001、
#提取比對到參考基因組上的資料 samtools view -b -F 4 lane.sam > lane.bam #提取沒有比對到參考基因組上的資料 samtools view -b -f 4 lane.sam > lane.bam
refrence：
01、
https://blog.csdn.net/u013553061/article/details/53133007/
smtools軟體提取比對到和未比對到參考基因組上的bam資料
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