境中執行Python,那麼,可以嘗試本文推薦的三大開源工具。

(注:本文示例使用IPython,如果感興趣,請確保已經安裝)

$ mkdir python-big-data
$ cd python-big-data
$ virtualenv ../venvs/python-big-data
$ source ../venvs/python-big-data/bin/activate
$ pip install ipython
$ pip install pandas
$ pip install pyspark
$ pip install scikit-learn
$ pip install scipy

本文選取的示例資料是最近幾天從某網站獲取的實際生產日誌資料,從技術層面來看,這些資料並不能算作是大資料,因為它的大小隻有大約2Mb,但就演示來說已經足夠了。

如果你想獲取這些示例資料,可以使用git從作者的公共GitHub儲存庫中下載:admintome / access-log-data

$ git clone https://github.com/admintome/access-log-data.git

資料是一個簡單的CSV檔案,因此每行代表一個單獨的日誌,欄位用逗號分隔:

2018-08-01 17:10,'www2','www_access','172.68.133.49 - - [01/Aug/2018:17:10:15 +0000] "GET /wp-content/uploads/2018/07/spark-mesos-job-complete-1024x634.png HTTP/1.0" 200 151587 "https://dzone.com/" "Mozilla/5.0 (Macintosh; Intel Mac OS X 10_12_6) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/67.0.3396.99 Safari/537.36"'

以下是日誌行架構:

由於對資料可執行的操作的複雜性不確定,因此本文重點選取載入資料和獲取資料樣本兩個操作來講解三個工具。

1、Python Pandas

我們討論的第一個工具是Python Pandas。正如它的網站所述,Pandas是一個開源的Python資料分析庫。它最初由AQR Capital Management於2008年4月開發,並於2009年底開源,目前由專注於Python資料包開發的PyData開發團隊繼續開發和維護,屬於PyData專案的一部分。Pandas最初被作為金融資料分析工具而開發出來,因此,pandas為時間序列分析提供了很好的支援。 

首先,啟動IPython並對示例資料進行一些操作。(因為pandas是python的第三方庫所以使用前需要安裝一下,直接使用pip install pandas 就會自動安裝pandas以及相關元件)

import pandas as pd
headers = ["datetime", "source", "type", "log"]
df = pd.read_csv('access_logs_parsed.csv', quotechar="'", names=headers)

大約一秒後,我們會收到如下回復:

[6844 rows x 4 columns]
In [3]:

如上所見,我們有大約7000行資料,它從中找到了四個與上述模式匹配的列。

Pandas自動建立了一個表示CSV檔案的DataFrame物件,Pandas中的DataFrame資料既可以儲存在SQL資料庫中,也可以直接儲存在CSV檔案中。接下來我們使用head()函式匯入資料樣本。

In [11]: df.head()
Out[11]:
           datetime source        type                                                log
0  2018-08-01 17:10   www2  www_access  172.68.133.49 - - [01/Aug/2018:17:10:15 +0000]...
1  2018-08-01 17:10   www2  www_access  162.158.255.185 - - [01/Aug/2018:17:10:15 +000...
2  2018-08-01 17:10   www2  www_access  108.162.238.234 - - [01/Aug/2018:17:10:22 +000...
3  2018-08-01 17:10   www2  www_access  172.68.47.211 - - [01/Aug/2018:17:10:50 +0000]...
4  2018-08-01 17:11   www2  www_access  141.101.96.28 - - [01/Aug/2018:17:11:11 +0000]...

使用Python Pandas可以做很多事情, 資料科學家通常將Python Pandas與IPython一起使用,以互動方式分析大量資料集,並從該資料中獲取有意義的商業智慧。

2、PySpark

我們討論的第二個工具是PySpark,該工具來自Apache Spark專案的大資料分析庫。

PySpark提供了許多用於在Python中分析大資料的功能,它自帶shell,使用者可以從命令列執行。

$ pyspark

這會載入pyspark shell:

(python-big-data)[email protected]:~/Development/access-log-data$ pyspark Python 3.6.5 (default, Apr 1 2018, 05:46:30) [GCC 7.3.0] on linux Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. 2018-08-03 18:13:38 WARN Utils:66 - Your hostname, admintome resolves to a loopback address: 127.0.1.1; using 192.168.1.153 instead (on interface enp0s3) 2018-08-03 18:13:38 WARN Utils:66 - Set SPARK_LOCAL_IP if you need to bind to another address 2018-08-03 18:13:39 WARN NativeCodeLoader:62 - Unable to load native-hadoop library for your platform... using builtin-java classes where applicable Setting default log level to "WARN". To adjust logging level use sc.setLogLevel(newLevel). For SparkR, use setLogLevel(newLevel). Welcome to ____ __ / __/__ ___ _____/ /__ _\ \/ _ \/ _ `/ __/ '_/ /__ / .__/\_,_/_/ /_/\_\ version 2.3.1 /_/ Using Python version 3.6.5 (default, Apr 1 2018 05:46:30) SparkSession available as 'spark'. >>>

當你啟動shell時,你會得到一個Web GUI檢視你的工作狀態,只需瀏覽到http:// localhost:4040即可獲得PySpark Web GUI。

讓我們使用PySpark Shell載入示例資料:

dataframe = spark.read.format("csv").option("header","false").option("mode","DROPMALFORMED").option("quote","'").load("access_logs.csv")
dataframe.show()

PySpark提供了已建立的DataFrame示例:

>>> dataframe2.show()
+----------------+----+----------+--------------------+
|             _c0| _c1|       _c2|                 _c3|
+----------------+----+----------+--------------------+
|2018-08-01 17:10|www2|www_access|172.68.133.49 - -...|
|2018-08-01 17:10|www2|www_access|162.158.255.185 -...|
|2018-08-01 17:10|www2|www_access|108.162.238.234 -...|
|2018-08-01 17:10|www2|www_access|172.68.47.211 - -...|
|2018-08-01 17:11|www2|www_access|141.101.96.28 - -...|
|2018-08-01 17:11|www2|www_access|141.101.96.28 - -...|
|2018-08-01 17:11|www2|www_access|162.158.50.89 - -...|
|2018-08-01 17:12|www2|www_access|192.168.1.7 - - [...|
|2018-08-01 17:12|www2|www_access|172.68.47.151 - -...|
|2018-08-01 17:12|www2|www_access|192.168.1.7 - - [...|
|2018-08-01 17:12|www2|www_access|141.101.76.83 - -...|
|2018-08-01 17:14|www2|www_access|172.68.218.41 - -...|
|2018-08-01 17:14|www2|www_access|172.68.218.47 - -...|
|2018-08-01 17:14|www2|www_access|172.69.70.72 - - ...|
|2018-08-01 17:15|www2|www_access|172.68.63.24 - - ...|
|2018-08-01 17:18|www2|www_access|192.168.1.7 - - [...|
|2018-08-01 17:18|www2|www_access|141.101.99.138 - ...|
|2018-08-01 17:19|www2|www_access|192.168.1.7 - - [...|
|2018-08-01 17:19|www2|www_access|162.158.89.74 - -...|
|2018-08-01 17:19|www2|www_access|172.68.54.35 - - ...|
+----------------+----+----------+--------------------+
only showing top 20 rows

我們再次看到DataFrame中有四列與我們的模式匹配,DataFrame此處可以被視為資料庫表或Excel電子表格。

3、Python SciKit-Learn

任何關於大資料的討論都會引發關於機器學習的討論,幸運的是,Python開發人員有很多選擇來使用機器學習演算法。

在沒有詳細介紹機器學習的情況下,我們需要獲得一些執行機器學習的資料,我在本文中提供的示例資料不能正常工作,因為它不是數字型別的資料。我們需要操縱資料並將其呈現為數字格式,這超出了本文的範圍,例如,我們可以按時間對映日誌以獲得具有兩列的DataFrame:一分鐘內的日誌數和當前時間:

+------------------+---+
| 2018-08-01 17:10 | 4 |
+------------------+---+
| 2018-08-01 17:11 | 1 |
+------------------+---+

通過這種形式的資料,我們可以執行機器學習演算法來預測未來可能獲得的訪客數量,SciKit-Learn附帶了一些樣本資料集,我們可以載入一些示例資料,來看一下具體如何運作。

In [1]: from sklearn import datasets
In [2]: iris = datasets.load_iris()
In [3]: digits = datasets.load_digits()
In [4]: print(digits.data)
[[ 0.  0.  5. ...  0.  0.  0.]
 [ 0.  0.  0. ... 10.  0.  0.]
 [ 0.  0.  0. ... 16.  9.  0.]
 ...
 [ 0.  0.  1. ...  6.  0.  0.]
 [ 0.  0.  2. ... 12.  0.  0.]
 [ 0.  0. 10. ... 12.  1.  0.]]

這將載入兩個用於機器學習分類的演算法,用於對資料進行分類。

結論

在大資料領域,Python、R以及Scala是主要的參與者,開源社群中有不少針對這三者的工具,國內網際網路企業一向很喜歡基於開源工具自研,選擇之前不妨做好功課,抽取使用人數較多且應用場景最接近實際需求的方案。


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