分散式入門,怎樣用PyTorch實現多GPU分散式訓練

機器之心發表於2019-05-01
這篇文章旨在闡述訓練大規模深度學習模型時的分散式計算思想。

具體來講,本文首先介紹了分散式計算的基本概念,以及分散式計算如何用於深度學習。然後,列舉了配置處理分散式應用的環境的標準需求(硬體和軟體)。最後,為了提供親身實踐的經驗,本文從理論角度和實現的角度演示了一個用於訓練深度學習模型的分散式演算法(同步隨機梯度下降,synchronous SGD)。

何為分散式計算

分散式計算指的是一種編寫程式的方式,它利用網路中多個連線的不同元件。通常,大規模計算通過以這種方式佈置計算機來實現,這些計算機能夠並行地處理高密度的數值運算。在分散式計算的術語中,這些計算機通常被稱為節點(node),這些節點的集合就是叢集。這些節點一般是通過乙太網連線的,但是其他的高頻寬網路也可以利用分散式架構的優勢。

深度學習如何從分散式計算中受益?

作為深度學習的主力,神經網路出現在文獻中已經有一段時間了,但是直到最近,才有人完全利用它的潛力。神經網路異軍突起的主要原因之一就是巨大的算力,這正是我們在本文中要寫的內容。深度學習需要基於大量資料訓練深度神經網路,它包含大量的引數分散式計算是能夠充分利用現代硬體的完美工具。下面是它的核心思想:

精心設計的分散式演算法可以做到:

  1. 為了連貫處理,在多個節點上「分配」計算(深度學習模型中的前向傳播和反向傳播)和資料。

  2. 為了實現一致性,它能夠在多個節點上建立一種有效的「同步」。

MPI:分散式計算標準

你還必須習慣另一個術語——訊息傳遞介面(MPI)。MPI 幾乎是所有分散式計算的主力。MPI 是一個開放標準,它定義了一系列關於節點互相通訊的規則,MPI 也是一個程式設計模型/API。MPI 不是一款軟體或者工具,它是一種規範。

1991 年夏天,一批來自學術界和產業界的組織和個人聚在一起,最終建立了 MPI 論壇(MPI Forum)。該論壇達成了一個共識,為一個庫起草了語法和語義規範,為不同硬體提供商提出可移植/靈活/優化的實現提供指導。多家硬體提供商都有自己的 MPI 實現——OpenMPI、MPICH、MVAPICH、Intel MPI 等。

在這份教程中,我們將會使用 Intel MPI,因為它十分高效,而且也針對 Intel 平臺做了優化。原始的 Intel MPI 是一個 C 語言庫,並且級別非常低。

配置

對分散式系統而言,合適的配置是非常重要的。如果沒有合適的硬體和網路佈置,即使你對它的程式設計模型有著概念上的理解,也是沒多大用的。下面是需要做的關鍵佈置:

  1. 通常需要由一系列通過通用網路互聯形成叢集的節點。推薦使用高階伺服器作為節點,以及高頻寬的網路,例如 InfiniBand。

  2. 叢集中的所有節點都需要具有完全相同使用者名稱的 Linux 系統。

  3. 節點之間必須擁有無密碼 SSH 連線,這對無縫連線至關重要。

  4. 必須安裝一種 MPI 實現。本文只聚焦於 Intel MPI。

  5. 需要一個共同的檔案系統,它對所有的節點都是可見的,而且分散式應用必須駐留在上面。網路檔案系統(NFS,Network Filesystem)是實現此目的一種方式。

並行策略的型別

並行深度學習模型有兩種流行的方式:

  1. 模型並行

  2. 資料並行

模型並行

模型並行指的是一個模型從邏輯上被分成了幾個部分(例如,一些層在一部分,其他層在另一部分),然後把它們部署在不同的硬體/裝置上。

儘管從執行時間上來看,將模型的不同部分部署在不同裝置上確實有好處,但是它通常是出於避免記憶體限制才使用。具有特別多引數的模型會受益於這種並行策略,因為這類模型需要很高的記憶體佔用,很難適應到單個系統。

資料並行

另一方面,資料並行指的是,通過位於不同硬體/裝置上的同一個網路的多個副本來處理資料的不同批(batch)。不同於模型並行,每個副本可能是整個網路,而不僅僅是一部分。

正如你可能猜到的,這種策略隨著資料的增長可以很好地擴充套件。但是,由於整個網路必須部署在一個裝置上,因此可能無法幫助到具有高記憶體佔用的模型。下圖應該可以說清楚這個問題。

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模型並行 VS 資料並行

實際上,在大組織裡,為了執行生產質量的深度學習訓練演算法,資料並行更加流行也更加常用。所以,本教程主要介紹資料並行。

torch.distributed API

PyTorch提供了一個非常優雅並且易於使用的 API,作為用 C 語言寫的底層 MPI 庫的介面。PyTorch 需要從原始碼編譯,並且必須與安裝在系統中的 Intel MPI 進行連結。我們現在就看一下 torch.distributed 的基本用法,以及如何執行它。

# filename 'ptdist.py'
import torch
import torch.distributed as dist

def main(rank, world):
    if rank == 0:
        x = torch.tensor([1., -1.]) # Tensor of interest
        dist.send(x, dst=1)
        print('Rank-0 has sent the following tensor to Rank-1')
        print(x)
    else:
        z = torch.tensor([0., 0.]) # A holder for recieving the tensor
        dist.recv(z, src=0)
        print('Rank-1 has recieved the following tensor from Rank-0')
        print(z)

if __name__ == '__main__':
    dist.init_process_group(backend='mpi')
    main(dist.get_rank(), dist.get_world_size())

點對點通訊

用 mpiexec 執行上面的程式碼,能夠得到一個分散式程式排程器,基於任何標準 MPI 實現都可以,結果如下:

cluster@miriad2a:~/nfs$ mpiexec -n 2 -ppn 1 -hosts miriad2a,miriad2b python ptdist.py
Rank-0 has sent the following tensor to Rank-1
tensor([ 1., -1.])
Rank-1 has recieved the following tensor from Rank-0
tensor([ 1., -1.])
  1. 第一行要被執行的是 dist.init_process_group(backend),它基本上設定了參與節點之間的內部通訊通道。它使用了一個引數來指定使用哪個後端(backend)。因為我們完全使用 MPI,所以在我們的例子中 backend='mpi'。也有其他的後端(例如 TCP、Gloo、NCCL)。

  2. 需要檢索的兩個引數——world size 和 rank。World 指的是在特定 mpiexec 呼叫環境中所有節點的集合(參見 mpiexec 中的 -hosts flag)。rank 是由 MPI 執行時為每一個程式分配的唯一整數。它從 0 開始。它們在 -hosts 中被指定的順序用於分配數值。所以,在這個例子中,節點「miriad2a」上的程式會被賦值 Rank 0,節點「miriad2b」上的程式會被賦值為 Rank 1.

  3. x 是 Rank 0 打算髮送到 Rank 1 的張量,通過 dist.send(x, dst=1) 完成。

  4. z 是 Rank 1 在接收到張量之前就建立的東西。我們需要一個早就建立好的同維度的張量作為接收傳送來的張量的佔位符。z 的值最終會被 x 替代。

  5. 與 dist.send(..) 類似,負責接收的對應函式是 dist.recv(z, src=0),它將張量接收到 z。

通訊集體

我們在上一部分看到的是一個「點對點」通訊的例子,在給定的環境中,rank(s) 將資料傳送到特定的 rank(s)。儘管這種通訊是有用的,因為它對通訊提供了細粒度的控制,但是還有其他被經常使用的標準通訊模式,叫作集體(collectives)。下面介紹了 Synchronous SGD 演算法中我們感興趣的一個集體——all-reduce 集體。

ALL-REDUCE 集體

All-reduce 是一種同步通訊方式,所有的 ranks 都被執行了一個 reduction 運算,並且得到的結果對所有的 ranks 都是可見的。下圖介紹了這個思想(將求和作為 reduction 運算)。

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all-reduce 集體

def main(rank, world):
    if rank == 0:
        x = torch.tensor([1.])
    elif rank == 1:
        x = torch.tensor([2.])
    elif rank == 2:
        x = torch.tensor([-3.])

    dist.all_reduce(x, op=dist.reduce_op.SUM)
    print('Rank {} has {}'.format(rank, x))

if __name__ == '__main__':
    dist.init_process_group(backend='mpi')
    main(dist.get_rank(), dist.get_world_size())

PyTorch 中 all-reduce 集體的基本用法

在 world of 3 環境中啟動時,結果如下:

cluster@miriad2a:~/nfs$ mpiexec -n 3 -ppn 1 -hosts miriad2a,miriad2b,miriad2c python ptdist.py
Rank 1 has tensor([0.])
Rank 0 has tensor([0.])
Rank 2 has tensor([0.])
  1. if rank == <some rank> … elif 是我們在分散式計算中多次遇到的模式。在這個例子中,它被用來在不同的 rank 上建立張量

  2. 它們一起執行了 all-reduce(可以看見,dist.all_reduce(..) 在 if … elif block 邏輯塊的外部),求和 (dist.reduce_op.SUM) 作為 reduction 運算。

  3. 將來自每個 rank 的 x 求和,再把得到的求和結果放置在每個 rank 的 x 內。

轉向深度學習

假設讀者熟知標準的隨機梯度下降演算法(SGD),該演算法常用於訓練深度學習模型。我們現在看到的是 SGD 的一個變體——同步 SGD(synchronous SGD),它利用 all-reduce collective 來進行擴充套件。我們先從標準 SGD 的數學公式開始吧。

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其中 D 是一個樣本集合(mini-batch),θ 是所有引數的集合,λ 是學習率,Loss(X, y) 是某個損失函式在 D 中所有樣本上的均值。

同步 SGD 所依賴的核心技巧是將更新規則中的求和在更小的 (mini)batch 子集上進行分割。D 被分割成 R 個子集 D₁, D₂, . .(推薦每個子集具有相同數量的樣本),所以 分散式入門,怎樣用PyTorch實現多GPU分散式訓練 將標準的 SGD 更新公式中的求和進行分割,得到:

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現在,因為梯度運算元在求和運算元上是分散式的,所以我們得到:

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我們從中得到了什麼?

看一下上面方程中單獨的梯度項(方括號裡面)。它們現在可以被獨立地計算,然後加起來得到原始的梯度,而且沒有任何損失/近似。這就是資料並行。下面是整個過程:

  1. 將整個資料集分成 R 個等大的資料塊(子集)。這裡的字母 R 代表的是 replica(副本)。

  2. 使用 MPI 啟動 R 個程式/rank,將每個程式繫結到一個資料塊上。

  3. 讓每個 rank 使用大小為 B 的 mini-batch(dᵣ)(dᵣ來自該 rank 分配到的資料塊 D_r)計算梯度,即 rank r 計算 分散式入門,怎樣用PyTorch實現多GPU分散式訓練 。

  4. 將所有 rank 的梯度進行求和,然後將得到的梯度對每個 rank 可見,再進行進一步處理。

最後一點就是 all-reduce 演算法。所以,每次在所有 rank 使用大小為 B 的 mini-batch(dᵣ)計算完梯度以後,都必須執行 all-reduce。需要注意的一點是,將全部 R 個 rank(使用大小為 B 的 mini-batch 計算出)的梯度相加之後會得到一個有效的批大小:

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下面是實現的關鍵部分(沒有展示樣板程式碼):

model = LeNet()
# first synchronization of initial weights
sync_initial_weights(model, rank, world_size)

optimizer = optim.SGD(model.parameters(), lr=1e-3, momentum=0.85)

model.train()
for epoch in range(1, epochs + 1):
    for data, target in train_loader:
        optimizer.zero_grad()
        output = model(data)
        loss = F.nll_loss(output, target)
        loss.backward()

        # The all-reduce on gradients
        sync_gradients(model, rank, world_size)

        optimizer.step()

def sync_initial_weights(model, rank, world_size):
    for param in model.parameters():
        if rank == 0:
            # Rank 0 is sending it's own weight
            # to all it's siblings (1 to world_size)
            for sibling in range(1, world_size):
                dist.send(param.data, dst=sibling)
        else:
            # Siblings must recieve the parameters
            dist.recv(param.data, src=0)


def sync_gradients(model, rank, world_size):
    for param in model.parameters():
        dist.all_reduce(param.grad.data, op=dist.reduce_op.SUM)
  1. 全部 R 個 rank 都使用隨機權重建立自己的模型副本。

  2. 單個具有隨機權重的副本可能導致在初始的時候不同步。推薦在所有的副本上同步初始權重,sync_initial_weights(..) 就是在做這件事。讓任何一個 rank 將自己的權重傳送到它的兄弟 rank,兄弟 rank 必須接收這些權重並用來初始化它們自身。

  3. 從每個 rank 對應的資料部分取出一個 mini-batch(大小為 B),計算前向和反向傳遞(梯度)。作為配置的一部分,這裡需要重點注意的一點是:所有的程式/rank 應該讓自己那部分資料可見(通常是在自己的硬碟上或者在共享檔案系統中)。

  4. 把求和作為 reduction 運算,對每一個副本上的梯度執行 all-reduce 集體。sync_gradients(..) 會完成梯度同步。

  5. 梯度同步之後,每個副本能夠在自己的權重上獨立地執行標準的 SGD 更新。optimizer.step() 正常執行。

現在問題來了:我們如何確保獨立的更新保持同步?

我們看一下更新方程的首次更新:

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上面的第 2 點和第 4 點保證每個初始權重和梯度都是同步的。顯然,它們的線性組合也是同步的(λ 是常數)。以後的所有更新都是類似的邏輯,因此也是同步的。

效能對比

所有分散式演算法的最大瓶頸就是同步。只有當同步時間顯著小於計算時間的時候,分散式演算法才是有益的。讓我們在標準 SGD 和同步 SGD 之間做一個簡單的對比,來看一下什麼時候後者是比較好的。

定義:我們假設整個資料集的規模為 N。網路處理大小為 B 的 mini-batch 需要花費時間 Tcomp。在分散式情況下,all-reduce 同步花費的時間為 Tsync。

對於非分散式(標準)SGD,每個 epoch 花費的時間為:

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對於同步 SGD,每個 epoch 花費的時間為:

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因此,對於分散式環境,為了與非分散式環境相比有顯著的優勢,我們需要滿足:

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我們可以調整影響上述不等式的三個因子,從分散式演算法中得到更多的好處。

  1. 通過以高頻寬的快速網路連線節點,來減小 Tsync。

  2. 通過增加批大小 B,來增加 Tcomp。

  3. 通過連線更多的節點和擁有更多的副本來增加 R。

本文清晰地介紹了深度學習環境中的分散式計算的核心思想。儘管同步 SGD 很流行,但是也有其他被頻繁使用的分散式演算法(如非同步 SGD 及其變體)。然而,更重要的是能夠以並行的方式來思考深度學習方法。請注意,不是所有的演算法都可以開箱即用地並行化,有的需要做一些近似處理,這破壞了原演算法給出的理論保證。能否高效處理這些近似,取決於演算法的設計者和實現者。

原文地址:https://medium.com/intel-student-ambassadors/distributed-training-of-deep-learning-models-with-pytorch-1123fa538848

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