SnapGene Viewer for mac分子生物學
今天macz分享的是Mac下一款功能非常強大的分子生物學軟體SnapGene mac,Snapgene,它可以方便教師和專門的學生來分析酶切位點,標籤,啟動子,終止子和複製子等質粒元件,並能知道其具體的序列。這種分子生物學工具可以生成詳細的 DNA 序列檔案,並與同事共享。
SnapGene for mac軟體新增功能
重疊群大會
線性或環狀重疊群可以從重疊序列或Sanger序列跡線重新組裝。
靈活的對齊
現在可以以各種方式匯入要對齊的序列。可以提取多個對齊的一部分以生成新的多重對齊,或者可以編輯現有的多個對齊以新增或移除由不同演算法生成的對齊。
Nicking Enzymes
可以顯示Nicking核酸內切酶。當選擇跨越從線性序列的末端到切口核酸內切酶位點時,可以透過按Delete刪除該單鏈區域。
點特徵
現在,DNA序列支援零長度點功能,並在從GenBank,MacVector或Gene Construction Kit匯入檔案時識別。
酶網站突出顯示
常用的酶位點可以用黃金突出顯示,以便快速識別。
協調一致性增強
多重比對的共識序列具有改進的格式,現在可以複製或匯出。
用於與參考序列對齊的儲存編輯
根據流行的需求,當透過調整比對序列的端點編輯與參考DNA序列的比對時,保留和恢復那些編輯。
從其他檔案格式匯入功能
可以將特徵匯入到BED,GFF3或GTF格式的DNA序列中。
從UniProt匯入
可以從UniProt資料庫匯入蛋白質序列記錄。
進口基因組編譯器專案
現在可以在SnapGene中直接開啟Genome Compiler專案檔案(.gcproj)。對於施工專案檔案,在“歷史記錄”檢視中捕獲施工歷史。
引物新增日期
將引物新增到檔案時,會記錄日期。引物可按新增日期排序。
讀取和寫入對齊檔案格式
SnapGene可以匯入比對以在SAM / BAM和參考序列向量NTI® .cep格式,並且可以比對匯出到SAM / BAM格式的參考序列。
來自 “ ITPUB部落格 ” ,連結:http://blog.itpub.net/69971288/viewspace-2736395/,如需轉載,請註明出處,否則將追究法律責任。
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