Ubuntu14.04下MRtrix3安裝

MRtrix3簡介及安裝包下載：MRtrix3

1、安裝MRtrix3前的依賴包需求

• C++11 編譯器 (GCC version >= 4.8, clang)
• Python version >= 2.7
•  zlib 壓縮包
• Eigen version 3.2 (不要安裝測試版)
• Qt version >= 4.7 [只需要GUI部分]，該部分是為了使用MRtrix3的GUI部分：mrview & shview

2、安裝以上依賴包

sudo apt-get install git g++ python python-numpy libeigen3-dev zlib1g-dev libqt4-opengl-dev libgl1-mesa-dev

3、安裝MRtrix3

1）克隆MRtrix3的資源庫

git clone https://github.com/MRtrix3/mrtrix3.git 或 git clone git@github.com:MRtrix3/mrtrix3.git

2）安裝MRtrix3

cd mrtrix3

./configure

3）建立二進位制檔案

./build

4、配置MRtrix3

1）新增環境變數

MRtrix3提供便捷的指令碼直接設定PATH環境變數，在MRtrix3的頂層路徑下：

./set_path

2）重開一個終端，確保啟動檔案可讀，命令列：bash

3）檢查是否正常工作，命令列：mrview

以下自由選擇：

5、保持MRtrix3更新

1）在MRtrix3的頂層資料夾下，命令列

 git pull

./build

2）如果不工作，重新執行配置檔案，命令列

./configure

另，如果想在Linux上獨立安裝MRtrix3，可參考MRtrix3官網手冊：Linux installation