MySQL·引擎特性·InnoDBChangeBuffer介紹

zhaiwx_yinfeng發表於2015-12-21

前言

在前面幾節我們介紹了undo log、redo log以及InnoDB如何崩潰恢復來實現資料ACID的相關知識。本期我們介紹另外一種重要的資料變更日誌,也就是InnoDB change buffer。 Change buffer的主要目的是將對二級索引的資料操作快取下來,以此減少二級索引的隨機IO,並達到操作合併的效果。

在MySQL5.5之前的版本中,由於只支援快取insert操作,所以最初叫做insert buffer,只是後來的版本中支援了更多的操作型別快取,才改叫change buffer。這也是為什麼程式碼中有大量的ibuf字首開頭的函式或變數。為了表達方面,本文也將change buffer縮寫為ibuf。

由於歷史上ibuf的資料格式曾發生過多次變化,本文討論的相關內容基於如下設定:
版本為5.5及之後的版本,不涉及舊版本的邏輯
innodb_change_buffering設定為ALL,表示快取所有操作

ibuf btree

change buffer的物理上是一顆普通的btree,儲存在ibdata系統表空間中,根頁為ibdata的第4個page(FSP_IBUF_TREE_ROOT_PAGE_NO)。

一條ibuf 記錄大概包含如下列:
ibuf_rec

ibuf btree通過三列(space id, page no , counter)作為主鍵來唯一決定一條記錄, 其中counter是一個遞增值,目的是為了維持不同操作的有序性,例如可以通過counter來保證在merge時執行如下序列時的循序和使用者操作順序是一致的:INSERT x, DELETE-MARK x, INSERT x。

在插入ibuf記錄前我們是不知道counter的值的,因此總是先將對應tuple的counter設定為0xFFFF,然後將cursor以模式PAGE_CUR_LE定位到小於等於(space id, page no, 0xFFFF)的位置,新記錄的counter為當前位置記錄counter值加1。

ibuf btree最大預設為buffer pool size的25%,當超過25%時,可能觸發使用者執行緒同步縮減ibuf btree。為何要將ibuf btree的大小和buffer pool大小相關聯呢 ? 一個比較重要的原因是防止ibuf本身佔用過多的buffer pool資源。

ibuf bitmap

由於ibuf快取的操作都是針對某個具體page的,因此在快取操作時必須保證該操作不會導致空Page 或索引分裂。

針對第一種情況,即避免空page,主要是對Purge執行緒而言。因為只有Purge執行緒才會去真正的刪除二級索引上的物理記錄。在準備插入型別為IBUF_OP_DELETE的操作快取時,會預估在apply完該page上所有的ibuf entry後還剩下多少記錄(ibuf_get_volume_buffered), 如果只剩下一條記錄,則拒絕本次purge操作快取,改走正常的讀入物理頁邏輯。

針對第二種情況,InnoDB通過一種特殊的Page來維護每個資料頁的空閒空間大小,也就是ibuf bitmap page,該page存在於每個ibd檔案中,具有固定的page no,其檔案結構如下圖所示:

ibuf_bitmap

ibuf bitmap使用4個bit來描述一個page:

(a) IBUF_BITMAP_FREE:使用2個bit來描述空間空間大小,以16KB的Page size為例,能表示的空閒空間範圍為0(0 bytes),1(512 bytes),2(1024 bytes),3(2048 bytes)。很顯然,最大能夠快取的二級索引記錄最大不可能超過2048位元組。

由於只有INSERT操作才可能導致Page記錄滿,因此只需要對IBUF_OP_INSERT型別的操作進行判斷:

ibuf_insert_low:


       if (op == IBUF_OP_INSERT) {
               ulint   bits = ibuf_bitmap_page_get_bits(
                       bitmap_page, page_no, zip_size, IBUF_BITMAP_FREE,
                       &bitmap_mtr);

               if (buffered + entry_size + page_dir_calc_reserved_space(1)
                   > ibuf_index_page_calc_free_from_bits(zip_size, bits)) {
                       /* Release the bitmap page latch early. */
                       ibuf_mtr_commit(&bitmap_mtr);

                       /* It may not fit */
                       do_merge = TRUE;

                       ibuf_get_merge_page_nos(FALSE,
                                               btr_pcur_get_rec(&pcur), &mtr,
                                               space_ids, space_versions,
                                               page_nos, &n_stored);

                       goto fail_exit;
               }
       }

其中ibuf_bitmap_page_get_bits函式根據space id 和page no 獲取對應的bitmap page,找到空閒空間描述資訊;如果本次插入操作可能超出限制,則從當前cursor位置附近開始,觸發一次非同步的ibuf merge,目的是儘量將當前page的快取操作做一次合併。

在正常的對物理頁的DML過程中,如果Page內空間發生了變化,總是需要去更新對應的IBUF_BITMAP_FREE值。參考函式:btr_compress、btr_cur_optimistic_insert

(b)IBUF_BITMAP_BUFFERED:用於表示該page是否有操作快取,在ibuf_insert_low函式中,準備插入ibuf btree前設定成true。二級索引物理頁讀入記憶體時會根據該標記位判斷是否需要進行ibuf merge操作。

(c) IBUF_BITMAP_IBUF:該資料頁是否是ibuf btree的一部分
該標記位主要用於非同步AIO讀操作。InnoDB專門為change buffer模組分配了一個後臺AIO執行緒,如果page屬於change buffer的b樹,則使用該執行緒做非同步讀,參考函式:ibuf_page_low

操作型別

InnoDB change buffer可以對三種型別的操作進行快取: INSERT、DELETE-MARK 、DELETE操作,前兩種對應使用者執行緒操作,第三種則由Purge操作觸發。

使用者可以通過引數innodb_change_buffering來控制快取何種操作:

/** Allowed values of innodb_change_buffering */
static const char* innobase_change_buffering_values[IBUF_USE_COUNT] = {
        "none",         /* IBUF_USE_NONE */
        "inserts",      /* IBUF_USE_INSERT */
        "deletes",      /* IBUF_USE_DELETE_MARK */
        "changes",      /* IBUF_USE_INSERT_DELETE_MARK */
        "purges",       /* IBUF_USE_DELETE */
        "all"           /* IBUF_USE_ALL */
};

innodb_change_buffering預設值為all,表示快取所有操作。注意由於在二級索引上的更新操作總是先delete-mark,再insert新記錄,因此update會產生兩條Ibuf entry。

快取條件

只有滿足一定條件時,操作才會被快取,所有對ibuf操作的判斷,都從btr_cur_search_to_nth_level入口,該函式用於定位到btree上滿足條件的記錄,大概的判斷條件如下:

  1. 使用者設定了選項innodb_change_buffering;
  2. 只有葉子節點才會去考慮是否使用ibuf;
  3. 對於聚集索引,不可以快取操作;
  4. 對於唯一二級索引(unique key),由於索引記錄具有唯一性,因此無法快取插入操作,但可以快取刪除操作;
  5. 表上沒有flush 操作,例如執行flush table for export時,不允許對錶進行ibuf 快取 (通過dict_table_t::quiesce 進行標識)

參考函式:ibuf_should_try

當滿足ibuf快取條件時,會使用兩種模式去嘗試獲取資料頁:

BUF_GET_IF_IN_POOL: 如果資料頁在記憶體中,則獲取page並返回,否則返回NULL;
BUF_GET_IF_IN_POOL_OR_WATCH:如果資料頁在記憶體中,則獲取page並返回,否則為請求的page設定一個`sentinel`(buf_pool_watch_set),相當於標記這個page,表示這個page上的記錄正在被purge。(下一小節介紹)

前者是前臺使用者執行緒觸發,後者為Purge執行緒在物理清除無效資料時觸發。如果資料已經在記憶體中了,則不進行快取。

隨後進入函式ibuf_insert, 經過一系列的檢查後(不可產生空page 和 索引分裂、未超出最大ibuf size限制)執行操作快取。

Purge操作快取

對於Purge操作,當page不存在於記憶體時設定的sentinel是什麼鬼? 它是如何設定的,什麼時候會被清理掉,這幾個問題涉及到Purge操作的快取流程:

  1. 如何設定sentinel

當Purge執行緒嘗試讀入page時,若資料頁不在buffer pool中,則呼叫函式buf_pool_watch_set,分為兩步:

Step 1. 首先檢查page hash,如果存在於page hash中:1. 若未被設定成`sentinel` (別的執行緒將資料頁讀入記憶體時會清理掉對應標記),返回資料頁;2. 否則返回NULL;

Step 2. 若page hash中不存在,則從buf_pool_t::watch陣列中找到一個空閒的(狀態為BUF_BLOCK_POOL_WATCH)page控制結構體物件buf_page_t,將其狀態設定為BUF_BLOCK_ZIP_PAGE,初始化相關變數,並插入到page hash中。buf_pool_t::watch陣列的大小為purge執行緒的個數,這意味著即使所有purge執行緒同時訪問同一個buffer pool instance,總會擁有一個空閒的watch陣列物件。
  1. 判斷是否可以快取Purge操作

當設定sentinel並返回後,在決定快取purge之前,需要去判斷是否有別的執行緒對同一條記錄快取了新的操作,舉個簡單的例子:

Step 1: delete-mark X (sec index), session 1
Step 2: insert X (clust index), session 1
Step 3: delete X(sec index), Purge thread
Step 4: insert X (sec index), session 1

如果二級索引頁在記憶體中,那麼step 3 和Step4必然是有序的,因為需要獲取block鎖才能進行資料變更操作。但資料頁不在記憶體時,就需要確保Step 4在Step 3之後執行。因此在快取purge操作之前,需要根據當前要清理的記錄,找到對應的聚集索引記錄,並檢查相比當前Purge執行緒的readview是否有新版本的聚集索引記錄(即有新的插入操作發生)。

如果檢查到有新的插入,則本次purge操作直接放棄。因為當符合一定條件時,Step 4的操作可以直接把Step1產生的記錄刪除標記清除掉,重用物理空間。

參考函式:row_purge_poss_sec

但是注意上述檢查流程結束時,會在函式row_purge_poss_sec中將mtr提交掉,對應的聚集索引頁的Latch會被釋放掉,這意味著可能出現如下序列:

Step 1: delete-mark X;
Step 2: delete X,Purge執行緒為其設定watch,並完成在函式row_purge_poss_sec中的檢查,準備插入ibuf
Step 3: insert X,索引頁不在記憶體,準備插入Ibuf

在函式ibuf_insert中,針對IBUF_OP_INSERT和IBUF_OP_DELETE_MARK操作,會去檢查是否對應的二級索引頁被設定成‘sentinel’ (buf_page_get_also_watch),如果是的話,表明當前有一個pending的purge操作,目前的處理邏輯是放棄insert和delete-mark的快取操作,轉而讀取物理頁。

綜上,如果purge操作先進入ibuf_insert,則對應二級索引頁的watch必然被設定,insert操作將放棄快取,轉而嘗試讀入索引頁;如果insert先進入ibuf_insert,則Purge操作的快取放棄。

即使Purge執行緒完成一系列檢查,進入快取階段,這時候使用者執行緒依舊可能會去讀入物理頁;有沒有可能導致purge操作丟失呢 ?答案是否定的! 因為Purge執行緒在快取操作時先將cursor定位到ibuf btree上,對應的ibuf page已將加上latch;而使用者執行緒如果讀入物理頁,為了Merge ibuf entry,也需要請求page latch; 當Purge執行緒在拿到latch後,會再檢查一次看看物理頁是否已讀入記憶體(buf_pool_watch_occurred),如果是的話,則放棄本次快取。

  1. 何時清理sentinel

有兩種情況會清理sentinel:
第一種情況是Purge操作完成快取後(或者判斷無法進行Purge快取)進行清理。

第二種情況是從磁碟讀入檔案塊的時候,會呼叫buf_page_init_for_read->buf_page_init初始化一個page物件。這時候會做一個判斷,如果將被讀入的page被設定為sentinel(在watch陣列中被設定),則呼叫buf_pool_watch_remove將其從page hash中移除,對應bp->watch的資料元素被重置成空閒狀態。

ibuf merge

有以下幾種場景會觸發ibuf merge操作:

  1. 使用者執行緒選擇二級索引進行資料查詢,這時候必須要讀入二級索引頁,相應的ibuf entry需要merge到Page中。
  2. 當嘗試快取插入操作時,如果預估Page的空間不足,可能導致索引分裂,則定位到嘗試快取的page no在ibuf btree中的位置,最多Merge 8個(IBUF_MERGE_AREA) page, merge方式為非同步,即發起非同步讀索引頁請求。

參考函式:ibuf_insert_low —> ibuf_get_merge_page_nos_func

  1. 若當前ibuf tree size 超過ibuf->max_size + 10(IBUF_CONTRACT_DO_NOT_INSERT)時,執行一次同步的ibuf merge(ibuf_contract),merge的page no為隨機定位的cursor,最多一次merge 8個page, 同時放棄本次快取。

其中ibuf->max_size預設為25% * buffer pool size,百分比由引數innodb_change_buffer_max_size控制,可動態調整。

參考函式:ibuf_insert_low —> ibuf_contract

  1. 若本次插入ibuf操作可能產生ibuf btree索引分裂(BTR_MODIFY_TREE)時

    當前ibuf->size < ibuf->max_size, 不做處理;
    
    當前ibuf->size >= ibuf->max_size + 5 (IBUF_CONTRACT_ON_INSERT_SYNC)時,執行一次同步ibuf merge,位置隨機;
    
    當前Ibuf->size介於ibuf->max_size 和ibuf->max_size +5 之間時。執行一次非同步ibuf merge,位置隨機。
    

參考函式:ibuf_insert_low —> ibuf_contract_after_insert

  1. 後臺master執行緒發起merge

master執行緒有三種工作狀態:

IDLE:例項處於空閒狀態,以100%的io capacity來作merge操作:

n_pages = PCT_IO(100);

相當於一次merge的page數等於innodb_io_capacity

參考函式:srv_master_do_idle_tasks

ACTIVE:例項處於活躍狀態,這時候會以如下演算法計算需要merge的page數:

                /* By default we do a batch of 5% of the io_capacity */
                n_pages = PCT_IO(5);

                mutex_enter(&ibuf_mutex);

                /* If the ibuf->size is more than half the max_size
                then we make more agreesive contraction.
                +1 is to avoid division by zero. */
                if (ibuf->size > ibuf->max_size / 2) {
                        ulint diff = ibuf->size - ibuf->max_size / 2;
                        n_pages += PCT_IO((diff * 100)
                                           / (ibuf->max_size + 1));
                }

                mutex_exit(&ibuf_mutex);

可見在系統active時,會以比較溫和的方式去做merge,如果當前ibuf btree size超過最大值的一半,則嘗試多做一些merge操作。

參考函式: srv_master_do_active_tasks

SHUTDOWN:當執行slow shutdown時,會強制做一次全部的ibuf merge

參考函式:srv_master_do_shutdown_tasks

  1. 對某個表執行flush table 操作時,會觸發對該表的強制ibuf merge,例如執行:

    flush table tbname for export;
    flush table tbname with read lock;

實際上強制ibuf merge主要是為flush for export準備的,當執行該命令後,為了保證能安全的將ibd拷貝到其他例項上, 需要對該表應用全部的ibuf 快取。

參考函式:row_quiesce_table_start

“著名” bug

在change buffer的應用史上,最著名的bug要屬 bug#61104,其現象為當例項意外crash後,無法從崩潰中恢復,錯誤日誌中報如下斷言:

InnoDB: Failing assertion: page_get_n_recs(page) > 1

最初官方花了很長的時間都沒有找到這個問題的root cause,只能加了一些程式碼邏輯避免不斷crash重啟,讓使用者有機會登入例項,重建二級索引。

後來Percona的開發人員Alexey Kopytov在bug#66819 提出了該問題的根本原因,指出ibuf entry的刪除和merge 並不是一個原子的操作(即處於兩個mtr事務中),當merge ibuf的mtr提交後crash,就可能在重啟時重複做ibuf merge。如果上次執行DELETE操作導致對應索引頁上記錄數只剩下一條;第二次apply時認為本次操作會產生空頁,從而導致斷言錯誤。

官方很快根據Alexey的意見做了修復,修復方式也比較簡單:

在第一個mtr裡,merge ibuf entry 到二級索引頁,並標記刪除ibuf entry,提交mtr;
在第二個mtr裡,執行真正的悲觀刪除ibuf entry;
在執行merge操作前,對於被delete mark的ibuf entry,不做merge操作。

具體的參考函式:ibuf_merge_or_delete_for_pageibuf_delete_rec

比較烏龍的是,我們發現第一次修復並沒有處理Purge執行緒產生的delete快取;我們將該發現公佈到社群,很快得到了響應,並由上游快速fix掉了,因此完整的補丁分佈在兩個版本中:

官方第一次fix(MySQL5.5.29)
官方第二次fix(MySQL5.5.31)


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