Python 記憶體優化

發表於2017-11-19

實際專案中,pythoner更加關注的是Python的效能問題,之前也寫過一篇文章《Python效能優化》介紹Python效能優化的一些方法。而本文,關注的是Python的記憶體優化,一般說來,如果不發生記憶體洩露,執行在服務端的Python程式碼不用太關心記憶體,但是如果執行在客戶端(比如移動平臺上),那還是有優化的必要。具體而言,本文主要針對的Cpython,而且不涉及C擴充套件。

我們知道,Python使用引用技術和垃圾回收來管理記憶體,底層也有各種型別的記憶體池,那我們怎麼得知一段程式碼使用的記憶體情況呢?工欲善其事必先利其器,直接看windows下的工作管理員或者linux下的top肯定是不準的。

Pytracemalloc

對於基本型別,可以通過sys.getsizeof()來檢視物件佔用的記憶體大小。以下是在64位Linux下的一些結果:

可以看到,即使是一個int型別(1)也需要佔用24個位元組,遠遠高於C語言中int的範圍。因為Python中一切都是物件,int也不例外(事實上是PyIntObject),除了真正儲存的數值,還需要儲存引用計數資訊、型別資訊,更具體的可以參見《Python原始碼剖析》。

而對於更復雜的組合型別,複雜的程式碼,使用getsizeof來檢視就不準確了,因為在Python中變數僅僅指向一個物件,這個時候就需要更高階的工具,比如guppypysizerpytracemallocobjgraph。在這裡重點介紹pytracemalloc。

在Python3.4中,已經支援了pytracemalloc,如果使用python2.7版本,則需要對原始碼打補丁,然後重新編譯。pytracemalloc在pep454中提出,主要有以下幾個特點:

  • Traceback where an object was allocated
  • Statistics on allocated memory blocks per filename and per line number: total size, number and average size of allocated memory blocks
  • Compute the differences between two snapshots to detect memory leaks

簡單來說,pytracemalloc hook住了python申請和釋放記憶體的介面,從而能夠追蹤物件的分配和回收情況。對記憶體分配的統計資料可以精確到每個檔案、每一行程式碼,也可以按照呼叫棧做聚合分析。而且還支援快照(snapshot)功能,比較兩個快照之間的差異可以發現潛在的記憶體洩露。

下面通過一個例子來簡單介紹pytracemalloc的用法和介面,關於更詳細用法和API,可以參考這份詳盡的文件或者pytracemalloc的作者在pycon上的演講ppt

在上面的程式碼中,用到了pytracemalloc幾個核心的API:

pytracemalloc的一大好處就是可以隨時啟停,start函式即開始追蹤記憶體分配,相應的stop會停止追蹤。start函式有一個引數,nframes : 記憶體分配時記錄的棧的深度,這個值越大,pytracemalloc本身消耗的記憶體越多,在計算cumulative資料的時候有用。

返回值是擁有兩個元素的tuple,第一個元素是當前分配的記憶體,第二個元素是自記憶體追蹤啟動以來的記憶體峰值。

返回當前記憶體分配快照,返回值是Snapshot物件,該物件可以按照單個檔案、單行、單個呼叫棧統計記憶體分配情況

執行環境:windows 64位python3.4

如果將第36行的“lineno“改成“filename”,那麼結果如下

有了Profile結果之後,可以看出來在哪個檔案中有大量的記憶體分配。與效能優化相同,造成瓶頸的有兩種情況:單個物件佔用了大量的記憶體;同時大量存在的小物件。對於前者,優化的手段並不多,惰性初始化屬性可能有一些幫助;而對於後者,當同樣型別的物件大量存在時,可以使用slots進行優化。

Slots

預設情況下,自定義的物件都使用dict來儲存屬性(通過obj.__dict__檢視),而python中的dict大小一般比實際儲存的元素個數要大(以此降低hash衝突概率),因此會浪費一定的空間。在新式類中使用__slots__,就是告訴Python虛擬機器,這種型別的物件只會用到這些屬性,因此虛擬機器預留足夠的空間就行了,如果宣告瞭__slots__,那麼物件就不會再有__dict__屬性。

使用slots到底能帶來多少記憶體優化呢,首先看看這篇文章,對於一個只有三個屬性的Image類,使用__slots__之後記憶體從25.5G下降到16.2G,節省了9G的空間!

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到底能省多少,取決於類自身有多少屬性、屬性的型別,以及同時存在多少個類的例項。下面通過一段簡單程式碼測試一下:

上面的程式碼,主要是在每個例項的屬性數目、併發存在的例項數目兩個維度進行測試,並沒有測試不同的屬性型別。結果如下表:

百分比為記憶體優化百分比,計算公式為(b – a) / b, 其中b為沒有使用__slots__時分配的記憶體, a為使用了__slots__時分配的記憶體。

注意事項

關於__slots__,Python文件有非常詳盡的介紹,這裡只強調幾點注意事項

第一:基類和子類都必須__slots__,即使基類或者子類沒有屬性

從上面的示例可以看到,子類的物件還是有__dict__屬性,原因就在於基類沒有宣告__slots__。因此,可以通過看子類的例項有沒有__dict__屬性來判斷slots的使用是否正確

第二:子類會繼承基類的__slots__

更準確的說,如果訪問屬性的時候沒有在子類的__slots__找到,會繼續在基類的__slots__查詢,因為Python使用descriptor在類這個層級實現__slots__的,具體可以參見《python屬性查詢 深入理解》一文

objgraph

在大型工程中,怎麼排查有哪些大量存在的物件呢,畢竟同一個型別存在的物件越多,優化越有效果。除了直接看程式碼,最好使的就是使用objgraph.py的show_most_common_types(N)函式,該函式返回Python gc管理的所有物件中,數目前N多的物件,在排除掉python builtin物件之後,剩下的就是可優化的物件。比如在最上面的程式碼中:在最後加上這麼兩句:

輸出如下:

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再論Python dict

前面介紹slots的時候,就提到Python自定義的物件中通過dict來管理屬性。這種機制極大的提高了Python的靈活性 — 可以隨時給物件增加屬性,但是其實現機制也帶來了記憶體上的浪費。不管是python原始碼,還是Python程式,都大量使用了dict,因此這部分記憶體浪費不容小視。

python中的dict使用的是雜湊表(類似C++中的std::unordered_map),當計算出的hash值衝突的時候,採用開放地址法解決衝突(另一種常見的衝突解決演算法是連結串列法)。為了降低衝突概率,當裝填因子(實際儲存的元素與雜湊表長度的比值)超過2/3的時候就會對雜湊表進行擴容,因此雜湊表中一定會存在一些未使用的槽。

下面簡單看看PyDictObject的資料結構(python2.7.3 dictobject.h)

從定義可以看出,除了固定的部分(幾個Py_ssize_t),PyDictObject中主要是PyDictEntry物件,PyDictEntrty包含一個Py_ssize_t(int)和兩個指標。上面原始碼中的註釋(第26行)指出,當dict的元素比較少時,ma_table指向ma_smalltable,當元素增多時,ma_table會指向新申請的空間。ma_smalltable的作用在於Python(不管是原始碼還是程式碼)都大量使用dict,一般來說,儲存的元素也不會太多,因此Python就先開闢好PyDict_MINSIZE(預設為8)個空間。

為什麼說PyDictObject存在浪費呢,PyDictEntry在32位下也有12個位元組,那麼即使在ma_smalltable(ma_table)中大量的位置沒有被使用時,也要佔用這麼多位元組。用這篇文章中的例子:

假設有這麼一個dict:

在Python原始碼中的檢視就是這樣的:

然而,完全可以這麼儲存:

indices的作用類似ma_smalltable,但只儲存一個陣列的索引值,陣列只儲存實際存在的元素(PyDictEntry),當dict中的元素越稀疏,相比上一種儲存方式使用的記憶體越少。而且,這種實現, dict就是有序的(按插入時間排序)

這就是python3.6中新的dict實現,Compact dict! Stackoverflow上也有相關討論

總結

本文中介紹了Python記憶體優化的Profile工具,最有效的優化方法:使用slots,也介紹了在python3.6中新的dict實現。

當然,還有一些良好的編碼習慣。比如儘量使用immutable而不是mutable物件:使用tuple而不是list,使用frozenset而不是set;另外,就是儘量使用迭代器,比如python2.7中,使用xrange而不是range,dict的iterxx版本。

references

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