【馬曉光】Endnote和文獻管理技巧分享
Postscript:
我個人用的NoteExpress這個軟體管理文獻,沒用過Endnote這個軟體,不過管理思想上都是相同的,主要看自己單位購買的是什麼軟體。
NoteExpress下載地址:http://www.inoteexpress.com/CompanyWeb/Endnote下載地址:http://endnote.com/
Jeremy Lin @HQU
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有幸連續兩年都被邀請在系裡碩士課程EPID745 Master Seminar上講Endnote,第一次被邀請是因為導師的推薦,第二次被邀請是因為導師就是這門課的主講。導師習慣用Reference Manager,不過現在她所有文獻插入編輯的工作都由我們學生來做,所以她覺得我們應該更有“經驗”,於是我就被推出來了。言歸正傳,基礎的東西就不講了,直接說技巧和心得吧:
1. 建立你自己的資料庫:以前本科碩士的時候,也用Endnote,但是習慣於一個專案一個library,以至於最後想找什麼還要到具體資料夾翻。我現在的導師就有一個master library(不過是reference manager格式的),文獻在一個library裡面統一管理,所有的paper文獻插入編輯都可以用這一個資料庫,很方便。不過,要注意的是,一定要避免重複插入文獻,一定要留有備份,一定要確定自己用的資料庫是最新的那個。Endnote裡面可以建立子資料夾,這個更方便於管理。
2. 儲存PDF:pdf的命名和儲存路徑很大程度決定了你文獻管理的效率。命名我建議作者last name,year,journal的方式,如果想進一步說明,可以加個-之後加些備註,比如“review”,“diabetes”等等。很多人可能認為這樣命名不好分類,其實,如果你的研究領域不是特別的廣,如果你真的認真讀了文獻,這些不是問題。讀文獻的時候,以前我主要關注文章的內容,而不是特別關心文章的背景,比如作者誰牛不牛,組是哪裡的,什麼專案資助的等等。現在文獻看多了,漸漸發現文獻周邊的東西我們也要了解,這樣有助於記憶,也有助於對領域的瞭解。如果你對作者都熟了,自然一個last name就夠了,可能分類就不太需要了。自然,這也不絕對,適當分一級資料夾也是可以的。Endnote裡面有自動下載pdf的功能,不過如果你的endnote沒有連到授權的資料庫而只是公開的資料庫,那麼可能有一半左右的文章找不到全文(Endnote可以連自己的圖書館的,比如我們南卡的就有專門的授權可以用於endnote的連結,這個具體教程大家可以網上搜)。如果把pdf連到endnote裡面,其實這樣做很方便,但是有個問題,endnote儲存pdf都是一個文獻一個“資料夾”,你要想大批量分享你的pdf,你就很崩潰,因為都是一個個資料夾,每次要點進去才看到pdf。
3. 文章標註和記號:讀文獻是做科研最基本的工作,也是終生學習的最有效手段。文獻量太大,如果不做適當的標註,很快就忘記,不論是你當時讀得多精的文章。所以按照自己的習慣,在文章首頁空白處做些記號,或者弄個筆記本做個索引,或者貼個便條紙,這些都能達到事半功倍的效果。
4. Endnote和reference manager(RM)的區別和聯絡:兩個都是比較常用的文獻管理,而且都是一個公司做的,endnote我覺得介面更友好,操作更簡便,RM聯網工作的能力是亮點。不過按照我的習慣,我更喜歡Endnote。介面簡單,上手容易,版本更新快,可以自動搜原文,格式自定義修改都方便等等。
5. 把文獻匯入Endnote的方式有很多很多:比如最直接的是手動輸入,不過這個要注意,作者名字怎麼縮寫,哪裡加句號逗號,這些都能影響你的文獻格式。其他匯入方式可以有pubmed等資料庫的搜尋結果,比如pubmed,要儲存成medline格式的text,然後在endnote按照相應格式匯入就行。還可以從RM檔案轉出來匯入。可以在Endnote軟體裡面直接搜尋文獻,搜尋出來自動就匯入了,不想匯入的扔到垃圾箱裡就行。我比較喜歡用google scholar(不過國內是不是上不了啊?),搜到文獻,有個cite標籤,點選之後就可以看到儲存到endnote的標籤,然後就可以匯入了。
6. 編輯文獻:文獻不論來源是哪裡,多少都存在一些格式問題,如果你在插入文獻發現問題之後,一定要“第一時間”編輯更正,不要在word裡面的reference list裡面改,否則以後還會再費事。在word裡,也可以右鍵點選文獻插入的編號,然後選擇編輯文獻,這樣在endnote裡面就都改好了。
7. Word裡面如何插入文獻:最簡單直接的就是在endnote裡面選好要插入的,然後在word裡面相應地方點選工具欄裡endnote插入文獻的命令就行了,這樣不好的地方是每插入一次word會重新生成你的list。另外一個辦法就是用{},在插入文獻的地方用大括號,裡面放上比如last name,year,或者title中的一些詞,然後最後在統一生成文獻列表。這樣做的好處是不用總更新列表,還可以隨時更改,還很清晰明瞭。尤其在論文打草稿階段,這個方法最有效。
8. 自定義雜誌格式:我們通常用endnote裡面自帶的雜誌格式,但是由於軟體版本多,很多版本的style,也就是雜誌的格式不是最新的,應用的話會出錯或產生麻煩。我的習慣是,在原有格式的基礎上自定義自己想要的格式,然後儲存。endnote格式自定義功能很強大,幾乎所有的地方都可以自定義,包括字型,大小,段落,標點。有些帶URL的,比如如何加accessed on date都可以定義。總之,你可以建立完全你想要的格式。
9. 永遠都要留一個帶code的版本:很多人習慣在論文提交前做一個沒有code的版本(就是把所有插入的文獻編號和列表都變成純文字),這樣可以隨便編輯。不過,一定要留一個帶code的版本,因為論文總是要改的,而且計劃總沒有變化快。等你要改的時候,如果不能連到endnote,那就崩潰了。
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