新藥研發週期越來越短,北鯤雲超算平臺如何提高藥企競爭力?
隨著生物醫藥和 高效能運算 的迅猛發展、高通量手段的成熟,生物醫藥行業 研究 資料急劇膨脹, 這些 資料離不開 高效能 計算 。 高效能運算 除了擁有超強的計算能力,還具備高速定製網路、快速多級儲存、靈活的雲平臺等特質,可以有效解決計算密集型 、 通訊密集型 、 儲存密集型 這三 類生物醫藥大資料問題 。 除了高效能運算之外,近幾年興起的雲端計算,也可以達到形同的作用。近兩年在藥物研發領域初露鋒芒的北鯤雲超算平臺,就取得了業內不少的好評。 藉助 北鯤雲超算平臺不僅 可以加速藥物篩選和分子分析,使新藥的研發週期大幅縮短,並且在基因工程、藥物設計等領域發揮著越來越大的作用。
比 如 , 從 上世紀 90年代開始“人類基因組計劃”、“克隆”、“生物晶片”等內容,人類第一次完整全基因組的測序花了13年,在高效能運算的加持下,這個時間如今已經降低到1天以內。還有 近年來 PD-1訊號通路的發現 , 使得人類在戰勝癌症的道路上更近了一大步、誘導多能幹細胞 iPSC技術和基因編輯技術!CRISPR(使得I型糖尿病有望得到根治) 以及去年 嚴重的疫情,更多的樣本集、更快的資料提煉,可以 幫助 更快的研發生產出疫苗;等眾多科研成果都證明了 高效能運算在 生物工程 中 的重要性。
雲端計算的興起還改變了科學家獲取算力、享受超算服務的方式,比如北鯤雲超算平臺。不僅 能夠 幫助科研人員 在雲上搭建高效能叢集系統,滿足藥物研發人員對 高效能 計算 資源 的需求。
除 此 之 外, 北鯤雲超算平臺接入了 規模龐大且靈活雲上算力 資源 , 研究人員 可以 根據自身研究專案的大小 按需購買 算力資源 ,不用擔心 經費問題以及 被算力規模限制了研發速度 的問題 。
我們知道,藥物研發是一個非常複雜的過程,因此也非常耗時,藥物篩選只是流程前期一個環節。例如,在研製疫苗時期,需要首先尋找跟蛋白病毒酶結合的小分子,由於存在不同種類或研究機構的配體(小分子)庫,配體(小分子)庫數量巨大,每個配體庫的配體數量成千上萬,甚至更大,透過實驗方式一一測試驗證顯然不能在短時間內找到合適的匹配藥物。只有透過計算機數值模擬進行篩選,對不同配體的結合效果進行打分,篩選結合模式合理的一些配體作為候選藥物,然後再進行實驗驗證,這樣才能夠有效加速藥物的研究程式。
北鯤雲超算平臺提供的就是這樣一種服務,要實現藥物的高效率篩選,還需要我們前文提到的 高通量手段 , 這也是北鯤雲超算平臺為藥企提供的一站式解決方案之一。
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