使用`phy`進行神經網路資料讀取及視覺化之開發環境準備
基本步驟:
- 下載並安裝
anaconda3
- 安裝環境,environment.yml裡面需要配置環境name和python版本:
conda env create -f environment.yml --force
- 安裝phy和phycontrib,進入各自的目錄執行:
python setup.py install
- 啟用並進入環境:
activate phy-name
- 在新環境中安裝phy和phycontrib:
pip install phy phycontrib
- 執行示例程式:
phy template-gui params.py
- 下載並安裝
幾個暫不知道具體原因的坑:
- 必須在啟用環境之前,在
anaconda
操作環境下安裝phy
和phycontrib
,否則會出現command not found
、supervisor module not found
等問題,這似乎是anaconda的一個BUG,如果沒有在環境外面安裝phy和phycontrib,在環境裡面安裝的這兩個東西會認為目前的環境是Linux,所以出現只有在Linux下面才有的supervisor模組 - 使用
Anaconda2
可能會出現cli:39 unsupported pickle protocol: 3
這個錯誤,換成Anaconda3
就好了,python2.7
不支援這麼高版本的協議,只能使用python3
phy template-gui
的示例資料開啟後會生成.phy
目錄,如果第一次開啟失敗,之後切換環境再次開啟示例資料依然會失敗,需要手動清除掉該目錄,重新開啟
- 必須在啟用環境之前,在
連結:
- phy安裝:https://pypi.python.org/pypi/phy
- phy-template-gui: http://phy-contrib.readthedocs.io/en/latest/template-gui/
- Anaconda下載:https://www.anaconda.com/download/#windows
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