CentOS 下 R 的安裝

 

相比Windows 下的安裝，Linux 作業系統中可以使用原始碼安裝，由於相關元件的依賴性，所以安裝起來會麻煩點， 但由於網路上資料甚多，因此也不太複雜。

一、R 語言環境的安裝

1. 下載R的原始碼，可以在 ,獲取最新版的R 程式碼，寫文件的時候，版本為R-3.3.0

wget

2. 解壓

Cd /usr/

tar -zxvf R-3.3.0.tar.gz

cd R-3.3.0

3. 安裝一些依賴包和配置

sudo yum install readline-devel

sudo yum install libXt-devel

./configure  --enable-R-shlib --prefix=/usr/ R-3.3.0 --with-readline=yes --with-libpng=yes

在實際過程中，由於CentOS  環境不同， 還需安裝其它一些包，否則configure 會出現一系列報錯， 當出現問題時， 執行相應命令後，可再執行上面的configure 命令  例如：

⑴ 當出現：

　configure: error: C++ preprocessor “/lib/cpp” sanity check

check See `config.log’ for more details

這可能是由於c++編譯器的相關package沒有安裝，執行：

sudo yum install glibc-headers gcc-c++

如果不放心，也可加上：

sudo yum install build-essential

⑵ 當出現：

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages

configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals

可執行：

sudo  yum  install texinfo

sudo   yum install texlive

⑶當出現：

configure: WARNING: neither inconsolata.sty nor zi4.sty found: PDF vignettes and package manuals will not be rendered optimally

configure: error: bzip2 library and headers are required

可執行：

 sudo yum  install bzip2-devel

sudo  yum  install bzip2-libs

⑷ 當出現

WARNING: neither inconsolata.sty nor zi4.sty found: PDF vignettes and package manuals will not be rendered optimally

執行：

wget

解壓 ：Unzip inconsolata.zip

將檔案複製到目錄下：

        cp -Rfp inconsolata/* /usr/share/texmf/

 重新整理sty ：

        Mktexlsr

⑸ 當出現:

configure: error: "liblzma library and headers are required"

執行：

sudo  yum -y install xz-devel.x86_64

⑹當出現:

configure: error: pcre >= 8.10 library and headers are required

執行：

sudo  yum install pcre-devel.x86_64  pcre-static.x86_64 pcre-tools.x86_64 pcre.x86_64

⑺當出現:

configure: error: libcurl >= 7.28.0 library and headers are required with support for https

執行：

sudo  yum install  libcurl-devel.x86_64 libcurl.x86_64

⑻ 以下是我沒遇到但其它材料提到的：

# sudo  yum install gcc-gfortran              #否則報”configure: error: No F77 compiler found”錯誤

# sudo  yum install gcc gcc-c++              #否則報”configure: error: C++ preprocessor “/lib/cpp” fails sanity check”錯誤

# sudo  yum install readline-devel          #否則報”–with-readline=yes (default) and headers/libs are not available”錯誤

# sudo  yum install libXt-devel                 #否則報”configure: error: –with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available”錯誤

4. 編譯和安裝

make

make install

在make 過程中，如果出現Unable to compile a JNI program ， 忽略，目前還沒遇到問題

5環境配置

為了能在任何環境下執行R ,有兩種方法，一是

vi .bash_profile

PATH=/usr/R-3.0.1/bin

二是ln -s /usr/R-3.3.0/bin/R /usr/local/bin/R

6 . 測試

輸入R  看是否可以出現命令列視窗

二、 配置R Studio Server

1.  安裝

$ wget

$ sudo yum install --nogpgcheck rstudio-server-rhel-0.99.903-x86_64.rpm

在本地執行:   看是否可以出現登入介面， 可以使用linux 中自定義的使用者來登入

2. 開啟防火牆

$ sudo firewall-cmd --zone=public --add-port=8787/tcp --permanent

$ sudo firewall-cmd –reload