5️⃣蛋白質的特徵資訊2:訊號肽的預測和識別
序列比對和序列特徵分析總目錄
- 訊號肽signal peptide是新合成多肽鏈中的末端(通常N末端)的氨基酸序列,這個序列可以指導蛋白質的跨膜轉移。
- 訊號肽中包含至少一個帶正電荷的氨基酸和一個高度疏水區以通過細胞膜
- 訊號肽是新生肽鏈分泌到細胞外的訊號也是一些蛋白質在細胞內的定位訊號
- 因為分泌到胞外的蛋白質不含有訊號肽,所以只能從細胞內分離不成熟的肽鏈,進行N末端測序,來了解訊號肽的結構特徵
- 目前發現,訊號肽序列中含較多疏水性氨基酸較多是明顯特徵
訊號肽預測線上工具:SignalP
目前4.1版,通過人工神經網路方法,預測包括革蘭氏陽性菌,革蘭氏陰性菌及真核生物在內的**氨基酸序列訊號肽剪下位點的有無及出現位置。
1 輸入蛋白質序列:FASTA格式
其他引數設定:待續。。。
2 結果
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