本週一(6 月 19 日)機器之心發表文章《我的深度學習開發環境詳解:TensorFlow + Docker + PyCharm 等,你的呢(附問卷)》介紹了研究員 Killian 的深度學習開發環境:TensorFlow + Docker + PyCharm + OSX Fuse + Tensorboard,並附了一份調查問卷想要了解機器之心讀者配置的開發環境、對程式語言、框架的使用情況。雖然獲得的反饋量比較有限,但我們也觀察到了一些比較有趣的現象。在這篇文章中,我們將對此問卷的結果進行介紹,希望對需要配置開發環境的讀者有所幫助。最後,我們介紹了一種新的開發環境配置:Jupyter + Tensorflow + Nvidia GPU + Docker + Google Compute Engine。
問卷結果
該調查問卷文章釋出之後共有超過 10800 名讀者閱讀,收到大量有效答卷,另有 16 名讀者是以留言的方式在文章下介紹了自己的開發系統。大部分被調查者來自中國大陸,此外還有多名來自北美大學和研究機構的調查者參與其中。以下的資料統計圖表中,並不包含微信文章留言的資料。
根據表單後臺的資料統計,參與調查的讀者中大部分為學生,然後是開發工程師、研究員、產品經理等。
而在被調查者的研究方向上,計算機視覺領域佔比接近一半(48.2%),自然語言處理次之(26.8%),這部分反映了目前深度學習的主要研究方向。此外還包括金融風控、資料分析、現場安全識別、通訊、時空大資料、醫學影像、催化以及材料模擬等領域。
下面就開始詳細為大家介紹調查者們最常用的程式語言、深度學習框架,以及在開發過程中面臨的難題。
一、Python 成為深度學習主流語言
機器之心一直關注機器學習研究員、工程師在開發過程中所注重實用的工具、語言。在不久之前釋出的文章《業界 | 超越 R,Python 成為最受歡迎的機器學習語言》中,KDnuggets 與 O'Reilly 的調查結果都表明,越來越多的人開始使用 Python 進行機器學習。
2016 年 KDNuggets 調查結果
在機器之心問卷中,對於問題「您認為哪種語言會成為深度學習的主流語言?」,所有被調查者的態度完全一致:Python!看來,Python 已是絕大多數從業人員必須學習的語言,同時也是眾望所歸的未來主流深度學習語言。
O'Reilly 2016 年度資料科學薪資調查曾顯示:Python 和 Spark 是最對薪資有貢獻的工具。Python 具有開發速度快的特點,Caffe、TensorFlow 等主流深度學習框架都對其支援。騰訊最近推出的機器學習高效能運算平臺 Angel 在支援 Java、Scala 之外,也將在未來對 Python 提供支援。
在機器之心的問卷中,調查者反饋,雖然他們會使用其他程式語言,比如 R、C++,但實際執行程式的編寫還是主要使用 Python,簡單、開發速度快是很大的優勢。
其他語言的使用情況簡介如下:Matlab 用於快速完整、視覺化研究;R 方便框架模型的驗證分析,也便於處理資料和畫圖。因此,多數人在不同的開發流程中使用不同的語言。
二、TensorFlow 佔據半壁江山
而在框架方面,谷歌支援的 TensorFlow 就沒有這樣的壟斷地位了,不過它也已佔據了接近一半(48%)的水平。完善的功能和大量的支援文件(眾多 TensorFlow 支持者提到的)是目前 TensorFlow 的強項,存在於 GitHub 中的大量實現更是不容忽視,視覺化工具 TensorBoard 則為開發者提供了直觀的引導。但由於網路問題,TensorFlow 系統在大陸的搭建是個難題。部分被調查者也指出,TensorFlow 的 Windows 支援也為他們帶來了便利。
Facebook 新近推出的框架 PyTorch 人氣急劇攀升,在僅僅推出 5 個月的情況下達到了第二的位置(16%),因支援動態計算圖,易用性和強大的效能而出名。在業界還需要產品遷移的情況下,學界已經出現擁抱 PyTorch 的趨勢了。
同屬於 Facebook 的 Caffe/Caffe2 則佔據第三(14.7%),大部分被調查者在對於 Caffe 系列的評價中都提到了快速的特點。
此外,亞馬遜支援的 MXNet 佔據了 10.7% 的使用者數量,排名第四。被調查者認為,MXNet 擁有很好的社群支援,因而易於使用。
三、硬體
硬體方面,超過一半的被調查者明確表示自己的深度學習硬體是英特爾 Core i7 + 英偉達 Geforce GTX 1080(Ti)的組合。與 TitanX 相比,英偉達 Tesla 系列的應用顯得更少,看來英偉達推動的商用機器學習計算卡仍然需要進一步的推廣。由於資源限制,GPU 陣列的使用並不流行,而云服務也沒有被大部分開發者採用(也是經費原因)。
目前,雖然人們對於多 GPU/分散式機器學習訓練/處理的呼聲很高,但相關的教程和可以借鑑的方法仍顯欠缺,這或許是經費之外人們面臨的最大難題。
四、系統
Linux 顯然是深度學習的必備系統,雖然 TensorFlow 已有 Windows 支援,但大多數受訪者表示自己的深度學習機器使用基於 Linux 的 Ubuntu 系統。
五、面臨的難題
在搭建深度學習環境的過程中,各元件的相容性問題一直是困擾開發者們的難題,部分開發者表示依賴關係處理比較頭疼,而使用 Docker 可以部分解決這些問題。英偉達的 cuda/GPU 驅動程式安裝困難也是很多調查者提到的問題。
需要配置安裝很多不同的開發框架……還有擴充套件計算叢集……
本次深度學習開發環境調查已經結束,由於樣本數量限制,這次我們得出的結論可能不甚準確。深度學習的開發環境會隨著技術的發展不斷進化,未來究竟是百家爭鳴,還是一家獨大?歡迎大家前來討論。感謝大家對機器之心此次調查問卷的支援,獲得獎品同學的禮物已經寄出。
Jupyter + Tensorflow + Nvidia GPU + Docker + Google Compute Engine
這一部分,我們編譯了一篇新的深度學習開發環境配置:Jupyter + Tensorflow + Nvidia GPU + Docker + Google Compute Engine。
動機:商業上喜歡快捷、且由資料驅動的洞見,因此他們聘請了資料科學家來處理這些任務。實踐性的資料科學是探索性、迭代性的過程,這個過程要求大量的計算資源和時間。資料科學家經常使用 Jupyter notebook 以更好地支援這種探索性的迭代,同時更傾向於使用 GPU 以加速 Tensorflow 專案的計算。然而,GPU 成本比較高,而計算資源也需要小心地管理以滿足商業上對高效運算的需求。
近來雲端計算傾向於使用 Kubernetes 和 Docker 提高資源利用率。那資料科學的工具(如 Jupyter 和 GPU 等)嵌入 Docker 和 Kubernets 會更有效嗎?也許這樣更節約時間和記憶體,我前面已經用過了其他版本,但現在的環境配置是比較優秀的。
建立一個 GCE 例項
首先,建立防火牆規則,將 Jupyter(8888)和 Tensorboard(6006)新增到白名單中。
然後建立一個 GCE 例項,對於該案例:
- 使用的系統為 Ubuntu 16.04 LTS
- 分配 50GB 的啟動盤
- 至少需要一個 K80 GPU
- 將 jupyter 和 tensorboard新增到你建立的防火牆規則中。
安裝和確認 CUDA 能訪問 GPU
使用英偉達的 CUDA 庫取得訪問 GPU 的許可權。
下一步需要將 SSH 新增到你建立的計算節點中,然後使用指令碼安裝 CUDA(https://cloud.google.com/compute/docs/gpus/add-gpus):
#!/bin/bashecho "Checking for CUDA and installing."# Check for CUDA and try to install.if ! dpkg-query -W cuda; then # The 16.04 installer works with 16.10. curl -O http://developer.download.nvidia.com/compute/cuda/repos/ubuntu1604/x86_64/cuda-repo-ubuntu1604_8.0.61-1_amd64.deb dpkg -i ./cuda-repo-ubuntu1604_8.0.61-1_amd64.deb apt-get update apt-get install cuda -yfi
然後你能使用 wget 命令 pull 來源 gist 並輸入到 bash 中:
wget -O - -q 'https://gist.githubusercontent.com/allenday/f426e0f146d86bfc3dada06eda55e123/raw/41b6d3bc8ab2dfe1e1d09135851c8f11b8dc8db3/install-cuda.sh' | sudo bash
如果 CUDA 安裝成功了,執行 nvidia-smi 命令將返回表格顯示可用的 Tesla K80 GPU:
nvidia-smi
安裝 Docker(-Engine) 和 Nvidia-Docker
對於 docker,我們需要從 Docker 獲取 docker-ce 版本,而不是 Ubuntu 自帶的 docker.io 包。可以使用以下指令碼完成(https://docs.docker.com/engine/installation/linux/ubuntu/)(https://docs.docker.com/engine/installation/linux/ubuntu/%EF%BC%89):
#/bin/bash# install packages to allow apt to use a repository over HTTPS:sudo apt-get -y install \apt-transport-https ca-certificates curl software-properties-common# add Docker』s official GPG key:curl -fsSL https://download.docker.com/linux/ubuntu/gpg | sudo apt-key add - # set up the Docker stable repository.sudo add-apt-repository \ "deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/ubuntu \ $(lsb_release -cs) \ stable"# update the apt package index:sudo apt-get -y update# finally, install dockersudo apt-get -y install docker-ce
或使用我的:
wget -O - -q 'https://gist.githubusercontent.com/allenday/c875eaf21a2b416f6478c0a48e428f6a/raw/f7feca1acc1a992afa84f347394fd7e4bfac2599/install-docker-ce.sh' | sudo bash
從 deb 檔案安裝 nvidia-docker(https://github.com/NVIDIA/nvidia-docker/releases/):
wget https://github.com/NVIDIA/nvidia-docker/releases/download/v1.0.1/nvidia-docker_1.0.1-1_amd64.deb
從 Docker 容器確認 GPU 是可用的
起始化 nvidia-docker-plugin 需要在跟許可權下執行:
sudo nvidia-docker-plugin &
nvidia-docker-plugin | 2017/06/07 01:05:05 Loading NVIDIA unified memorynvidia-docker-plugin | 2017/06/07 01:05:05 Loading NVIDIA management librarynvidia-docker-plugin | 2017/06/07 01:05:08 Discovering GPU devicesnvidia-docker-plugin | 2017/06/07 01:05:08 Provisioning volumes at /var/lib/nvidia-docker/volumesnvidia-docker-plugin | 2017/06/07 01:05:08 Serving plugin API at /run/docker/pluginsnvidia-docker-plugin | 2017/06/07 01:05:08 Serving remote API at localhost:3476
現在確保 docker 容器可以看到 GPU:
sudo nvidia-docker run --rm nvidia/cuda nvidia-smi
如上圖所示,現在得到的表格和前面使用 nvidia-smi 命令,且沒有在 Docker 容器裡執行得到的表格是一樣的。
建立一個 Snapshot 卷
如果你跟著上面執行下來了,你可能注意到它需要花費一點時間。而當我們執行 GPU 例項時,那成本就比較大了。所以我們需要避免重複以上過程浪費時間和記憶體,我們可以將以上過程做一個整合,當我們需要啟動 GPU 時就可以直接使用。
登陸 Jupyter 和 TensorBoard
sudo nvidia-docker run --rm --name tf1 -p 8888:8888 -p 6006:6006 gcr.io/tensorflow/tensorflow:latest-gpu jupyter notebook --allow-root
上面命令可以展示為一個連結:
http://localhost:8888/?token=c8caba947dfd4c97414447c074325faf399cf8a157d0ce2f
最後尋找一個 GCE 例項的外部 IP 地址,並將它連線到埠 8888,即 http://EXTERNAL_IP:8888/,從你的控制檯鍵入類似的符號,現在你就擁有了一個可以在 GPU 上執行 TensorFlow 的 Jupyter notebook。