http://www.cnblogs.com/LBSer/p/4129481.html
一、問題
使用spark join兩張表(5000w*500w)總是出錯,報的異常顯示是在shuffle階段。
14/11/27 12:05:49 ERROR storage.DiskBlockObjectWriter: Uncaught exception while reverting partial writes to file /hadoop/application_1415632483774_448143/spark-local-20141127115224-9ca8/04/shuffle_1_1562_27 java.io.FileNotFoundException: /hadoop/application_1415632483774_448143/spark-local-20141127115224-9ca8/04/shuffle_1_1562_27 (No such file or directory) at java.io.FileOutputStream.open(Native Method) at java.io.FileOutputStream.<init>(FileOutputStream.java:212) at org.apache.spark.storage.DiskBlockObjectWriter.revertPartialWritesAndClose(BlockObjectWriter.scala:178) at org.apache.spark.shuffle.hash.HashShuffleWriter$$anonfun$revertWrites$1.apply(HashShuffleWriter.scala:118) at org.apache.spark.shuffle.hash.HashShuffleWriter$$anonfun$revertWrites$1.apply(HashShuffleWriter.scala:117) at scala.collection.IndexedSeqOptimized$class.foreach(IndexedSeqOptimized.scala:33) at scala.collection.mutable.ArrayOps$ofRef.foreach(ArrayOps.scala:108) at org.apache.spark.shuffle.hash.HashShuffleWriter.revertWrites(HashShuffleWriter.scala:117) at org.apache.spark.shuffle.hash.HashShuffleWriter.stop(HashShuffleWriter.scala:89) at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:73) at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:41) at org.apache.spark.scheduler.Task.run(Task.scala:54) at org.apache.spark.executor.Executor$TaskRunner.run(Executor.scala:177) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1145) at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:615) at java.lang.Thread.run(Thread.java:724)
出問題的程式碼塊(scala)
1 val cRdd = iRdd.leftOuterJoin(label).map { 2 case (id, (iMap, Some(set))) => (id, (iMap, set)) 3 case (id, (iMap, None)) => (id, (iMap, new HashSet[Int]())) 4 }.persist(StorageLevel.MEMORY_AND_DISK)
二、問題分析與解決
一般spark job很多問題都是來源於系統資源不夠用,通過監控日誌等判斷是記憶體資源佔用過高導致的問題,因此嘗試通過配置引數的方法來解決。
1)--conf spark.akka.frameSize=100
此引數控制Spark中通訊訊息的最大容量 (如task的輸出結果),預設為10M。當處理大資料時,task的輸出可能會大於這個值,需要根據實際資料設定一個更高的值。嘗試將此引數設定成100M後,問題未能解決。
2)--conf spark.shuffle.manager=SORT
Spark預設的shuffle採用Hash模式,在HASH模式下,每一次shuffle會生成M*R的數量的檔案(M指的是Map的數目,R指的是Reduce的數目),而當Map和Reduce的數目開得較大時,會產生相當規模的檔案,與此同時帶來了大量的記憶體開銷。
為了降低系統資源,可以採用Sort模式,Sort模式只產生M數量的檔案。具體可以參考:Sort-based Shuffle之初體驗
在我們的應用場景下,採用Sort模式後,shuffle時間比之前增大了1/3,但是問題依舊未解決。
3)--conf spark.yarn.executor.memoryOverhead=4096
executor堆外記憶體設定。起初是1024M,未能跑過,後改為4096M,Job就能跑通,原因是程式使用了大量的堆外記憶體。