小熊飛槳練習冊-02眼疾識別

小熊寶寶啊發表於2022-04-18

小熊飛槳練習冊-02眼疾識別

簡介

小熊飛槳練習冊-02眼疾識別，本專案開發和測試均在 Ubuntu 20.04 系統下進行。
專案最新程式碼檢視主頁：小熊飛槳練習冊
百度飛槳 AI Studio 主頁：小熊飛槳練習冊-02眼疾識別
Ubuntu 系統安裝 CUDA 參考：Ubuntu 百度飛槳和 CUDA 的安裝

檔案說明

檔案 說明
train.py 訓練程式
test.py 測試程式
test-gtk.py 測試程式 GTK 介面
report.py 報表程式
get-data.sh 獲取資料到 dataset 目錄下
check-data.sh 檢查 dataset 目錄下的資料是否存在
mod/alexnet.py AlexNet 網路模型
mod/dataset.py ImageClass 影像分類資料集解析
mod/utils.py 雜項
mod/config.py 配置
mod/report.py 結果報表
dataset 資料集目錄
params 模型引數儲存目錄
log VisualDL 日誌儲存目錄

資料集

資料集來源於百度飛槳公共資料集：眼疾識別資料集iChallenge-整理版

獲取資料

如果執行在本地計算機，下載完資料，檔案放到 dataset 目錄下，在專案目錄下執行下面指令碼。
如果執行在百度 AI Studio 環境，檢視 data 目錄是否有資料，在專案目錄下執行下面指令碼。

bash get-data.sh

分類標籤

  • 非眼疾 0
  • 眼疾 1

檢查資料

獲取資料完畢後，在專案目錄下執行下面指令碼，檢查 dataset 目錄下的資料是否存在。

bash check-data.sh

網路模型

網路模型使用 AlexNet 網路模型 來源百度飛槳教程和網路。
AlexNet 網路模型 參考： 百度飛槳教程

import paddle
import paddle.nn as nn
import paddle.nn.functional as F


# AlexNet 網路模型
class AlexNet(nn.Layer):
    """
    AlexNet 網路模型

    輸入影像大小為 224 x 224
    池化層 kernel_size = 2, 第一層卷積層填充 paddling = 2
    """
    def __init__(self, num_classes=10, pool_kernel_size=2, conv1_paddling=2, fc1_in_features=9216):
        """
        AlexNet 網路模型

        Args:
            num_classes (int, optional): 分類數量, 預設 10
            pool_kernel_size (int, optional): 池化層核大小, 預設 2
            conv1_paddling (int, optional): 第一層卷積層填充, 預設 2,
                輸入影像大小為 224 x 224 填充 2
            fc1_in_features (int, optional): 第一層全連線層輸入特徵數量, 預設 9216, 
                根據 max_pool3 輸出結果, 計算得出 256*6*6 = 9216

        Raises:
            Exception: 分類數量 num_classes 必須大於等於 2
        """        
        super(AlexNet, self).__init__()
        if num_classes < 2:
            raise Exception("分類數量 num_classes 必須大於等於 2: {}".format(num_classes))
        self.num_classes = num_classes
        self.pool_kernel_size = pool_kernel_size
        self.fc1_in_features = fc1_in_features
        self.conv1 = nn.Conv2D(
            in_channels=3, out_channels=96, kernel_size=11, stride=4, padding=conv1_paddling)
        self.max_pool1 = nn.MaxPool2D(kernel_size=pool_kernel_size, stride=2)
        self.conv2 = nn.Conv2D(
            in_channels=96, out_channels=256, kernel_size=5, stride=1, padding=2)
        self.max_pool2 = nn.MaxPool2D(kernel_size=pool_kernel_size, stride=2)
        self.conv3 = nn.Conv2D(
            in_channels=256, out_channels=384, kernel_size=3, stride=1, padding=1)
        self.conv4 = nn.Conv2D(
            in_channels=384, out_channels=384, kernel_size=3, stride=1, padding=1)
        self.conv5 = nn.Conv2D(
            in_channels=384, out_channels=256, kernel_size=3, stride=1, padding=1)
        self.max_pool3 = nn.MaxPool2D(kernel_size=pool_kernel_size, stride=2)
        # in_features 9216 = max_pool3 輸出 256*6*6
        self.fc1 = nn.Linear(in_features=fc1_in_features, out_features=4096)
        self.drop_ratio1 = 0.5
        self.drop1 = nn.Dropout(self.drop_ratio1)
        self.fc2 = nn.Linear(in_features=4096, out_features=4096)
        self.drop_ratio2 = 0.5
        self.drop2 = nn.Dropout(self.drop_ratio2)
        self.fc3 = nn.Linear(in_features=4096, out_features=num_classes)

    def forward(self, x):
        x = self.conv1(x)
        x = F.relu(x)
        x = self.max_pool1(x)
        x = self.conv2(x)
        x = F.relu(x)
        x = self.max_pool2(x)
        x = self.conv3(x)
        x = F.relu(x)
        x = self.conv4(x)
        x = F.relu(x)
        x = self.conv5(x)
        x = F.relu(x)
        x = self.max_pool3(x)
        # flatten 根據給定的 start_axis 和 stop_axis 將連續的維度展平
        x = paddle.flatten(x, start_axis=1, stop_axis=-1)
        x = self.fc1(x)
        x = F.relu(x)
        # 在全連線之後使用 dropout 抑制過擬合
        x = self.drop1(x)
        x = self.fc2(x)
        x = F.relu(x)
        # 在全連線之後使用 dropout 抑制過擬合
        x = self.drop2(x)
        x = self.fc3(x)
        return x

資料集解析

資料集解析，主要是解析 影像路徑和標籤的文字 ，然後根據影像路徑讀取影像和標籤。

import paddle
import os
import random
import numpy as np
from PIL import Image
import paddle.vision as ppvs


class ImageClass(paddle.io.Dataset):
    """
    ImageClass 影像分類資料集解析, 繼承 paddle.io.Dataset 類
    """

    def __init__(self,
                 dataset_path: str,
                 images_labels_txt_path: str,
                 transform=None,
                 shuffle=True
                 ):
        """
        建構函式，定義資料集

        Args:
            dataset_path (str): 資料集路徑
            images_labels_txt_path (str): 影像和標籤的文字路徑
            transform (Compose, optional): 轉換資料的操作組合, 預設 None
            shuffle (bool, True): 隨機打亂資料, 預設 True
        """

        super(ImageClass, self).__init__()
        self.dataset_path = dataset_path
        self.images_labels_txt_path = images_labels_txt_path
        self._check_path(dataset_path, "資料集路徑錯誤")
        self._check_path(images_labels_txt_path, "影像和標籤的文字路徑錯誤")
        self.transform = transform
        self.image_paths, self.labels = self.parse_dataset(
            dataset_path, images_labels_txt_path, shuffle)

    def __getitem__(self, idx):
        """
        獲取單個資料和標籤

        Args:
            idx (Any): 索引

        Returns:
            image (float32): 影像
            label (int): 標籤
        """
        image_path, label = self.image_paths[idx], self.labels[idx]
        return self.get_item(image_path, label, self.transform)

    @staticmethod
    def get_item(image_path: str, label: int, transform=None):
        """
        獲取單個資料和標籤

        Args:
            image_path (str): 影像路徑
            label (int): 標籤
            transform (Compose, optional): 轉換資料的操作組合, 預設 None

        Returns:
            image (float32): 影像
            label (int): 標籤
        """
        ppvs.set_image_backend("pil")
        image = Image.open(image_path)
        if transform is not None:
            image = transform(image)
        # 轉換影像 HWC 轉為 CHW
        image = np.transpose(image, (2, 0, 1))
        return image.astype("float32"), label

    def __len__(self):
        """
        資料數量

        Returns:
            int: 資料數量
        """
        return len(self.labels)

    def _check_path(self, path: str, msg: str):
        """
        檢查路徑是否存在

        Args:
            path (str): 路徑
            msg (str, optional): 異常訊息

        Raises:
            Exception: 路徑錯誤, 異常
        """
        if not os.path.exists(path):
            raise Exception("{}: {}".format(msg, path))

    @staticmethod
    def parse_dataset(dataset_path: str, images_labels_txt_path: str, shuffle: bool):
        """
        資料集解析

        Args:
            dataset_path (str): 資料集路徑
            images_labels_txt_path (str): 影像和標籤的文字路徑

        Returns:
            image_paths: 影像路徑集
            labels: 分類標籤集
        """
        lines = []
        image_paths = []
        labels = []
        with open(images_labels_txt_path, "r") as f:
            lines = f.readlines()
        # 隨機打亂資料
        if (shuffle):
            random.shuffle(lines)
        for i in lines:
            data = i.split(" ")
            image_paths.append(os.path.join(dataset_path, data[0]))
            labels.append(int(data[1]))
        return image_paths, labels

配置模組

可以檢視修改 mod/config.py 檔案，有詳細的說明

開始訓練

執行 train.py 檔案，檢視命令列引數加 -h

python3 train.py

  --cpu             是否使用 cpu 計算，預設使用 CUDA
  --learning-rate   學習率，預設 0.001
  --epochs          訓練幾輪，預設 2 輪
  --batch-size      一批次數量，預設 2
  --num-workers     執行緒數量，預設 2
  --no-save         是否儲存模型引數，預設儲存, 選擇後不儲存模型引數
  --load-dir        讀取模型引數，讀取 params 目錄下的子資料夾, 預設不讀取
  --log             是否輸出 VisualDL 日誌，預設不輸出
  --summary         輸出網路模型資訊，預設不輸出，選擇後只輸出資訊，不會開啟訓練

測試模型

執行 test.py 檔案，檢視命令列引數加 -h

python3 test.py

  --cpu           是否使用 cpu 計算，預設使用 CUDA
  --batch-size    一批次數量，預設 2
  --num-workers   執行緒數量，預設 2
  --load-dir      讀取模型引數，讀取 params 目錄下的子資料夾, 預設 best 目錄

測試模型 GTK 介面

執行 test-gtk.py 檔案，此程式依賴 GTK 庫，只能執行在本地計算機。

python3 test-gtk.py

GTK 庫安裝

python3 -m pip install pygobject

使用手冊

  • 1、點選 選擇模型 按鈕。
  • 2、彈出的檔案對話方塊選擇模型，模型在 params 目錄下的子目錄的 model.pdparams 檔案。
  • 3、點選 隨機測試 按鈕，就可以看到測試的影像，預測結果和實際結果。

檢視結果報表

執行 report.py 檔案，可以顯示 params 目錄下所有子目錄的 report.json。
加引數 --best 根據 loss 最小的模型引數儲存在 best 子目錄下。

python3 report.py

report.json 說明

鍵名 說明
id 根據時間生成的字串 ID
loss 本次訓練的 loss 值
acc 本次訓練的 acc 值
epochs 本次訓練的 epochs 值
batch_size 本次訓練的 batch_size 值
learning_rate 本次訓練的 learning_rate 值

VisualDL 視覺化分析工具

  • 安裝和使用說明參考：VisualDL
  • 訓練的時候加上引數 --log
  • 如果是 AI Studio 環境訓練的把 log 目錄下載下來，解壓縮後放到本地專案目錄下 log 目錄
  • 在專案目錄下執行下面命令
  • 然後根據提示的網址，開啟瀏覽器訪問提示的網址即可
visualdl --logdir ./log

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