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這個R tutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y軸刻度。同樣,該文包含如何執行軸轉換(對數化,開方等)和日期轉換。
準備資料
使用ToothGrowth:
# Convert dose column dose from a numeric to a factor variableToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose) head(ToothGrowth)## len supp dose## 1 4.2 VC 0.5## 2 11.5 VC 0.5## 3 7.3 VC 0.5## 4 5.8 VC 0.5## 5 6.4 VC 0.5## 6 10.0 VC 0.5
請確保 dose 變數變為因子型別。
示例圖
library(ggplot2)# Box plot bp <- ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot() bp# scatter plotsp<-ggplot(cars, aes(x = speed, y = dist)) + geom_point() sp
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改變x和y軸刻度
下面是一些設定刻度的函式:
xlim()
和ylim()
expand_limits()
scale_x_continuous()
和scale_y_continuous()
使用xlim()和ylim()函式
想要改變連續軸的範圍,可以使用xlim()
和ylim()
函式:
# x axis limitssp + xlim(min, max)# y axis limitssp + ylim(min, max)
min和max是每個軸的最小值和最大值。
# Box plot : change y axis rangebp + ylim(0,50)# scatter plots : change x and y limitssp + xlim(5, 40)+ylim(0, 150)
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使用expand_limts()函式
注意,函式 expand_limits() 可以用於:
快速設定在x和y軸在 (0,0) 處的截距項
改變x和y軸範圍
# set the intercept of x and y axis at (0,0)sp + expand_limits(x=0, y=0)# change the axis limitssp + expand_limits(x=c(0,30), y=c(0, 150))
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使用scale_xx()函式
也可以使用函式scale_x_continuous() 和scale_y_continuous()分別改變x和y軸的刻度範圍。 t
函式簡單的形式如下:
scale_x_continuous(name, breaks, labels, limits, trans) scale_y_continuous(name, breaks, labels, limits, trans)
name:x或y軸標籤
-
breaks:控制引導元素的刻度(軸刻度,網格線等),可以使用
NULL : 隱藏所有刻度
waiver() : 預設刻度
一個字串或數值向量指定顯示的刻度
-
標籤:刻度值標籤,可以使用下面的值:
NULL 沒標籤
waiver() 預設標籤
character vector 指定標籤
limits:指定刻度範圍
trans:軸轉換,可以使用 “log2”, “log10”, …
下面是示例:
# Change x and y axis labels, and limitssp + scale_x_continuous(name="Speed of cars", limits=c(0, 30)) + scale_y_continuous(name="Stopping distance", limits=c(0, 150))
img
軸轉換
對數化和開方轉換
內建轉換函式:
scale_x_log10(), scale_y_log10() : for log10 transformation
scale_x_sqrt(), scale_y_sqrt() : for sqrt transformation
scale_x_reverse(), scale_y_reverse() : to reverse coordinates
coord_trans(x =“log10”, y=“log10”) : possible values for x and y are “log2”, “log10”, “sqrt”, …
scale_x_continuous(trans=‘log2’), scale_y_continuous(trans=‘log2’) : another allowed value for the argument trans is ‘log10’
使用示例:
# Default scatter plotsp <- ggplot(cars, aes(x = speed, y = dist)) + geom_point() sp# Log transformation using scale_xx()# possible values for trans : 'log2', 'log10','sqrt'sp + scale_x_continuous(trans='log2') + scale_y_continuous(trans='log2')# Sqrt transformationsp + scale_y_sqrt()# Reverse coordinatessp + scale_y_reverse()
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函式coord_trans()也可以用於軸座標轉換
# Possible values for x and y : "log2", "log10", "sqrt", ...sp + coord_trans(x="log2", y="log2")
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格式化軸刻度標籤
這需要載入scales包:
# Log2 scaling of the y axis (with visually-equal spacing)library(scales) sp + scale_y_continuous(trans = log2_trans())# show exponentssp + scale_y_continuous(trans = log2_trans(), breaks = trans_breaks("log2", function(x) 2^x), labels = trans_format("log2", math_format(2^.x)))
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Note that many transformation functions are available using the scales package : log10_trans(), sqrt_trans(), etc. Use help(trans_new) for a full list.
格式化刻度標籤:
library(scales)# Percentsp + scale_y_continuous(labels = percent)# dollarsp + scale_y_continuous(labels = dollar)# scientificsp + scale_y_continuous(labels = scientific)
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顯示對數化刻度標記
可以使用函式annotation_logticks()新增對數化刻度標記。
Note that, these tick marks make sense only for base 10
使用MASS包動物資料:
library(MASS) head(Animals)## body brain## Mountain beaver 1.35 8.1## Cow 465.00 423.0## Grey wolf 36.33 119.5## Goat 27.66 115.0## Guinea pig 1.04 5.5## Dipliodocus 11700.00 50.0
執行示例:
library(MASS) # to access Animals data setslibrary(scales) # to access break formatting functions# x and y axis are transformed and formattedp2 <- ggplot(Animals, aes(x = body, y = brain)) + geom_point() + scale_x_log10(breaks = trans_breaks("log10", function(x) 10^x), labels = trans_format("log10", math_format(10^.x))) + scale_y_log10(breaks = trans_breaks("log10", function(x) 10^x), labels = trans_format("log10", math_format(10^.x))) + theme_bw()# log-log plot without log tick marksp2# Show log tick marksp2 + annotation_logticks()
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Note that, default log ticks are on bottom and left.
設定顯示的位置
# Log ticks on left and rightp2 + annotation_logticks(sides="lr")# All sidesp2+annotation_logticks(sides="trbl")
字母含義:
t : for top
r : for right
b : for bottom
l : for left
the combination of t, r, b and l
格式化日期軸
使用函式 scale_x_date() 和 scale_y_date()
樣例資料
建立時間序列資料
df <- data.frame( date = seq(Sys.Date(), len=100, by="1 day")[sample(100, 50)], price = runif(50) ) df <- df[order(df$date), ] head(df)## date price## 33 2016-09-21 0.07245190## 3 2016-09-23 0.51772443## 23 2016-09-25 0.05758921## 43 2016-09-26 0.99389551## 45 2016-09-27 0.94858770## 29 2016-09-28 0.82420890
繪製日期
# Plot with date dp <- ggplot(data=df, aes(x=date, y=price)) + geom_line()dp
img
格式化日期標記
使用scales包:
library(scales)# Format : month/daydp + scale_x_date(labels = date_format("%m/%d")) + theme(axis.text.x = element_text(angle=45))# Format : Weekdp + scale_x_date(labels = date_format("%W"))# Months onlydp + scale_x_date(breaks = date_breaks("months"), labels = date_format("%b"))
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作者:王詩翔
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