NVIDIATeslaK80GPU助力精確計算生物分子電荷資訊

cuda_study發表於2018-03-06
GPU
案例簡介
• 本案例中，分子反應動力學國家重點實驗室-分子模擬與設計研究組利用NVIDIA GPU助力精確計算生物分子受環境影響所產生的原子電荷資訊。利用Tesla K80 GPU強大的計算能力極大地提升了迭代過程中量子化學計算的效率，對精確描述生物分子在特定環境影響下的原子電荷資訊起到了至關重要的作用。
• 本案例主要應用到擁有NVIDIA Tesla K80 GPU 的超級計算機。
Case Introduction
• In this case, State Key Laboratory of Molecular Reaction Dynamics, Laboratory of Molecular Modeling and Design applies the NVIDIA GPU to calculate the accurate molecular charges effected by its environment. The Tesla K80 GPU dramatically improves the efficiency of QM calculation in interactions, and plays the key point in illustrating the effectiveness of atomic charge in molecular by its specific environment.
• The major product utilized in the case is NVIDIA Tesla K80 GPU supercomputer.
現狀
分子反應動力學國家重點實驗室(www.sklmr.dicp.ac.cn)依託於中國科學院大連化學物理研究所。其發展和利用國際先進的化學反應動力學實驗技術和高精度動力學理論相結合的方法，深入細緻地研究重要化學過程中的動力學機理，在原子、分子的層次和量子態分辨水平上揭示基本化學動力學規律，在分子反應動力學基礎科學研究中做出重要創新成果，為重大科學技術進步提供基礎知識支撐，保持反應動力學研究的國際領先地位，佔據國際化學反應動力學研究的至高點。分子反應動力學國家重點實驗室一直是國內化學反應動力學的主要研究基地和承擔國家重大基礎研究專案的牽頭單位，已經成為國際上備受矚目的重要的分子反應動力學研究中心。
分子模擬與設計研究組(Laboratory of Molecular Modeling and Design)主要面向生物能源、生物醫藥、生命科學、生物技術及催化材料等相關領域，發展新的理論計算方法，結合已有的分子模擬與設計程式，與實驗工作者密切合作， 針對實驗所關心的科學和技術問題開展研究。
未來，本課題組還將基於NVIDIA Tesla GPU提供的卓越計算效能，應用於超大尺度生物分子的原子電荷隨環境的變化而改變的描述過程中。並通過基於量子化學的計算全面提升實時的原子電荷計算的準確度和效率。完善原子電荷精確計算的加速方法，為進一步分析生物大分子與其所處環境的相互影響提供可靠的理論支援。

NV Template_GPU助力精確計算分子電荷資訊.pdf

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原文釋出時間為： 2018-2-26 14:40:00
原文由：emily 釋出，版權歸屬於原作者 
本文來自雲棲社群合作伙伴NVIDIA，瞭解相關資訊可以關注NVIDIA官方網站


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