【環境變數】註釋掉conda3,source ~/.bashrc
因為orthofinder是由python2編寫的。
conda install orthofinder # 若在上一章之後沒有重啟的同學請重啟後操作。
# 由於是剛開始搭建,這裡沒有給orthofinder單獨一個環境空間,這一套下來,基本的基因分析軟體都安裝好了。
包括比對軟體:mafft,muscle,blast,
包括建樹軟體:fasttree,raxml,iqtree,
包括聚類軟體:mcl
包括其他重要的包和依賴。
建樹軟體: