編輯 | ScienceAI
在生物經濟智慧化升級的浪潮中，業界領先的AI蛋白質設計平臺公司分子之心宣佈於近期完成 A 輪融資。本輪融資額達數億元人民幣，由謝諾投資、深創投聯合領投，商湯國香資本、久奕投資跟投。作為具有行業標杆地位的 AI 生物大分子設計平臺公司，分子之心本輪融資將進一步提速 AI 生物基礎設施建設。
分子之心創始人、國際知名計算生物學家許錦波表示，本輪融資將用於進一步擴大頂級複合型人才團隊，深入完善AI蛋白質基礎大模型、AI 蛋白質最佳化設計平臺 MoleculeOS 等生物經濟共性技術平臺，加速AI蛋白質技術的產業落地和商業化程序。
「我們用AI設計超越自然進化的超級蛋白，並透過 AI 蛋白質基礎設施建設，把蛋白質設計這一科學問題轉變為『可程式設計』、『可預測』的工程問題。」
此外，分子之心還將探索從蛋白質元件設計到代謝通路設計、工藝最佳化等生物經濟領域研發、生產全流程的系統性最佳化設計。
截至目前，分子之心累計完成 3 輪融資，過往投資方包括合成生物學龍頭企業凱賽生物、紅杉中國、百度 BV、聯想創投等。
持續從 0 到 1 創新，錨定產業難題研發全球領先AI蛋白技術
蛋白質是生物經濟的核心物質基礎，生物醫藥、生物製造等領域對於功能性蛋白質需求巨大，但從自然界發現具備理想功能的蛋白質難度極大。傳統方法大多透過溼實驗篩選，耗時長，成本高，且成功率低，嚴重製約了生物製藥、生物製造等領域的高速發展。
分子之心基於全球領先的 AI 蛋白質技術，融合分子動力學、量子化學等科學計算方法，實現小樣本、甚至零樣本的蛋白質精準最佳化和設計，無需高通量篩選，僅需少量溼實驗驗證就可精準獲得理想的蛋白質，極大提升抗體、酶、小蛋白、疫苗等各型別蛋白質效能最佳化和從頭設計的效率及成功率。
作為 AI 蛋白質領域少有的具備從 0 到 1 創新能力的企業，分子之心在蛋白質動態結合設計等極具產業價值、但難度極高的領域擁有全球領先的技術實力和應用經驗。蛋白質動態結合設計可解決酶活最佳化設計等應用難題，產業應用廣泛，但由於難度極高，目前全球範圍內尚無公開的成熟方法。
行業中主流的 AlphaFold 等演算法侷限於蛋白質靜態結構預測，對此問題束手無策。分子之心自研蛋白動態結合設計演算法，有效規避了目前主流演算法和大模型大量存在的假陽性問題，精度和成功率均處於領先水平。
截至目前，分子之心已自研十餘項效能領先的AI蛋白質預測、最佳化、設計演算法，如全球首個整合序列、結構、功能和進化的產業級 AI 蛋白質生成大模型NewOrigin（達爾文）、精度超越 AlphaFold 3 的複合物結構預測演算法，全球首創的可同時用於蛋白質側鏈預測與序列設計的演算法等，相關成果多次發表於 SCIENCE 雜誌、美國科學院院刊等核心期刊，獲得首屆國際基礎科學大會前沿突破獎等榮譽。諾獎基金會組織的「人類 3D 蛋白質組最新進展」研討會上，許錦波是唯一一位中國大陸地區的嘉賓。
基於革命性的 AI 蛋白質設計技術，分子之心在酶活性最佳化設計、極端環境下蛋白質效能最佳化等高難產業問題上取得突破，並基於對蛋白質等生物元件設計的理解，對代謝通路、菌株構建、發酵工藝、放大工藝等生物反應流程的關鍵環節進行系統性最佳化設計。
在與頭部醫藥公司聯合最佳化其核心原料用酶的產業專案中，分子之心使用AI技術對一個功能極其複雜、分子量極大的酶進行設計。由於該酶達到表達系統極限，使用溼實驗方法改造難度極高，全球範圍內的公開報導中此前沒有類似成功案例。分子之心基於 AI 從頭設計了一個自然界不存在的新酶，在保留功能活性的同時將分子量減少了 60%，突破了傳統實驗方法無法實現的多目標最佳化難題。
這些領先技術背後，是一支具有 AI 生物交叉背景與深厚產業經驗的複合型人才團隊。分子之心創始人許錦波教授在業界有「AI 蛋白質摺疊奠基人」之譽，曾於 2016 年全球首次使用 AI 方法突破蛋白質結構預測這一世紀難題，其開闢的全新技術路線被 DeepMind 用於 AlphaFold 的開發，拉開了 AI 蛋白質結構預測、AI 蛋白質設計的帷幕。
2022年，許錦波歸國創立分子之心，吸引了一批來自 MIT、耶魯、加州理工、清華、北大等頂尖高校及藥明、諾維信、Meta、亞馬遜、百度、阿里、位元組、Discovery Studio 等頭部公司的高階人才。在這支全球稀缺的頂級團隊推進下，分子之心持續突破技術邊界，為生物經濟領域帶來變革引擎。
構建生物經濟基礎設施，商業化程序加速
隨著AI蛋白質技術創新和產業落地，分子之心商業化步伐持續邁進。2023 年，合成生物學龍頭企業凱賽生物戰略投資分子之心，並將AI蛋白質技術引入研發體系。近期，凱賽生物董事長劉修才公佈了雙方合作的重要進展，在關鍵蛋白質最佳化上，「相對於野生菌，人工智慧設計的一個重要酶蛋白結構使菌種產率提高了 5 倍」。
在更廣闊的生物製造市場上，分子之心與醫藥、材料、化工、食品、農業等領域的頭部企業達成深度合作，用 AI 蛋白質技術突破傳統生物方法的侷限，設計效能更優的超級酶，並賦能代謝通路設計、工藝最佳化等生物製造全流程。
在創新藥領域，分子之心基於 AI 蛋白質設計技術自研細胞因子管線，在保持抑制腫瘤活性的同時，減毒（減少外周活性）數百倍，猴子耐受劑量達到同類管線的數十倍。
在蛋白疫苗的設計專案中，分子之心同時針對蛋白疫苗的穩定性、表達量等進行多目標最佳化，經動物實驗驗證，疫苗產生的中和抗體滴度為已公開專利和相關大型藥企蛋白疫苗的數倍，突破相關疫苗穩定性專利。
更值得關注的是，這些產業專案中，AI 設計蛋白質只需 3-4 天，僅需少量溼實驗驗證，即可獲得理想的候選分子。過往曠日持久的高通量溼實驗篩選模式，正在向「精準設計+少量驗證」轉型，生物經濟的底層模式正在新技術的驅動下升級。
為加速 AI 蛋白質設計技術的落地應用，分子之心自研了全球首個整合序列、結構、功能和進化的產業級 AI 蛋白質生成大模型 NewOrigin（達爾文），可針對產業應用需求在幾小時內、甚至是分鐘級「定製」具有特定功能的蛋白質，成功率高、普適性強、使用門檻低。
同時，分子之心將 NewOrigin 大模型整合至一站式 AI 蛋白質預測、最佳化、設計平臺 MoleculeOS 中，面向生物經濟領域不同背景、不同需求的使用者，提供API、軟體、解決方案、技術服務等多種形式的蛋白質設計工具和服務，透過搭建基礎設施平臺降低 AI 蛋白質技術的應用門檻。
當前，生物經濟被世界數十個國家列入戰略領域，成為國際競爭的新焦點。全球市場持續爆發，核心的生物製藥與生物製造的市場規模均已達到數千億美元，生物製藥市場的複合年增長率超過 10%，生物製造市場更是以超過 26% 的複合年增長率快速擴張。在這場全球性的競逐中，AI 蛋白技術正在成為重塑生物經濟版圖的革命性力量。
謝諾投資創始合夥人、投委會主席魏曉林表示，「以 AlphaFold 2 為代表的基於AI的蛋白質結構預測是本世紀最重要、最震撼人心的科學進展之一，分子之心的創始人許錦波教授在這個領域有開創性的貢獻。從蛋白質結構預測到蛋白質從頭設計是更大的一步跨越，分子之心為此搭建了卓越的技術平臺，並取得了不俗的進展。同時，分子之心團隊在商業化方面效率高、學習快，落地準，從支援合成生物學到大分子藥物發現，在多個領域都有快速的商業化落地進展。這些商業化工作反過來又推動分子之心的技術平臺加速迭代和豐富。謝諾投資堅定相信科學和使命的力量，以AI造福人類、創造價值是觸手可及的未來。我們很榮幸能夠與分子之心這樣優秀的團隊為伴，共同開創未來。」
深創投健康產業投資部總經理周伊表示：「智慧化基礎設施是加速合成生物產業發展的高效引擎。分子之心團隊在 AI 蛋白質領域積累的數十年研發、應用經驗，以及 AI 蛋白質大模型、產業應用平臺，將為合成生物學產業發展夯實底層技術基礎。期待下一階段AI蛋白新技術與生物製造產業的融合與規模化爆發。」
商湯國香資本管理合夥人扈與同表示：「分子之心在 AI 蛋白質最佳化設計的實踐成果，展現了生成式 AI 在該領域的巨大潛力，有助於加速合成生物和製藥產業的變革。基於商湯科技在 AI 大裝置和大模型的綜合優勢，雙方將共同探索AI技術在生物領域更廣闊的創新空間。」
久奕資本合夥人表示：「久奕專注於高科技領域。分子之心不僅是 AI 蛋白質設計技術的領軍者，也在 AI 技術和生物製造的產業融合上樹立了標杆。當下生物製造的變革尚處於初期，我們很高興與世界一流團隊合作，加速 AI 生物製造時代到來。」