淘寶內部分享:MySQL & MariaDB效能優化

shilei1發表於2016-04-12

MySQL是目前使用最多的開源資料庫,但是MySQL資料庫的預設設定效能非常的差,必須進行不斷的優化,而優化是一個複雜的任務,本文描述淘寶資料庫團隊針對MySQL資料庫Metadata Lock子系統的優化,hash_scan 演算法的實現解析的效能優化,TokuDB·版本優化,以及MariaDB·的效能優化。本文來自淘寶團隊內部經驗分享。

往期文章:淘寶內部分享:怎麼跳出MySQL的10個大坑

MySQL· 5.7優化·Metadata Lock子系統的優化

背景

引入MDL鎖的目的,最初是為了解決著名的bug#989,在MySQL 5.1及之前的版本,事務執行過程中並不維護涉及到的所有表的Metatdata 鎖,極易出現複製中斷,例如如下執行序列:

Session 1: BEGIN;
Session 1: INSERT INTO t1 VALUES (1);
Session 2: Drop table t1; ——–SQL寫入BINLOG
Session 1: COMMIT; —–事務寫入BINLOG

在備庫重放 binlog時,會先執行DROP TABLE,再INSERT資料,從而導致複製中斷。

在MySQL 5.5版本里,引入了MDL, 在事務過程中涉及到的所有表的MDL鎖,直到事務結束才釋放。這意味著上述序列的DROP TABLE 操作將被Session 1阻塞住直到其提交。

不過用過5.5的人都知道,MDL實在是個讓人討厭的東西,相信不少人肯定遇到過在使用mysqldump做邏輯備份時,由於需要執行FLUSH TABLES WITH READ LOCK (以下用FTWRL縮寫代替)來獲取全域性GLOBAL的MDL鎖,因此經常可以看到“wait for global read lock”之類的資訊。如果備庫存在大查詢,或者複製執行緒正在執行比較漫長的DDL,並且FTWRL被block住,那麼隨後的QUERY都會被block住,導致業務不可用引發故障。

為了解決這個問題,Facebook為MySQL增加新的介面替換掉FTWRL 只建立一個read view ,並返回與read view一致的binlog位點;另外Percona Server也實現了一種類似的辦法來繞過FTWRL,具體點選文件連線以及percona的部落格,不展開闡述。

MDL解決了bug#989,卻引入了一個新的熱點,所有的MDL鎖物件被維護在一個hash物件中;對於熱點,最正常的想法當然是對其進行分割槽來分散熱點,不過這也是Facebook的大神Mark Callaghan在report了bug#66473後才加入的,當時Mark觀察到MDL_map::mutex的鎖競爭非常高,進而推動官方改變。因此在MySQL 5.6.8及之後的版本中,引入了新引數metadata_locks_hash_instances來控制對mdl hash的分割槽數(Rev:4350);

不過故事還沒結束,後面的測試又發現雜湊函式有問題,somedb. someprefix1 … .somedb .someprefix8 的hash key值相同,都被hash到同一個桶下面了,相當於hash分割槽沒生效。這屬於hash演算法的問題,喜歡考古的同學可以閱讀下bug#66473後面Dmitry Lenev的分析。

Mark進一步的測試發現Innodb的hash計算演算法比my_hash_sort_bin要更高效, Oracle的開發人員重開了個bug#68487來跟蹤該問題,並在MySQL5.6.15對hash key計算函式進行優化,包括fix 上面說的hash計算問題(Rev:5459),使用MurmurHash3演算法來計算mdl key的hash值。

MySQL 5.7 對MDL鎖的優化

在MySQL 5.7裡對MDL子系統做了更為徹底的優化。主要從以下幾點出發:

第一,儘管對MDL HASH進行了分割槽,但由於是以表名+庫名的方式作為key值進行分割槽,如果查詢或者DML都集中在同一張表上,就會hash到相同的分割槽,引起明顯的MDL HASH上的鎖競爭。

針對這一點,引入了LOCK-FREE的HASH來儲存MDL_lock,LF_HASH無鎖演算法基於論文”Split-Ordered Lists: Lock-Free Extensible Hash Tables”,實現還比較複雜。 注:實際上LF_HASH很早就被應用於Performance Schema,算是比較成熟的程式碼模組。由於引入了LF_HASH,MDL HASH分割槽特性自然直接被廢除了 。對應WL#7305, PATCH(Rev:7249)

第二,從廣泛使用的實際場景來看,DML/SELECT相比DDL等高階別MDL鎖型別,是更為普遍的,因此可以針對性的降低DML和SELECT操作的MDL開銷。

為了實現對DML/SELECT的快速加鎖,使用了類似LOCK-WORD的加鎖方式,稱之為FAST-PATH,如果FAST-PATH加鎖失敗,則走SLOW-PATH來進行加鎖。

每個MDL鎖物件(MDL_lock)都維持了一個long long型別的狀態值來標示當前的加鎖狀態,變數名為MDL_lock::m_fast_path_state 舉個簡單的例子:(初始在sbtest1表上對應MDL_lock::m_fast_path_state值為0)

Session 1: BEGIN;
Session 1: SELECT * FROM sbtest1 WHERE id =1; //m_fast_path_state = 1048576, MDL ticket 不加MDL_lock::m_granted佇列
Session 2: BEGIN;
Session 2: SELECT * FROM sbtest1 WHERE id =2; //m_fast_path_state=1048576+1048576=2097152,同上,走FAST PATH
Session 3: ALTER TABLE sbtest1 ENGINE = INNODB; //DDL請求加的MDL_SHARED_UPGRADABLE型別鎖被視為unobtrusive lock,可以認為這個是比上述SQL的MDL鎖級別更高的鎖,並且不相容,因此被強制走slow path。而slow path是需要加MDL_lock::m_rwlock的寫鎖。m_fast_path_state = m_fast_path_state | MDL_lock::HAS_SLOW_PATH | MDL_lock::HAS_OBTRUSIVE
注:DDL還會獲得庫級別的意向排他MDL鎖或者表級別的共享可升級鎖,但為了表述方便,這裡直接忽略了,只考慮涉及的同一個MDL_lock鎖物件。
Session 4: SELECT * FROM sbtest1 WHERE id =3; // 檢查m_fast_path_state &HAS_OBTRUSIVE,如果DDL還沒跑完,就會走slow path。

從上面的描述可以看出,MDL子系統顯式的對鎖型別進行了區分(OBTRUSIVE or UNOBTRUSIVE),儲存在陣列矩陣m_unobtrusive_lock_increment。 因此對於相容型別的MDL鎖型別,例如DML/SELECT,加鎖操作幾乎沒有任何讀寫鎖或MUTEX開銷。對應WL#7304, WL#7306 , PATCH(Rev:7067,Rev:7129)(Rev:7586)

第三,由於引入了MDL鎖,實際上早期版本用於控制Server和引擎層表級併發的THR_LOCK 對於Innodb而言已經有些冗餘了,因此Innodb表完全可以忽略這部分的開銷。

不過在已有的邏輯中,Innodb依然依賴THR_LOCK來實現LOCK TABLE tbname READ,因此增加了新的MDL鎖型別來代替這種實現。實際上程式碼的大部分修改都是為了處理新的MDL型別,Innodb的改動只有幾行程式碼。對應WL#6671,PATCH(Rev:8232)

第四,Server層的使用者鎖(通過GET_LOCK函式獲取)使用MDL來重新實現。

使用者可以通過GET_LOCK()來同時獲取多個使用者鎖,同時由於使用MDL來實現,可以藉助MDL子系統實現死鎖的檢測。注意由於該變化,導致使用者鎖的命名必須小於64位元組,這是受MDL子系統的限制導致。對應WL#1159, PATCH(Rev:8356)

MySQL·效能優化·hash_scan 演算法的實現解析

問題描述

首先,我們執行下面的TestCase:

 --source include/master-slave.inc
 --source include/have_binlog_format_row.inc
 connection slave;
 set global slave_rows_search_algorithms='TABLE_SCAN';
 connection master;
 create table t1(id int, name varchar(20);
 insert into t1 values(1,'a');
 insert into t2 values(2, 'b');
 ......
 insert into t3 values(1000, 'xxx');
 delete from t1;
 ---source include/rpl_end.inc

隨著 t1 資料量的增大,rpl_hash_scan.test 的執行時間會隨著 t1 資料量的增大而快速的增長,因為在執行 ‘delete from t1;’ 對於t1的每一行刪除操作,備庫都要掃描t1,即全表掃描,如果 select count(*) from t1 = N, 則需要掃描N次 t1 表, 則讀取記錄數為: O(N + (N-1) + (N-2) + …. + 1) = O(N^2),在 replication 沒有引入 hash_scan,binlog_format=row時,對於無索引表,是通過 table_scan 實現的,如果一個update_rows_log_event/delete_rows_log_event 包含多行修改時,每個修改都要進行全表掃描來實現,其 stack 如下:

#0 Rows_log_event::do_table_scan_and_update
#1 0x0000000000a3d7f7 in Rows_log_event::do_apply_event 
#2 0x0000000000a28e3a in Log_event::apply_event
#3 0x0000000000a8365f in apply_event_and_update_pos
#4 0x0000000000a84764 in exec_relay_log_event 
#5 0x0000000000a89e97 in handle_slave_sql (arg=0x1b3e030) 
#6 0x0000000000e341c3 in pfs_spawn_thread (arg=0x2b7f48004b20) 
#7 0x0000003a00a07851 in start_thread () from /lib64/libpthread.so.0
#8 0x0000003a006e767d in clone () from /lib64/libc.so.6

這種情況下,往往會造成備庫延遲,這也是無索引表所帶來的複製延遲問題。

如何解決問題:

  1. RDS 為了解這個問題,會在每個表建立的時候檢查一下表是否包含主建或者唯一建,如果沒有包含,則建立一個隱式主建,此主建對使用者透明,使用者無感,相應的show create, select * 等操作會遮蔽隱式主建,從而可以減少無索引錶帶來的影響;
  2. 官方為了解決這個問題,在5.6.6 及以後版本引入引數 slave_rows_search_algorithms ,用於指示備庫在 apply_binlog_event時使用的演算法,有三種演算法TABLE_SCAN,INDEX_SCAN,HASH_SCAN,其中table_scan與index_scan是已經存在的,本文主要研究HASH_SCAN的實現方式,關於引數slave_rows_search_algorithms的設定。

hash_scan 的實現方法:

簡單的講,在 apply rows_log_event時,會將 log_event 中對行的更新快取在兩個結構中,分別是:m_hash, m_distinct_key_list。 m_hash:主要用來快取更新的行記錄的起始位置,是一個hash表; m_distinct_key_list:如果有索引,則將索引的值push 到m_distinct_key_list,如果表沒有索引,則不使用這個List結構; 其中預掃描整個呼叫過程如下: Log_event::apply_event

 Rows_log_event::do_apply_event
    Rows_log_event::do_hash_scan_and_update 
      Rows_log_event::do_hash_row  (add entry info of changed records)
        if (m_key_index < MAX_KEY) (index used instead of table scan)
          Rows_log_event::add_key_to_distinct_keyset ()

當一個event 中包含多個行的更改時,會首先掃描所有的更改,將結果快取到m_hash中,如果該表有索引,則將索引的值快取至m_distinct_key_list List 中,如果沒有,則不使用這個快取結構,而直接進行全表掃描;

執行 stack 如下:

#0 handler::ha_delete_row 
#1 0x0000000000a4192b in Delete_rows_log_event::do_exec_row 
#2 0x0000000000a3a9c8 in Rows_log_event::do_apply_row
#3 0x0000000000a3c1f4 in Rows_log_event::do_scan_and_update 
#4 0x0000000000a3c5ef in Rows_log_event::do_hash_scan_and_update 
#5 0x0000000000a3d7f7 in Rows_log_event::do_apply_event 
#6 0x0000000000a28e3a in Log_event::apply_event
#7 0x0000000000a8365f in apply_event_and_update_pos
#8 0x0000000000a84764 in exec_relay_log_event 
#9 0x0000000000a89e97 in handle_slave_sql
#10 0x0000000000e341c3 in pfs_spawn_thread
#11 0x0000003a00a07851 in start_thread () 
#12 0x0000003a006e767d in clone ()

執行過程說明:

Rows_log_event::do_scan_and_update

  open_record_scan()
    do
      next_record_scan()
        if (m_key_index > MAX_KEY)
           ha_rnd_next();
        else
           ha_index_read_map(m_key from m_distinct_key_list)       
        entry= m_hash->get()
        m_hash->del(entry);
        do_apply_row()
     while (m_hash->size > 0);

從執行過程上可以看出,當使用hash_scan時,只會全表掃描一次,雖然會多次遍歷m_hash這個hash表,但是這個掃描是O(1),所以,代價很小,因此可以降低掃描次數,提高執行效率。

hash_scan 的一個 bug

bug詳情:http://bugs.mysql.com/bug.php?id=72788
bug原因:m_distinct_key_list 中的index key 不是唯一的,所以存在著對已經刪除了的記錄重複刪除的問題。
bug修復:http://bazaar.launchpad.net/~mysql/mysql-server/5.7/revision/8494

問題擴充套件:

  • 在沒有索引的情況下,是不是把 hash_scan 開啟就能提高效率,降低延遲呢?不一定,如果每次更新操作只一條記錄,此時仍然需要全表掃描,並且由於entry 的開銷,應該會有後退的情況;
  • 一個event中能包含多少條記錄的更新呢?這個和表結構以及記錄的資料大小有關,一個event 的大小不會超過9000 bytes, 沒有引數可以控制這個size;
  • hash_scan 有沒有限制呢?hash_scan 只會對更新、刪除操作有效,對於binlog_format=statement 產生的 Query_log_event 或者binlog_format=row 時產生的 Write_rows_log_event 不起作用;

TokuDB·版本優化·7.5.0

TokuDB 7.5.0大版本已釋出,是一個里程碑的版本,這裡談幾點優化,以饗儲存引擎愛好者們。

a) shutdown加速

有使用者反饋TokuDB在shutdown的時候,半個小時還沒完事,非常不可接受。在shutdown的時候,TokuDB在幹什麼呢?在做checkpoint,把記憶體中的節點資料序列化並壓縮到磁碟。

那為什麼如此耗時呢?如果tokudb_cache_size開的比較大,記憶體中的節點會非常多,在shutdown的時候,大家都排隊等著被壓縮到磁碟(序列的)。

在7.5.0版本,TokuDB官方針對此問題進行了優化,使多個節點並行壓縮來縮短時間。

BTW: TokuDB在早期設計的時候已保留並行介面,只是一直未開啟。

b) 內節點讀取加速

在記憶體中,TokuDB內節點(internal node)的每個message buffer都有2個重要資料結構:

 1) FIFO結構,儲存{key, value}
2) OMT結構,儲存{key, FIFO-offset}

由於FIFO不具備快速查詢特性,就利用OMT來做快速查詢(根據key查到value)。這樣,當內節點發生cache miss的時候,索引層需要做:

 1) 從磁碟讀取節點內容到記憶體
2) 構造FIFO結構
3) 根據FIFO構造OMT結構(做排序)

由於TokuDB內部有不少效能探(ji)針(shu),他們發現步驟3)是個不小的效能消耗點,因為每次都要把message buffer做下排序構造出OMT,於是在7.5.0版本,把OMT的FIFO-offset(已排序)也持久化到磁碟,這樣排序的損耗就沒了。

c) 順序寫加速

當寫發生的時候,會根據當前的key在pivots裡查詢(二分)當前寫要落入哪個mesage buffer,如果寫是順序(或區域性順序,資料走向為最右邊路徑)的,就可以避免由"查詢"帶來的額外開銷。

如何判斷是順序寫呢?TokuDB使用了一種簡單的啟發式方法(heurstic):seqinsert_score積分式。如果:

1) 當前寫入落入最右節點,對seqinsert_score加一分(原子)
2) 當前寫入落入非最右節點,對seqinsert_score清零(原子)

當seqinsert_score大於100的時候,就可以認為是順序寫,當下次寫操作發生時,首先與最右的節點pivot進行對比判斷,如果確實為順序寫,則會被寫到該節點,省去不少compare開銷。方法簡單而有效。

MariaDB· 效能優化·filesort with small LIMIT optimization

從MySQL 5.6.2/MariaDB 10.0.0版本開始,MySQL/MariaDB針對”ORDER BY …LIMIT n”語句實現了一種新的優化策略。當n足夠小的時候,優化器會採用一個容積為n的優先佇列來進行排序,而不是排序所有資料然後取出前n條。 這個新演算法可以這麼描述:(假設是ASC排序)

  1. 建立一個只有n個元素的優先佇列(堆),根節點為堆中最大元素
  2. 根據其他條件,依次從表中取出一行資料
  3. 如果當前行的排序關鍵字小於堆頭,則把當前元素替換堆頭,重新Shift保持堆的特性
  4. 再取一條資料重複2步驟,如果沒有下一條資料則執行5
  5. 依次取出堆中的元素(從大到小排序),逆序輸出(從小到大排序),即可得ASC的排序結果

這樣的演算法,時間複雜度為m*log(n),m為索引過濾後的行數,n為LIMIT的行數。而原始的全排序演算法,時間複雜度為m*log(m)。只要n遠小於m,這個演算法就會很有效。

不過在MySQL 5.6中,除了optimizer_trace,沒有好的方法來看到這個新的執行計劃到底起了多少作用。MariaDB 10.013開始,提供一個系統狀態,可以檢視新執行計劃呼叫的次數:

 Sort_priority_queue_sorts
描述: 通過優先佇列實現排序的次數。(總排序次數=Sort_range+Sort_scan)
範圍: Global, Session
資料型別: numeric
引入版本: MariaDB 10.0.13

此外,MariaDB還將此資訊打入了Slow Log中。只要指定 log_slow_verbosity=query_plan,就可以在Slow Log中看到這樣的記錄:

# Time: 140714 18:30:39
 # User@Host: root[root] @ localhost []
 # Thread_id: 3  Schema: test  QC_hit: No
 # Query_time: 0.053857  Lock_time: 0.000188  Rows_sent: 11  Rows_examined: 100011
 # Full_scan: Yes  Full_join: No  Tmp_table: No  Tmp_table_on_disk: No
 # Filesort: Yes  Filesort_on_disk: No  Merge_passes: 0  Priority_queue: Yes
 SET timestamp=1405348239;SET timestamp=1405348239;
 select * from t1 where col1 between 10 and 20 order by col2 limit 100;

“Priority_queue: Yes” 就表示這個Query利用了優先佇列的執行計劃(pt-query-digest 目前已經可以解析 Priority_queue 這個列)。更多精彩內容,敬請期待!

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