Diffbind可以處理bulk ATAC-seq資料,但一些motif的高階分析就要單獨做。
恰好,Signac R包,為單細胞而設計,包含了很多內建的motif分析,比如motif綜合活性,可以很方便的做一些下游分析,比如correlation。
程式碼:http://localhost:17449/lab/tree/projects/BAF_SOX9/diffbind/3.ATAC-Histone.ipynb
Diffbind可以處理bulk ATAC-seq資料,但一些motif的高階分析就要單獨做。
恰好,Signac R包,為單細胞而設計,包含了很多內建的motif分析,比如motif綜合活性,可以很方便的做一些下游分析,比如correlation。
程式碼:http://localhost:17449/lab/tree/projects/BAF_SOX9/diffbind/3.ATAC-Histone.ipynb