R語言ggsurvplot繪製生存曲線報錯 : object of type ‘symbol‘ is not subsettable
原文連結: http://tecdat.cn/?p=14683
預期
繪製生存曲線圖
實際
object of type ‘symbol‘ is not subsettable
重現問題的步驟
library(survminer)#> Le chargement a nécessité le package : ggplot2#> Le chargement a nécessité le package : ggpubr#> Warning: le package 'ggpubr' a été compilé avec la version R 3.4.3#> Le chargement a nécessité le package : magrittrrequire("survival")#> Le chargement a nécessité le package : survivalsurvie <- Surv(time, status) ~ sexfit<- survfit(survie, data = lung)ggsurvplot(fit, data = lung)#> Error: objet de type 'symbol' non indiçable
ggsurvplot()嘗試從物件中捕獲生存公式Surv(time, status) ~ sex,如下所示:
fit$call$formula
。
通過分解R程式碼,執行fit $ call $ formula的結果是“ survie”而不是
Surv(time, status) ~ sex
。這將導致錯誤訊息。
請擬合併視覺化生存曲線,如下所示:
library(survival)fit <- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)ggsurvplot(fit, data = lung)
如果您仍然想分解R程式碼,那麼我建議使用
surv_fit()
[survminer軟體包中的] 函式 ,它是對R基本函式的擴充套件,
survfit()
具有更多功能
您可以按以下方式使用它:
survie <- Surv(time, status) ~ sexfit <- surv_fit(survie, data = lung)ggsurvplot(fit, data = lung)
參考文獻
1. 如何解決線性混合模型中畸形擬合(SINGULAR FIT)的問題
來自 “ ITPUB部落格 ” ,連結:http://blog.itpub.net/69982319/viewspace-2713737/,如需轉載,請註明出處,否則將追究法律責任。
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