1 碩士論文的要求
雖然說這是彭明輝教授對自己碩士研究生的要求，並非所有的碩士生導師都有類似的要求，但是在某種程度上，這也為我們今後的論文寫作方向提供了一個極佳的參考。
1）論文的主要內容應當是敘述一套方法在一個特定場合中的應用。
2）論文中的方法應當有所創新或突破，可以是解決既有問題的新方法，也可以是既有方法的新應用。
3）在論文中必須提出充足的證據讓讀者信服。
4）論文必須清楚地指出這個方法在應用上的限制，任何應用場合，只要滿足你所提出的假設（前提）條件，你的方法就一定適用，而且你所描述的優點就一定會存在。
5）論文必須清楚指出這個方法的限制和可能的缺點。
6）在行文風格上，論證嚴謹，邏輯關係清晰，使得這個專業領域內的任何讀者有辦法根據你的描述，在他的實驗室下複製出你的研究成果。
7）論文中的每一步驟必須提供充分的理由說明“為什麼非如此不可”。
8）論文必須註明與之相關的文獻。
2 完成碩士論文需要的能力
1）資料檢索的能力
在給定（或自己擬定）的題目範圍內，有能力利用資料檢索系統查出所有相關的論文，而無任何遺漏。
2）資料篩選的能力
如何只讀論文的題目、摘要、簡介和結論，而還沒有完全看懂內文，就準確地判斷出這篇論文中是否有值得你進一步參考的內容，以便快速地把需要仔細讀完的論文數量從數百篇降低到二十、三十篇。
3）期刊論文的閱讀能力
自己從無組織的知識中檢索、篩選、組織知識的能力。
4）期刊論文的分析能力
對一切既有進行精確批判的獨立自主能力。
5）創新的能力
創造新知識的能力。
3 期刊論文的分析技巧與程式
讀論文之前，參考SCI Impact Factor及學長的意見是必要的。
一篇期刊論文，主要分為四個部分：
1）Abstract
Abstract 說明這篇論文的主要貢獻、方法特色和主要內容。
2）Introduction
Introduction 的功能是介紹問題的背景和起源，交代前人在這個題目上已經有過的主要貢獻，說清楚前人留下來的未解問題，以及在這個背景下這篇論文想解決的問題和它的重要性。
對於初學的學生，對你的題目不熟時，先把跟你題目相關的論文收集30-40篇，每篇都只讀 Abstract 和 Introduction，而不要讀 Main Body（文字），只在必要時稍微參考一下後面的 Illustrative Examples（例證）和Conclusion，直到你能回答下面這三個問題：
（2A）在這領域內最常被引述的方法有哪些？（2B）這些方法可以分為哪些主要流派？（2C）每個派別的主要特色（含優點和缺點）是什麼？
然後再利用2C的答案，再進一步回答一個問題：（2D）這個領域內大家認為重要的關鍵詞有哪些？有哪些特性是大家重視的優點？有哪些特性是大家在意的缺點？這些優點和缺點通常在哪些應用場合會比較被重視？在哪些應用場合時比較不會被重視？
3）Main Body
在第一次有系統地念某派別的論文 Main Body時，只需要念懂：（3A）這篇論文的主要假設是什麼（在什麼條件下它是有效的），並且評估一下這些假設在現實條件下有多容易（或多難）成立。愈難成立的假設，愈不好用，參考價值也愈低。（3B）在這些假設下，這篇論文主要有什麼好處。（3C）這些好處主要表現在哪些公式的哪些專案的簡化上。
至於整篇論文詳細的推導過程，你不需要懂。假如你要看公式，重點是看公式推導過程中引入的假設條件，而不是恆等式的變換。
這樣唸完之後，你應該把這一派的主要發展過程、主要假設、主要理論依據、以及主要的成果做了一個完整的梳理。其次，根據（2D）的答案以及這一派別的主要假設，進一步回答下一個問題：（3D）這一派別的主要缺點有哪些。最後，根據（3A）（3B）（3C）（3D）的答案綜合整理出：這一派別最適合什麼時候使用，最不適合什麼時候使用。
圖一 論文閱讀流程圖
記住：回答完這些問題，你還是不知道恆等式是怎麼匯出來的。
那麼，你什麼時候才需要弄懂一篇論文所有的恆等式推導過程，或者把整篇論文細細讀完？NEVER！你只需要把確定用到的部分給完全搞懂就好。
4 方法與應用場合特性表
方法沒有好壞，只有相對優缺點；只有當方法的特性與應用場合的特性不合時，才能下結論說這方法不適用；當方法的特性與應用場合的特性吻合時，則下結論說這方法很適用。因此，一定要同時有方法特性表與應用場合特性表放在一起後，才能判斷一個方法的適用性。
圖二 方法與應用場合特性表
上面的方法與問題分析對照表還可以用來把突破瓶頸所需的創意簡化成一種“有跡可循”的工作。
5 論文閱讀的補充說明
1）一定要一整批一起讀懂到某個層次，而不是逐篇逐篇地整篇一次讀懂。
2）不要讀不會用到的東西，白費的力氣必須被極小化。絕大多數論文都只需要瞭解它的主要觀念，而不需要了解它的詳細推導過程。