【機器學習】--譜聚類從初始到應用

LHBlog發表於2018-04-06
機器學習聚類

一、前述

    譜聚類（spectral clustering）是一種基於圖論的聚類方法，主要思想是把所有的資料看做空間中的點，這些點之間可以用邊連線起來。距離較遠（或者相似度較低）的兩個點之間的邊權重值較低，而距離較近（或者相似度較高）的兩個點之間的邊權重值較高，通過對所有資料點組成的圖進行切圖，讓切圖後不同的子圖間邊權重和儘可能的低，而子圖內的邊權重和儘可能的高，從而達到聚類的目的。

二、具體原理

1、優點
譜聚類相較於前面講到的最最傳統的k-means聚類方法，譜聚類又具有許多的優點：

1.只需要待聚類點之間的相似度矩陣就可以做聚類了。

2.對於不規則的資料（或者說是離群點）不是那麼敏感。

3.k-means聚類演算法比較適合於凸資料集（資料集內的任意兩點之間的連線都在該資料集以內，簡單理解就是圓形，可能不準確），而譜聚類則比較通用。

2、相關概念

相似度矩陣S的構建

構建相似度的矩陣的過程中，可以使用歐氏距離、餘弦相似度、高斯相似度等來計算資料點之間的相似度，選用哪個要根據你自己的實際情況來。不過在譜聚類中推薦使用的是高斯相似度，但是我在我的工程中使用的是餘弦相似度。

拉普拉斯矩陣
 它的定義很簡單，拉普拉斯矩陣。是度矩陣，也就是相似度矩陣的每一行（或者每一列）加和得到的一個對角矩陣。W就是圖的鄰接矩陣。

相似矩陣

鄰接矩陣，它是由任意兩點之間的權重值組成的矩陣。通常我們可以自己輸入權重，但是在譜聚類中，我們只有資料點的定義，並沒有直接給出這個鄰接矩陣，那麼怎麼得到這個鄰接矩陣呢？
基本思想是，距離較遠的兩個點之間的邊權重值較低，而距離較近的兩個點之間的邊權重值較高，不過這僅僅是定性，我們需要定量的權重值。一般來說，我們可以通過樣本點距離度量的相似矩陣來獲得鄰接矩陣。

構建鄰接矩陣的方法有三類。-鄰近法，K鄰近法和全連線法。

　　　　對於-鄰近法，它設定了一個距離閾值，然後用歐式距離度量任意兩點和的距離。即相似矩陣的,  然後根據和的大小關係，來定義鄰接矩陣如下：

　　　　從上式可見，兩點間的權重要不就是,要不就是0，沒有其他的資訊了。距離遠近度量很不精確，因此在實際應用中，我們很少使用-鄰近法。

　　　　第二種定義鄰接矩陣的方法是K鄰近法，利用KNN演算法遍歷所有的樣本點，取每個樣本最近的k個點作為近鄰，只有和樣本距離最近的k個點之間的。但是這種方法會造成重構之後的鄰接矩陣W非對稱，我們後面的演算法需要對稱鄰接矩陣。為了解決這種問題，一般採取下面兩種方法之一：

　　　　第一種K鄰近法是隻要一個點在另一個點的K近鄰中，則保留

　　　　第二種K鄰近法是必須兩個點互為K近鄰中，才能保留

　　　　第三種定義鄰接矩陣的方法是全連線法，相比前兩種方法，第三種方法所有的點之間的權重值都大於0，因此稱之為全連線法。可以選擇不同的核函式來定義邊權重，常用的有多項式核函式，高斯核函式和Sigmoid核函式。最常用的是高斯核函式RBF，此時相似矩陣和鄰接矩陣相同：
　　　　在實際的應用中，使用第三種全連線法來建立鄰接矩陣是最普遍的，而在全連線法中使用高斯徑向核RBF是最普遍的。

3、演算法流程：

               輸入：樣本集D=，相似矩陣的生成方式, 降維後的維度, 聚類方法，聚類後的維度

　　　　輸出： 簇劃分

　　　　1) 根據輸入的相似矩陣的生成方式構建樣本的相似矩陣S

　　　　2）根據相似矩陣S構建鄰接矩陣W，構建度矩陣D

　　　　3）計算出拉普拉斯矩陣L

　　　　4）求L的最小的個特徵值所各自對應的特徵向量

　　　　6) 將特徵向量組成維的特徵矩陣F

　　　　7）對F中的每一行作為一個維的樣本，共n個樣本，用輸入的聚類方法進行聚類，聚類維數為。

　　　　8）得到簇劃分

4、總結

譜聚類演算法是一個使用起來簡單，但是講清楚卻不是那麼容易的演算法，它需要你有一定的數學基礎。如果你掌握了譜聚類，相信你會對矩陣分析，圖論有更深入的理解。同時對降維裡的主成分分析也會加深理解。   

譜聚類演算法的主要優點有：
　　　　1）譜聚類只需要資料之間的相似度矩陣，因此對於處理稀疏資料的聚類很有效。這點傳統聚類演算法比如K-Means很難做到
　　　　2）由於使用了降維，因此在處理高維資料聚類時的複雜度比傳統聚類演算法好
譜聚類演算法的主要缺點有：
　　　　1）如果最終聚類的維度非常高，則由於降維的幅度不夠，譜聚類的執行速度和最後的聚類效果均不好。
　　　　2) 聚類效果依賴於相似矩陣，不同的相似矩陣得到的最終聚類效果可能很不同。

三、程式碼

 

 

# !/usr/bin/python
# -*- coding:utf-8 -*-

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.colors
from sklearn.cluster import spectral_clustering
from sklearn.metrics import euclidean_distances


def expand(a, b):
    d = (b - a) * 0.1
    return a-d, b+d


if __name__ == "__main__":
    matplotlib.rcParams['font.sans-serif'] = [u'SimHei']
    matplotlib.rcParams['axes.unicode_minus'] = False

    t = np.arange(0, 2*np.pi, 0.1)
    data1 = np.vstack((np.cos(t), np.sin(t))).T
    data2 = np.vstack((2*np.cos(t), 2*np.sin(t))).T
    data3 = np.vstack((3*np.cos(t), 3*np.sin(t))).T
    data = np.vstack((data1, data2, data3))

    n_clusters = 3
    m = euclidean_distances(data, squared=True)
    sigma = np.median(m)

    plt.figure(figsize=(12, 8), facecolor='w')
    plt.suptitle(u'譜聚類', fontsize=20)
    clrs = plt.cm.Spectral(np.linspace(0, 0.8, n_clusters))
    for i, s in enumerate(np.logspace(-2, 0, 6)):
        print(s)
        af = np.exp(-m ** 2 / (s ** 2)) + 1e-6
        y_hat = spectral_clustering(af, n_clusters=n_clusters, assign_labels='kmeans', random_state=1)
        plt.subplot(2, 3, i+1)
        for k, clr in enumerate(clrs):
            cur = (y_hat == k)
            plt.scatter(data[cur, 0], data[cur, 1], s=40, c=clr, edgecolors='k')
        x1_min, x2_min = np.min(data, axis=0)
        x1_max, x2_max = np.max(data, axis=0)
        x1_min, x1_max = expand(x1_min, x1_max)
        x2_min, x2_max = expand(x2_min, x2_max)
        plt.xlim((x1_min, x1_max))
        plt.ylim((x2_min, x2_max))
        plt.grid(True)
        plt.title(u'sigma = %.2f' % s, fontsize=16)
    plt.tight_layout()
    plt.subplots_adjust(top=0.9)
    plt.show()

 

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