參考資料：

pandas用法大全

2019-02-26

目標：

將1000G部分過濾，大於0.01部分全部刪除，但是有些沒有收錄的snp會標註為‘.’

遇到的問題：

直接使用下面的命令，則無法過濾，原因出在：該列所有的值格式為str

df.ix[df['1000G_ALL'] < 0.01]

解決的程式碼：

寫個轉化的函式，然後用apply命令

df['1000G_ALL'] = df['1000G_ALL'].apply(lambda x:kitty(x))
df.ix[df['1000G_ALL']<0.01]

可以檢視一下df['1000G_ALL'].apply的幫助檔案，該命令可以傳入引數，解決了之前map的缺陷，eg：

series.apply(subtract_custom_value, args=(5,))
series.apply(add_custom_values, june=30, july=20, august=25)

參考資料：pandas資料型別轉換

目標：

篩選有害位點

解決程式碼

#濾去不帶red字元的列，縮小範圍
df.filter(like='red')
#或指定列過濾
df.filter(items=['SIFT_pred','Polyphen2_HDIV_pred','Polyphen2_HVAR_pred','MutationTaster_pred','CADD_phred'])

目標：

統計某列中'D'的個數，'F'的個數