【大資料學習日記】Spark之shuffle調優

大資料dairy發表於2018-01-19

最近專案中用到shuffle調優相關內容,找了一些學習資源,整理成筆記分享給大家

問題:什麼是shuffle?

答案:每個Spark作業啟動執行的時候,首先Driver程式會將我們編寫的Spark作業程式碼分拆為多個stage,每個stage執行一部分程式碼片段,併為每個stage建立一批Task,然後將這些Task分配到各個Executor程式中執行。一個stage的所有Task都執行完畢之後,在各個executor節點上會產生大量的檔案,這些檔案會通過IO寫入磁碟(這些檔案存放的時候這個stage計算得到的中間結果),然後Driver就會排程執行下一個stage。下一個stage的Task的輸入資料就是上一個stage輸出的中間結果。如此迴圈往復,直到程式執行完畢,最終得到我們想要的結果。Spark是根據shuffle類運算元來進行stage的劃分。如果我們的程式碼中執行了某個shuffle類運算元(比如groupByKey、countByKey、reduceByKey、join等等)每當遇到這種型別的RDD運算元的時候,劃分出一個stage界限來。

問題:reduce oom

原因: reduce task 去map端獲取資料,reduce一邊拉取資料一邊聚合,reduce端有一塊聚合記憶體(executor memory * 0.2),也就是這塊記憶體不夠 方案: 1.增加reduce 聚合操作的記憶體的比例
2.增加Executor memory的大小 executor-memory 5G 3.減少reduce task每次拉取的資料量,設定spak.reducer.maxSizeInFlight 24m

問題:堆外記憶體不足

描述: shuffle file cannot find or executor lost

原因: 1.map task所執行的executor記憶體不足,導致executor 掛掉了,executor裡面的BlockManager就掛掉了,導致ConnectionManager不能用,也就無法建立連線,從而不能拉取資料。 2.executor並沒有掛掉,BlockManage之間的連線失敗(map task所執行的executor正在GC)建立連線成功,map task所執行的executor正在GC 3.reduce task向Driver中的MapOutputTracker獲取shuffle file位置的時候出現了問題

解決辦法: 1.增大Executor記憶體(即堆內記憶體) ,申請的堆外記憶體也會隨之增加--executor-memory 5G 2.增大堆外記憶體 --conf spark.yarn.executor.memoryoverhead 2048M--conf spark.executor.memoryoverhead 2048M (預設申請的堆外記憶體是Executor記憶體的10%,真正處理大資料的時候,這裡都會出現問題,導致spark作業反覆崩潰,無法執行;此時就會去調節這個引數,到至少1G(1024M),甚至說2G、4G)

問題:降低檔案個數

每個shuffle的前半部分stage的task都會建立出後半部分stage對應的task數量的檔案,然後每個task會有一個記憶體緩衝區,使用HashMap對值進行彙集

預設的shuffle流程圖

【大資料學習日記】Spark之shuffle調優
為了解決產生大量檔案的問題,我們可以在map端輸出的位置,將檔案進行合併操作,即使用spark.shuffle.consolidateFiles 引數來合併檔案 合併以後的情況,如下圖所示:

【大資料學習日記】Spark之shuffle調優

相關引數調優

spark.shuffle.file.buffer
預設值:32k
引數說明:該引數用於設定shuffle write task的BufferedOutputStream的buffer緩衝大小。將資料寫到磁碟檔案之前,會先寫入buffer緩衝中,待緩衝寫滿之後,才會溢寫到磁碟。
調優建議:如果作業可用的記憶體資源較為充足的話,可以適當增加這個引數的大小(比如64k),從而減少shuffle write過程中溢寫磁碟檔案的次數,也就可以減少磁碟IO次數,進而提升效能。在實踐中發現,合理調節該引數,效能會有1%~5%的提升。

spark.reducer.maxSizeInFlight
預設值:48m
引數說明:該引數用於設定shuffle read task的buffer緩衝大小,而這個buffer緩衝決定了每次能夠拉取多少資料。
調優建議:如果作業可用的記憶體資源較為充足的話,可以適當增加這個引數的大小(比如96m),從而減少拉取資料的次數,也就可以減少網路傳輸的次數,進而提升效能。在實踐中發現,合理調節該引數,效能會有1%~5%的提升。

spark.shuffle.io.maxRetries
預設值:3
引數說明:shuffle read task從shuffle write task所在節點拉取屬於自己的資料時,如果因為網路異常導致拉取失敗,是會自動進行重試的。該引數就代表了可以重試的最大次數。如果在指定次數之內拉取還是沒有成功,就可能會導致作業執行失敗。
調優建議:對於那些包含了特別耗時的shuffle操作的作業,建議增加重試最大次數(比如60次),以避免由於JVM的full gc或者網路不穩定等因素導致的資料拉取失敗。在實踐中發現,對於針對超大資料量(數十億~上百億)的shuffle過程,調節該引數可以大幅度提升穩定性。

spark.shuffle.io.retryWait
預設值:5s
引數說明:具體解釋同上,該引數代表了每次重試拉取資料的等待間隔,預設是5s。
調優建議:建議加大間隔時長(比如60s),以增加shuffle操作的穩定性。

spark.shuffle.memoryFraction
預設值:0.2
引數說明:該引數代表了Executor記憶體中,分配給shuffle read task進行聚合操作的記憶體比例,預設是20%。
調優建議:在資源引數調優中講解過這個引數。如果記憶體充足,而且很少使用持久化操作,建議調高這個比例,給shuffle read的聚合操作更多記憶體,以避免由於記憶體不足導致聚合過程中頻繁讀寫磁碟。在實踐中發現,合理調節該引數可以將效能提升10%左右。

spark.shuffle.manager
預設值:sort
引數說明:該引數用於設定ShuffleManager的型別。Spark 1.5以後,有三個可選項:hash、sort和tungsten-sort。HashShuffleManager是Spark 1.2以前的預設選項,但是Spark 1.2以及之後的版本預設都是SortShuffleManager了。tungsten-sort與sort類似,但是使用了tungsten計劃中的堆外記憶體管理機制,記憶體使用效率更高。
調優建議:由於SortShuffleManager預設會對資料進行排序,因此如果你的業務邏輯中需要該排序機制的話,則使用預設的SortShuffleManager就可以;而如果你的業務邏輯不需要對資料進行排序,那麼建議參考後面的幾個引數調優,通過bypass機制或優化的HashShuffleManager來避免排序操作,同時提供較好的磁碟讀寫效能。這裡要注意的是,tungsten-sort要慎用,因為之前發現了一些相應的bug。

spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold
預設值:200
引數說明:當ShuffleManager為SortShuffleManager時,如果shuffle read task的數量小於這個閾值(預設是200),則shuffle write過程中不會進行排序操作,而是直接按照未經優化的HashShuffleManager的方式去寫資料,但是最後會將每個task產生的所有臨時磁碟檔案都合併成一個檔案,並會建立單獨的索引檔案。
調優建議:當你使用SortShuffleManager時,如果的確不需要排序操作,那麼建議將這個引數調大一些,大於shuffle read task的數量。那麼此時就會自動啟用bypass機制,map-side就不會進行排序了,減少了排序的效能開銷。但是這種方式下,依然會產生大量的磁碟檔案,因此shuffle write效能有待提高。

spark.shuffle.consolidateFiles
預設值:false
引數說明:如果使用HashShuffleManager,該引數有效。如果設定為true,那麼就會開啟consolidate機制,會大幅度合併shuffle write的輸出檔案,對於shuffle read task數量特別多的情況下,這種方法可以極大地減少磁碟IO開銷,提升效能。
調優建議:如果的確不需要SortShuffleManager的排序機制,那麼除了使用bypass機制,還可以嘗試將spark.shffle.manager引數手動指定為hash,使用HashShuffleManager,同時開啟consolidate機制。在實踐中嘗試過,發現其效能比開啟了bypass機制的SortShuffleManager要高出10%~30%。
複製程式碼

參考 https://www.jianshu.com/p/069c37aad295

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