【Bioinfo Blog 014】【Shell】——亂七八糟各種各樣的命令記錄

1. 壓縮/解壓

1.1 .tar

-z : 使用 gzip 來壓縮和解壓檔案
-v : --verbose 詳細的列出處理的檔案
-f : --file=ARCHIVE 使用檔案檔案或裝置，這個選項通常是必選的
-c : --create 建立一個新的歸檔（壓縮包）
-x : 從壓縮包中解出檔案

1. 壓縮檔案 file1 和目錄 dir2 到 test.tar.gz

tar -zcvf test.tar.gz file1 dir2

2. 解壓 test.tar.gz（將 c 換成 x 即可）

tar -zxvf test.tar.gz

3. 列出壓縮檔案的內容

tar -ztvf test.tar.gz 

1.2 .zip

1. 壓縮檔案

zip -r test.zip file

2. 解壓檔案

unzip all.zip

1.3 .gz

1. 壓縮檔案

gzip file

2. 解壓檔案

gunzip file.gz

2. 程式管理

2.1 批量kill

dump為跑的命令，stu18230130為叢集中使用者的名字

ps -ef | grep dump | grep stu18230130 | awk '{print $2}' | while read id; do kill $id; done

2.2 檢視後臺程式

ps -a -o pid,pcpu,pmem,vsz,rss,tty,stat,start,time,comm,args,user

3. 文字操作

3.1 批量刪掉檔名前幾個字元

列出以.idat.gz結尾的檔案，{11}表示刪除前11個字元

for file in `ls *.idat.gz`;do mv $file `echo $file|sed 's/.\{11\}//'`;done;