Rosalind-002:DNA轉錄為RNA(Transcribing DNA into RNA)

時延頻寬積發表於2020-11-11

題目:

DNA轉錄為RNA(Transcribing DNA into RNA)

Given: A DNA string tt, which corresponding to a coding strand, having length at most 1000 nt.

所給:一條被命名為tt的DNA編碼鏈,長度至少為1000個鹼基。

Return: The transcribed RNA string of tt.

需得:由tt經轉錄得到的RNA鏈。

測試資料

GATGGAACTTGACTACGTAAATT

測試輸出

GAUGGAACUUGACUACGUAAAUU

生物背景

RNA中五碳糖為核糖,鹼基有四種,分別為腺嘌呤(adenine,A)、鳥嘌呤(guanine,G)、胞嘧啶(cytosine,C)和尿嘧啶(uracil,U)。信使RNA(mRNA)由DNA的其中一條鏈轉錄而來,攜帶遺傳資訊並指導蛋白質的合成。轉錄RNA分子的DNA鏈稱為模板鏈,另一條鏈稱為編碼鏈。

思路

題目給出的是編碼鏈,因此只用把T替換為U即為轉錄得到的RNA序列。

Python知識點

DNA序列是一個字串,Python中針對字串提供了大量方法可直接呼叫,其中“.replace()”方法可用於替換字元。

程式碼

f=open('rosalind_dna.txt','r')
s=f.read()
s1=s.replace('T','U')
print(s1)

作者:wshjlxt
https://www.bilibili.com/read/cv1977567
出處: bilibili

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