說一點攝影比賽的事,說一點lncRNA的事

wheatomics發表於2018-06-14

前面一段時間我們說要搞一次小麥攝影比賽/第一屆“小麥研究聯盟”線上攝影展,截止日期是6月30號。適逢小麥收穫季節,辛苦自然不必說了。忙裡偷閒拍幾張照片做個記錄吧。投稿郵箱是13148474750@163.com,手機上的照片可以直接通過郵箱傳送。

昨天朋友圈看到山東農大農學院也有一個攝影大賽,裡邊有好幾張照片裡有小麥的身影,點選閱讀原文給他們投票吧。下面是節選的幾張。

img

img

img

img

img

目前小麥裡lncRNA(Long non-coding RNA)的研究還相對較少,對它的瞭解也僅限於讀了幾篇文獻。昨天看到一篇關於lncRNA的介紹[《叫一聲lncRNA你敢答應麼男女不限]》,其中有下面這樣一句話:

因為多數lncRNA與mRNA不同,沒有polyA的尾巴,所以建庫時需要使用去核糖體的建庫方式,又因為lncRNA需要明確的知道產生方向,所以需要使用鏈特異性的建庫方式。

這句“因為多數lncRNA與mRNA不同,沒有polyA的尾巴”的說法,有點突破我的認識。我想這句話的話正確表示方式應該是“因為lncRNA與mRNA不同,並且多數(相當一部分)lncRNA沒有polyA尾巴”。小麥裡lncRNA的研究一定也會越來越多,所以索性花了一點查閱了一些資料,整理筆記如下。

lncRNA的定義(摘自wikipedia)

Long non-coding RNAs (long ncRNAs, lncRNA) are defined as transcripts longer than 200 nucleotides that are not translated into protein.[1] This somewhat arbitrary limit distinguishes long ncRNAs from small non-coding RNAs such as microRNAs (miRNAs), short interfering RNAs (siRNAs), Piwi-interacting RNAs (piRNAs), small nucleolar RNAs (snoRNAs), and other short RNAs.

翻譯過來就是,長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類長度大於200nt的非編碼RNA。

lncRNA與mRNA的關係

lncRNA不是mRNA,但其具有mRNA樣結構,也需要經過剪下,具有5'帽子和polyA尾巴,通過剪接形成成熟體的lncRNA。

mRNA(messenger RNA)即信使RNA,是經由DNA轉錄而來,帶著相應的遺傳訊息,為下一步翻譯成蛋白質提供所需的訊息。而lncRNA不具有編碼蛋白質的能力,所以lncRNA和mRNA不同。

lncRNA除了具有polyA的之外,還有一部分lncRNA不具有polyA。這個地方我有點疑惑,測序鑑定過程中,如何與未成熟的RNA或降解的RNA區分?基因的轉錄是在核內進行的,基因的初始轉錄產物是包括內含子的,初始轉錄物經過5'端的加帽,內含子去除和3‘端加多腺苷酸尾部結構,形成成熟的RNA,然後通過核孔進入細胞質,用於翻譯等後續生物學過程。

個人的一點想法

關於lncRNA的定義中是說不編碼蛋白質,我認為應該是一類長度長度大於200nt並且不以蛋白形式行使生物學功能的RNA。

首先,目前已經有一些研究表明某些lncRNA可以編碼具有生物學功能的蛋白質,編碼蛋白的RNA除了翻譯成蛋白質起作用外,其本身也具有生物學作用。


以上是就是關於lncRNA的一點認識,錯誤的地方還請指正。也可以通過郵箱指正或交流(wheatomics@qun.mail.163.com).

相關文章