bam檔案出錯行(takes from 3 to 5 positional arguments but 6 were given）
程式碼
報錯
網上討論沒有根本解決方案。
自己追蹤問題
出錯檔案bam用samtools view 看
放大，有幾處列間粘連
換了一個樣本的bam檔案重新跑htseq-count還是報同樣的錯
用sed查詢了錯誤行和臨近行
各種檢視都沒有看出檔案行哪裡有不合理的地方，所以考慮軟體本身的問題。
試過了重灌conda中的htseq，python都沒能解決。最後還是放棄了conda環境直接在外部安裝htseq （用的pip安裝）進行同樣的測試，可以正常讀入bam檔案不再報錯。折騰下來算是解決了，教訓是conda安裝軟體也有坑，遇到問題趕緊在外部環境試試。總的來說導致報錯的原因在於htseq不同版本和所處環境。
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