FastQ檔案格式
fastq格式是生物資訊分析中最常見的格式之一
- 通常我們可以將測序的資料分為
雙端測序
和單端測序
雙端測序的資料含有兩個fastq格式的檔案,單端測序的資料只有一個fastq格式的檔案
fastq格式的檔案詳解如下圖:
主要分為四行 - 第一行是用來區分不同reads的一個ID號,一般以
@
符號開頭,這一行是用來區分不同的reads
,而這一行本身包含了很多的資訊。
- Read Record Header
- Flow Cell ID
- Lane
- Tile
- Tile Coordinates
- Barcode
- 第二行是測序的序列,也就是reads的序列
- 第三行一般是一個
+
號,或者與第一行的資訊相同 -
第四行是鹼基質量值,是對第二行序列的鹼基的準確性的描述,一個鹼基會對應一個鹼基質量值,所以這一行和第二行長度是一樣的,如果不一樣就說明資料有問題
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