從零開始學生信-orthofinder的安裝和使用-基因家族分析

abysw發表於2020-12-11

【環境變數】註釋掉conda3,source ~/.bashrc

因為orthofinder是由python2編寫的。

conda install orthofinder # 若在上一章之後沒有重啟的同學請重啟後操作。

# 由於是剛開始搭建,這裡沒有給orthofinder單獨一個環境空間,這一套下來,基本的基因分析軟體都安裝好了。

 

包括比對軟體:mafft,muscle,blast,

包括建樹軟體:fasttree,raxml,iqtree,

包括聚類軟體:mcl

包括其他重要的包和依賴。

建樹軟體:

 

相關文章