北鯤雲超算接入GPUA100,讓AlphaFold2輕鬆使用

beikun_北鯤雲發表於2021-08-07

二十年前,生命科學領域幾乎沒有高效能運算(HPC)的蹤跡,現如今 高效能運算 已被廣泛用於生命科學和生物醫學研究。並且 高效能運算在生命科學領成功案例越來越多,從十幾年前就開始的基因測序到去年科學家使用超級計算機抗擊新冠肺炎,再到最近大火的 AlphaFold2 都是高效能運算在 生命科學領域的實踐成果。這也意味著高效能運算在生命科學領域的地位越來越重要。

 

以最近大火的AlphaFold2來說,它能夠高度準確預測人類98.5%蛋白質,不僅如此,還有大腸桿菌、果蠅、小鼠等20個具有科研常用生物的蛋白質組資料,總計超過35萬個蛋白質的結構。我們知道,對於生物製藥而言只有瞭解的蛋白質的分子結構,才能匹配最可能與之結合的化合物,從而使其無法感染宿主細胞,達到最佳的治療效果。得益於高效能運算的加入,大幅提高了生物大分子的結構資料。

 

除此之外,高效能運算在生命科學領域還可用於計算生物學、 系統生物學 結構生物學 臨床組學資料的分析儲存 技術開發 輔助公衛中心進行病毒篩查 毒株分離 疫苗研發等工作 。因此,市場前景十分廣闊。

 

而隨著高效能運算的發展,對於高效能運算的延伸與擴充的雲端計算的聯絡越來越緊密,雲端計算在效能及成本優勢也越來越明顯。近幾年在阿里雲、騰訊雲、華為雲等網際網路大廠的主導之下,國內雲端計算市場也日趨成熟。北鯤雲超算平臺正是在這樣的市場大背景下誕生的。

北鯤雲超算平臺一直致力於將雲端計算與科研相結合,並且取得了不錯的成果。幫助高校 生物資訊 組進行基因組分析,在一週內完成2000個物種基因組分析。大大提高了課題組的研究效率。在AlphaFold2問世後,北鯤雲超算平臺還部 署了全球領先的 Nvidia A100 和Nvidia V100 GPU卡,為執行AlphaFold2應用提供強勁的算力支援。

生命科學領域在雲端計算的加持下已經有了質的飛躍,雲端計算已經成為生命科學領域離不開的強力輔助。北鯤雲超算平臺不僅能夠為科研人員提供算力資源,更重要的是能夠為生命科學行業的企業使用者提供一站式解決方案,將雲端計算擴充到更為注重計算精度的科研領域的同時,幫助生命科學行業的企業最佳化本地算力叢集,加快企業的研發速度。這對於藥企而言有著極為重要的價值。


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