近來在使用PHP進行結構式搜尋的時候，發現獲取到smiles無法進行查詢操作，然後想到了轉化為分子式的操作。主要是用在有機物。
困難一：我在smiles 上利用正則匹配C,O。遇到了問題就是其他元素也有C字母，所以無法正確去掉C
解決：我只用原來的smiles來分析有機物的組成，然後我按照有機物的結構，單獨找出來C,O的數量，其餘元素，簡單統計一下放在後面就好了。主要分為三部分，C數目，O數目,其他元素
實現;1.前臺獲取的smiles，符合相應的規則
2.php處理
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$Cnum=``;
$Onum=``;
//print($smiles."原來的");
$find=array("=","#",".","1","[","]","(",")");
$replace = array("");
$smiles=str_replace($find,$replace,$smiles,$j);
//print($j);
//ECHO `/n`;
$ChemElement= array("Li","Be","Na","Mg","Al","Si","Cl","Br","Ca","Cr","Mn","Fe","Co","Ni","Cu","Zn","Ga","Gc","Ag","Au");
foreach($ChemElement as $value){
//print($value);
$k_x=substr_count($smiles,$value);
if($k_x>0){
$k_x=$k_x==1?``:$k_x;
//str_replace($value,``,$smiles);
$smiles_new.=$value.$k_x;
}
}
$k_c=substr_count($smiles,`C`);
//print(`C個數`.$k_c);
$i_c=preg_match_all(`/C[a-z]/m`,$smiles);
//print(`非碳個數`.$i_c);
$j_c=$k_c-$i_c;
//print_r(`碳個數`.$j_c);
//$smiles=preg_replace(`/C[0-9A-Z/.]/m`,``,$smiles,-1,$count);
//print($smiles);
//print(`替換次數`.$count);
$k_o=substr_count($smiles,`O`);
//print(`O個數`.$k_o);
$i_o=preg_match_all(`/O[a-z]/m`,$smiles);
//print(`非氧個數`.$i_o);
$j_o=$k_o-$i_o;
//$smiles=preg_replace(`/C[0-9A-Z/.]/m`,``,$smiles,-1,$count);
//print($smiles);
//print(`替換次數`.$count);
if($j_c>0){$j_c=$j_c==1?``:$j_c;$Cnum=`C`.$j_c;}
if($j_o>0){$j_o=$j_o==1?``:$j_o;$Onum=`O`.$j_o;}
$smilesPara = $Cnum.$Onum.$smiles_new;
結果：基本上可以解決一般意義上的分子式，當然元素我沒有寫全，我認為常用的寫一下就好，本來就是為了搜尋，不常見的物質，化學品庫裡也沒有。這裡推薦一下 斯芬克斯的PHP搜尋引擎，很不錯。 |