RTK（The Reconstruction ToolKit）在Windows系統下的安裝

Zhehao1995發表於2020-12-14
StructWindows

RTK是基於ITK開發的一款開源包，主要是為了解決CT影像的重建問題，適用於常規CT/ fan-beam CT/ CBCT。

RTK使用C++作為底層語言，儘管現在也已經提供了Python介面，但並沒有將所有功能都提供，有時候還是需要完整安裝RTK，並以.exe的形式執行。儘管個人覺得RTK在CT重建中很強大，但因為不像numpy那種大眾的庫，還是花了很多時間看ITK的manual和各種資料，特總結備份 。

RTK在Windows下的安裝

準備工作

從Github網站clone ITK原始碼。
下載CMake
下載Visual Studio
個人目前使用CMake3.18.0和VS2019版本。

一些功能（如rtkextractshroudsignal）需要用到傅立葉變換，因此可能ITK還需要與FFTW共同使用，參考另一篇文章,可以從FFTW官網下載Precompiled DLLs.

開始安裝

  1. 如果要使用FFTW：

從FFTW下載壓縮包，e.g. 64-bit version: fftw-3.3.5-dll64.zip 之後，解壓到任意路徑下(不要放在ITK source code下，可能會出一些bug)。從開始選單開啟VS的命令框，
在這裡插入圖片描述
cd到FFTW的目錄下，使用以下命令生成相應的.lib檔案。

lib /machine:x64 /def:libfftw3-3.def
lib /machine:x64 /def:libfftw3f-3.def
lib /machine:x64 /def:libfftw3l-3.def
  1. 通過Cmake configure

在Windows下已經下載好的CMake-GUI, source code 位置就是ITK原始碼，再新建一個編譯的目標資料夾。點選Configure,
如果要使用FFTW， 勾選Advance，搜尋fft，開啟如下選項，並且將步驟1中的對應檔案地址配置進去：
在這裡插入圖片描述
同時，最重要的，還要勾選RTK模組，從而在安裝ITK時同步安裝RTK。可以取消BUILD_TESTING和BUILD_EXAMPLES以加快速度。
在這裡插入圖片描述
再次Configure–Generate。

  1. 通過VS 編譯。

完成前面步驟之後，ITK-build資料夾下會有ITK.sln檔案，開啟進入VS，右鍵Solution, Build Solution。
在這裡插入圖片描述
4. 測試。

以上是所有步驟完成之後就實現了ITK+RTK在Windows上的安裝，進入ITK-biuld>bin>Debug就可以看到已經有一些可執行的RTK application(.exe檔案)，通過命令列就可以進行嘗試執行。
在這裡插入圖片描述
為了FFTW的正常使用，可能還需要從FFTW資料夾中拷貝dll檔案（libfftw3f-3.dll，libfftw3-3.dll）到當前Debug目錄下。

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