北鯤雲超算平臺如何加速生命科學研究

提到 北鯤雲 ， 許多業內同僚 首先想到的是，這是一家 為有 提供 高效能算力 SAAS服務及 整合企業線下及雲上資源，提供安全、彈性、自主的企業級 Cloud-HPC方案的 雲端計算 公司 。 隨著雲端計算基礎設施和技術的成熟，諸如生命科學、人工智慧、晶片設計、工業模擬、大氣海洋等行業對於雲端計算的需求快速增長。北鯤雲正是基於這樣的市場需求自主研發了北鯤雲超算平臺，今天我們以生命科學行業為例，具體看看 北鯤雲超算平臺 是 如何加速生命科學研究 的。

 

眾所周知，高效能運算在生命科學領域中的應用是近幾年才出現的，而且主要應用在基因測序、分子動力學模擬，以及虛擬篩選等流程。簡單來說就是透過實驗儀器對生物分子進行測量，然後使用一些後處理軟體對原始的大量資料進行處理和分析，接著對序列資料進行同源及相似性搜尋、比對、序列分析、遺傳發育分析等。而分子動力學模擬則是對於原子和電子所構成的多體系統，用計算機模擬原子核的運動過程，從而計算這個多體系統的結構和性質。虛擬篩選是根據模擬小分子配體與生物大分子受體的相互作用，預測兩者間的結合模式和親和力，從而進行藥物的虛擬篩選。

 

藥物的虛擬篩選是依靠其所收集的基因測序的資料以及生物分子結構的資料庫為基礎，首先透過 X射線-單晶衍射等技術獲得受體大分子結合部位的結構，然後透過資料庫搜尋或者全新藥物分子設計技術識別得到分子形狀和理化性質與受體作用相匹配的分子。簡單來說，有些類似與AI建模。對於人工智慧系統來說，其所建立的引數規模越大，往往就越聰明。藥物的虛擬篩選也是一樣，當其資料庫中，所收集的生物分子資訊與基因序列越多，其所能產生先導化合物的可能性就越大。因此，效率也就越高。

然而，對於生命科學而言，基因測序與分子動力模擬所產生的資料量巨大，要建立如此大的模型算力成本自然十分高昂，很大程度上阻礙了科研人員對藥物虛擬篩選的深入研究。

 

針對這一難題，北鯤雲創始人馮建新在公司成立之初就曾表示，北鯤雲超算平臺是專注於為高算力需求的企業和科研人員提供靈活、高效的算力產品及服務，幫助客戶提升業務執行效率並有效降低成本。北鯤雲超算平臺，透過接入主流公有云資源，並在全球擁有 25個地域節點，超過10萬臺伺服器，單叢集節點可提供10，000核時算力，算力資源豐富，可隨時開啟高效能運算，作業排隊時間趨近於0.

 

北鯤雲作為一家技術型公司，不斷提高雲資源的最佳化和管理，讓使用者真正體驗到雲端計算帶來的優勢。