SQL on file 工具

cainiao_M發表於2020-12-03

無論程式設計師,還是資料分析師或科研工作者,有很多人都會編寫SQL。無論單機上的access,還是區域網中的mysql 或雲環境中的Hadoop,也有很多平臺都支援SQL。經過半個多世紀的演化,SQL已是應用廣、成熟度高、使用方便的資料查詢語言。

但有時候資料在CSV/TSV/XLS之類的檔案裡,為了能繼續使用熟悉的SQL,我們不得不先把檔案匯入資料庫。這個過程很麻煩,要建立表結構、設定欄位名和資料型別、分配許可權,再等待載入。如果涉及多個檔案匯入,這個過程就會變成更為耗時耗力的重複勞動。檔案越多體積越大,還要應對錶空間不足的問題。有些檔案經常更新變化,就不得不反覆匯入,這都令人難以忍受。

更麻煩的是,還有些檔案就不能匯入資料庫,或者勉強匯入也沒法用,還不如用Python或JAVA等開發語言直接計算。常見的情況有:開頭或結尾的資料無用、分隔符不規範(不可見字元、雙字元)、文字格式不規範。比如一行對應多條記錄的情況:

| name,state,tripsSmith,Colorado,2020-01-02 2020-01-05 2010-02-03Jeff,Connecticut,2020-01-09Smith,Indiana,2020-01-21 2020-02-10 |

此外,大部分資料庫都不支援匯入xlsx,需要安裝Excel或第三方工具。安裝Excel的話,需要將xlsx轉為csv再匯入資料庫,煩;用第三方工具直接匯入的話,環境配置複雜,有的只支援xls,有的只支援低版本的xlsx,更煩。

總之,檔案入庫是個麻煩不斷的過程。

那麼,有沒有能直接針對檔案執行SQL的工具?

可以想象,如果能在檔案上直接執行SQL,就能避開入庫帶來的一切麻煩,大大提高工作效率。由此還能帶來更大的好處:再也不必為了計算檔案,而專門部署和維護一套資料庫系統。

優點如此顯著,工具自然不缺。

但先別高興太早。號稱能直接針對檔案執行SQL的工具,或多或少都會存在一些缺陷,有些缺陷還很致命。下面,讓我們先從最輕便的命令列工具開始,深挖一下各類工具的真實能力。

csvsql

既然是命令列工具,csvsql必然具備短小快捷的優點,比如帶列名的sales.csv檔案,按client列分組,對每組的amount列求和,只需在命令列簡單寫一句:

| D:\csvkit\csvsql\bin> csvsql –query “select client, sum(amount) from’sales’group by client” salse.csv |

遺憾的是,csvsql除了體積小、編寫SQL快捷之外,就只剩缺點了,其中最大的缺點是安裝配置複雜。csvsql本質上不是獨立程式,而是個Python指令碼,所以必須事先配置好Python環境,又因為許多功能依賴第三方,所以還要下載合適版本的函式庫。這些對程式設計師來說還算容易,但對資料分析師來說,就有點太為難了。

csvsql的第二大缺點是沒有自己的計算引擎。csvsql內建了一個SQLite資料庫,當我們敲完SQL後,csvsql先以IN-MEMORY模式啟動SQLite,然後默默建表,並將檔案全部載入到SQLite,接著把針對檔案的SQL翻譯成針對資料庫表的SQL,再執行翻譯後的SQL。

沒有自己的計算引擎,首先會導致SQL能力不足。csvsql必須根據SQLite的語法設計一套自己的SQL,還要將針對檔案的SQL翻譯成針對庫表的SQL,沒有強大的技術實力,自己設計的SQL就會趨於保守,翻譯的過程也很難面面俱到,所以csvsql丟失了很多基本功能,比如模糊查詢和日期函式,而這些功能SQLite原本是支援的。

沒有自己的計算引擎,還導致計算效能不足、檔案體積受限。每次執行SQL時,csvsql並非直接對檔案計算,而是多了一步匯入記憶體的過程,加上型別轉換,耗費的時間會相當可觀,因此計算效能較差。檔案從硬碟到記憶體後,體積會變大很多,如果檔案較大而機器記憶體較小,不僅載入時間漫長,還可能發生記憶體溢位,所以檔案不能太大。

歸根到底,上面兩大缺點是因為技術實力不行,所以,下面更多的缺點就不難理解了。

第三點:只支援文字檔案,不支援日常工作中很常見的Excel。

第四點:對文字格式要求太嚴。csvsql只能讀取最基本的CSV格式,如果要實現定義分隔符、跳過無用行、區分首行列名等常用功能,就只能藉助其它文字編輯工具進行預處理。如果開頭或結尾的資料無用、分隔符不規範(不可見字元、雙字元)、文字格式不規範,則須藉助Python、JAVA等開發語言進行預處理。

類似csvsql的命令列工具還有不少,比如textql、querycsv.py、q,這些工具雖然略有差異,但因為基本原理類似,所以上面的缺點一個都不少。

雖然命令列工具都沒有自己的計算引擎,但有一類工具一定有,那就是資料庫系統。下面讓我們看看HSQLDB,一款相當常見、且能直接針對檔案執行SQL的資料庫系統。

HSQLDB

資料庫本身就是技術實力的表現,所以HSQLDB不僅有自己的計算引擎,還提供了強大的SQL語法,無論關聯查詢、子查詢,還是模糊查詢、日期函式,HSQLDB一個都不少,這一點是命令列工具無法比擬的。

但安裝、管理、維護資料庫是一件很麻煩的事,尤其是維護,我們不僅要分配許可權、硬碟、記憶體、快取,還要配置各種各樣的複雜引數,這些工作對資料分析師來說相當困難。事實上,我們之所以希望在檔案上直接執行SQL,很重要的一個原因就是為了避開資料庫的維護。

不僅日常的維護和管理麻煩,在檔案上執行SQL時,操作步驟仍然複雜。

啟動HSQLDB的伺服器和客戶端(也可用第三方客戶端工具比如SQuirreL SQL)的命令格式就很複雜

| D:\jre1.8\bin>java –Xms128m –Xmx2403m -cp d:\hsql\hsqldb.jar org.hsqldb.server.Server -database.0 file: d:\hsql\database\demo -dbname.0 demoD:\jre1.8\bin>java -Xms128m -Xmx2403m -cp d:\hsql\hsqldb.jar org.hsqldb.util.DatabaseManager |

這東西,不熟悉java的非專業程式設計師都會望而生畏。

客戶端連線伺服器的引數配置也很複雜:

imagepng

還要執行多條預處理語句,包括刪除可能存在的表名、新建表結構、將檔案對應到表,才能真正執行SQL。其中,將檔案對應到資料庫表時,需配置大量引數,如下:

| SET TABLE sales SOURCE “sales.csv;fs=,;encoding=UTF-8;quoted=false;ignore_first=true; cache_scale=100”; |

除了操作過程複雜,HSQLDB還有很多不合理之處。HSQL不支援自動解析資料型別,把這個麻煩扔給了使用者,讓使用者自己建表結構。為了方便使用,很多檔案的首行都是欄位名,尤其是csv,但HSQLDB要求使用者建表結構並指定欄位名,這就導致檔案首行的欄位名完全無用。我們的啟動方式明明是server而不是in-memory,但HSQLDB卻會把檔案事先快取到記憶體,這就會影響整體效能,尤其是檔案較大時。

可以看到,HSQLDB雖然有自己的計算引擎,但底層核心仍然是資料庫表,並非真正的檔案計算引擎,所以才會出現諸多不合理之處。由於缺乏真正的檔案計算引擎,所以HSQLDB不支援Excel,不支援常見的文字格式,更不支援不規範的文字格式等等。

與HSQLDB類似,H2 database和PostgreSQL也可以針對檔案執行SQL,操作過程雖然迥異,但基本原理沒大區別,所以優點缺點如出一轍,這裡不再贅述。

資料庫缺乏真正的檔案計算引擎,而且從安裝管理到配置執行都很複雜,那有沒有既有檔案計算引擎,還有友好的互動介面,可大幅降低使用難度的桌面工具呢?還真有,下面會講到。

OpenOffice Base

作為桌面工具,OpenOffice Base的易用性令人印象深刻:一鍵安裝,即安即用無須配置;介面友好,操作快捷互動流暢。

不僅外表易用,OpenOffice Base的核心也很強大,因為它有真正的檔案計算引擎,可以對檔案直接計算,而不必將檔案載入到其他資料庫,也不必用資料庫引擎計算檔案。這就帶來了三個明顯的改進:自動識別檔案中的資料型別,可計算超過記憶體的大檔案,整體效能大幅提高。

可惜的是,這個檔案計算引擎並不完善。

第一,OpenOffice Base只支援文字檔案,不支援日常工作中很常用的Excel,這就大大限制了使用場景。

第二,OpenOffice Base的SQL能力極為有限,很多基本功能無法實現,比如下面的關聯查詢:

| select employee.name, sales.orderdate, sales.amount from sales left join employee on sales.sellerid= employee.eid |

第三,對文字格式限制過多。

除了預設格式,不支援任何其他格式的資料型別,比如下面特殊格式的日期:

| orderid,client,sellerid,amount,orderdate1,UJRNP,17,392.0,01-01-20122,SJCH,6,4802.0,31-01-2012 |

不支援特殊分隔符,比如下面的格式:

| orderid||client||sellerid||amount||orderdate1||UJRNP||17||392.0||2012-01-012||SJCH||6||4802.0||2012-01-31 |

複雜情況就更不能處理了,比如下面的格式:

| producer: allen date:2013-11-01 //前兩行無用26 //以下為多行記錄TAS 1 2142.42009-08-05 33DSGC 1 613.22009-08-14 |

如果對格式標準的文字檔案進行最基本的查詢,OpenOffice Base是首選工具,但實際工作和理想環境不同。在實際工作中,我們會經常遇到Excel,文字格式總是各式各樣,SQL演算法也應自由靈活。如何才能在實際工作中對檔案執行SQL呢?那當然是檔案計算引擎較為完善的工具了,準確地說,是下面要講到的程式語言整合元件。

Microsoft text/xls driver

作為實力大廠出品的程式語言整合元件,Microsoft text/xls driver幾乎無所不能。在SQL語法方面,該元件不僅支援模糊查詢、日期函式,也支援子查詢和關聯查詢,基本覆蓋實際工作所能遇到的各種演算法。比如關聯兩個csv檔案:

| select client.clientname, sales.orderdate, sales.amount from [sales.csv] as sales left join [client.csv] as client on sales.clientid=client.clientid |

檔案型別方面,該元件不僅支援TXT/CVS/TVS,也支援XLS/XLSX,而且沒有版本限制,這一點在實際工作中非常便利。

對於常見的文字格式,該元件支援得非常好,比如定義分隔符、區分首行列名、設定固定寬度的列、自動識別資料型別。對於複雜的文字格式,該元件雖然不能直接處理,但能通過程式設計間接計算。理論上來說,程式設計師可用該元件讀取任何文字格式,可實現任意業務演算法。

Microsoft text/xls driver的檔案計算引擎較為完善,從能力上來說缺陷很少,但它是程式設計師的專業工具,並不適合資料分析師。

第一,該元件的技術門檻很高,要想正常使用,必須掌握一門程式語言,比如C#或VB。在熟悉程式語言的基礎上,還需要學會ODBC、OLEDB、ADO這三種具體的程式設計介面之一。

第二,該元件需要編寫大量難懂的程式碼,才能真正執行上面的提到的SQL語句。簡化後程式碼如下:

| string path= string.Empty;path=”d:/data”;if (string.IsNullOrWhiteSpace(path)) return null;string connstring = string.Empty;connstring = “Provider=Microsoft.ACE.OLEDB.12.0;Data Source=” + path + “;Extended Properties=’text;HDR=YES;FMT=Delimited’;”;DataSet ds = null;OleDbConnection conn = null;try{conn = new OleDbConnection(connstring); conn.Open();OleDbDataAdapter myCommand = null;myCommand = new OleDbDataAdapter(strSql, connstring);//在這裡執行**SQL**ds = new DataSet();myCommand.Fill(ds, “table1”);}catch (Exception e){ throw e;}finally{ conn.Close();}return ds; |

第三,該元件擴充套件困難。上面的程式碼只能適用於最規範的文字檔案,如果要定義字串格式或資料型別,還需使用schema.ini配置檔案。如果要解析複雜的文字格式,還需額外編寫大量程式碼。

除此之外, Microsoft text/xls driver還存在一個問題:text driver和xls drvier雖然用法類似,卻是兩個獨立的元件。換句話說,文字檔案和Excel之間不能進行關聯計算,除非額外編寫大量程式碼。

與Microsoft text/xls driver類似,CSVJDBC/ExcelJDBC、SpatiaLite也是支援在檔案上直接執行SQL的程式語言整合元件,雖然語言環境不同,但基本原理類似,所以使用難度都很高。而且這兩種元件不是實力大廠的產品,比起Microsoft text/xls driver要差上不少。

Microsoft text/xls driver的檔案計算引擎雖然完善,但使用難度很高。OpenOffice Base易用,但檔案計算引擎不夠完善。那有沒有兼具二者優點,適合資料分析師使用的工具呢?要求苛刻,中者寥寥,目前只發現下面這麼一款產品。

esProc

與OpenOffice Base類似,esProc是易用的桌上型工具,一鍵安裝無需配置。比OpenOffice更易用的是,esProc可以在單元格直接編寫多條SQL,計算結果和SQL直接呈現在同一介面,點選SQL所在的單元格可切換觀察計算結果。

與Microsoft text/xls driver類似,esProc具有完善的計算引擎,可支援實際工作所能遇到的各種SQL語法(見上圖),這是OpenOffice Base做不到的。

檔案型別方面,esProc支援TXT/CVS/TVS,也支援不同版本的XLS/XLSX。比Microsoft text/xls driver更強大的是,esProc可以直接對文字檔案和Excel進行關聯計算(見上圖)。

除了規範的檔案格式外,esProc還可以利用擴充套件函式應用更復雜的情況。比如分隔符為”||”的檔案,OpenOffice Base無法解析,Microsoft text/xls driver要編寫大量程式碼,而esProc只需在SQL中使用擴充套件函式:

| $select * from {file(“sep.txt”).import@t(;,”||”)} |

esProc可自動識別資料型別,對於非預設格式的資料,比如前面提到的特殊日期,OpenOffice Base無法解析,Microsoft text/xls driver需用schema.ini配合程式碼實現,而esProc只要使用簡單的擴充套件函式就能輕鬆應對:

| $select * from{file(“style.csv”).import@ct(orderid,client,sellerid,amount,orderdate:date:”dd-MM-yyyy”)} |

格式複雜的文字,比如前面提到的一行文字對應多條記錄的情況,OpenOffice Base無法解析,Microsoft text/xls driver需資深程式設計師編寫大量複雜程式碼,而使用擴充套件函式後esProc也不難處理:

| $select * from{file(“trip.csv”).import@tc().news(trips.array(“ “);name,state,~:trip)} |

分析過十幾種工具之後,我們可以得出最終結論:號稱支援檔案上直接執行SQL的工具中,絕大多數只是徒有其表,真正可用的其實只有Microsoft text/xls driver和esProc,前者只適合程式設計師,後者才適合資料分析師。

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