FastQ檔案格式
fastq格式是生物資訊分析中最常見的格式之一
- 通常我們可以將測序的資料分為
雙端測序和單端測序雙端測序的資料含有兩個fastq格式的檔案，單端測序的資料只有一個fastq格式的檔案
fastq格式的檔案詳解如下圖：
主要分為四行 - 第一行是用來區分不同reads的一個ID號，一般以
@符號開頭，這一行是用來區分不同的reads，而這一行本身包含了很多的資訊。
- Read Record Header
- Flow Cell ID
- Lane
- Tile
- Tile Coordinates
- Barcode
- 第二行是測序的序列，也就是reads的序列
- 第三行一般是一個
+號，或者與第一行的資訊相同 -
第四行是鹼基質量值，是對第二行序列的鹼基的準確性的描述，一個鹼基會對應一個鹼基質量值，所以這一行和第二行長度是一樣的，如果不一樣就說明資料有問題
圖片.png
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